| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | REL606 | 1,733,297 | (CGTATGAA)1→2 | coding (333/1413 nt) | pykF → | pyruvate kinase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 1733288 = | 9 (0.170) | 65 (1.280) | 49/146 | 0.1 | 90.4% | coding (324/1413 nt) | pykF | pyruvate kinase |
| ? | REL606 | = 1733295 | 5 (0.100) | coding (331/1413 nt) | pykF | pyruvate kinase | |||||
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
AAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACC > REL606/1733220‑1733369 | tcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgtatg > 2:564628‑M1/69‑76 (MQ=255)aaaGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATg > 1:31011/1‑76 (MQ=255)aaaGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATg < 1:121841/76‑1 (MQ=255) aaGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGa < 1:1420898‑M2/76‑2 (MQ=255) agacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgtatgaa < 2:132096‑M1/10‑1 (MQ=255) gCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaac < 2:1401208‑M2/76‑4 (MQ=255) cTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacg < 2:1297683‑M2/76‑5 (MQ=255) ctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGtt > 2:904868‑M1/63‑76 (MQ=255) tttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGttt < 1:487139‑M1/15‑1 (MQ=255) ttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTc > 2:868163‑M1/61‑76 (MQ=255) ttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTc < 2:949007‑M1/16‑1 (MQ=255) ttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTc < 1:648345‑M1/16‑1 (MQ=255) tCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatg > 2:564628‑M2/1‑68 (MQ=255) tCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatg < 2:191147‑M2/76‑9 (MQ=255) tCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatg > 1:556369‑M2/1‑68 (MQ=255) aGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaa < 2:132096‑M2/76‑11 (MQ=255) ctttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCact > 1:192185‑M1/58‑76 (MQ=255) ttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCactac > 1:591985‑M1/56‑76 (MQ=255) ttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCactac > 2:104919‑M1/56‑76 (MQ=255) ccTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggt < 1:340614‑M2/76‑14 (MQ=255) tcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCactact > 1:499893‑M1/55‑76 (MQ=255) tcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCactact > 2:964439‑M1/55‑76 (MQ=255) tcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCactact > 1:1291314‑M1/55‑76 (MQ=255) cTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtt > 1:61346‑M2/1‑62 (MQ=255) cTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtt > 2:904868‑M2/1‑62 (MQ=255) tttACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggttt < 1:487139‑M2/76‑16 (MQ=255) ttACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttc > 2:868166‑M2/1‑60 (MQ=255) ttACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttc < 1:972190‑M2/76‑17 (MQ=255) ttACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttc < 1:1102127‑M2/76‑17 (MQ=255) ttACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttc < 1:648345‑M2/76‑17 (MQ=255) ttACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttc > 2:1585106‑M2/1‑60 (MQ=255) ttACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttc > 1:1319451‑M2/1‑60 (MQ=255) ttACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttc > 2:868163‑M2/1‑60 (MQ=255) accactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGa < 2:1458706‑M1/24‑1 (MQ=255) cTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcact > 1:192185‑M2/1‑57 (MQ=255) ctgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctg < 1:372610‑M1/28‑1 (MQ=255) ttCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactac > 2:104919‑M2/1‑55 (MQ=255) ttCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactac > 1:591985‑M2/1‑55 (MQ=255) tCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactact > 2:964439‑M2/1‑54 (MQ=255) tCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactact > 1:499893‑M2/1‑54 (MQ=255) tCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactact > 1:1291314‑M2/1‑54 (MQ=255) taaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctgtctg < 1:955‑M1/32‑1 (MQ=255) accacTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactga < 2:1458706‑M2/76‑25 (MQ=255) atctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTg < 2:1231398‑M1/35‑1 (MQ=255) cTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctg < 1:372610‑M2/76‑29 (MQ=255) cTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctg > 1:1064647‑M2/1‑48 (MQ=255) ctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGc < 1:363681‑M1/37‑1 (MQ=255) tgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCa < 2:1576058‑M1/38‑1 (MQ=255) tgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGGTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCa < 1:1098544‑M1/38‑1 (MQ=255) gttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCaa < 1:1018994‑M1/39‑1 (MQ=255) aaTCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgtt > 1:1462747‑M2/1‑42 (MQ=255) ggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGt > 1:1389884‑M1/32‑76 (MQ=255) ggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGt > 1:231299‑M1/32‑76 (MQ=255) ggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGt > 1:490958‑M1/32‑76 (MQ=255) tGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggca < 2:1576058‑M2/76‑39 (MQ=255) tGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaagggttcactactgacctgtctgttggca < 1:1098544‑M2/76‑39 (MQ=255) gcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTa > 1:964503‑M1/31‑76 (MQ=255) gTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaa < 1:1018994‑M2/76‑40 (MQ=255) caacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTAc > 2:14960‑M1/30‑76 (MQ=255) ttATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaac < 2:430026‑M2/76‑41 (MQ=255) acagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTg < 2:275203‑M1/49‑1 (MQ=255) tCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactagtgacctgtctgttcgcaacacc < 2:590989‑M2/76‑44 (MQ=255) tCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacacc > 2:1367482‑M2/1‑33 (MQ=255) agcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGt < 2:873502‑M1/51‑1 (MQ=255) ggCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgt > 1:1389884‑M2/1‑31 (MQ=255) gaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGa > 2:1642557‑M1/23‑76 (MQ=255) gCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgta > 1:964503‑M2/1‑30 (MQ=255) gCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgta < 1:740764‑M2/76‑47 (MQ=255) cAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtac > 2:14960‑M2/1‑29 (MQ=255) aaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGAc < 2:533346‑M1/55‑1 (MQ=255) aaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGAc > 1:721313‑M1/22‑76 (MQ=255) aaCAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtact < 2:816079‑M2/76‑49 (MQ=255) aCAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactg < 2:275203‑M2/76‑50 (MQ=255) ggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATg > 2:1545245‑M1/18‑76 (MQ=255) aGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggt > 1:1660701‑M2/1‑25 (MQ=255) gttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATgg > 1:1640970‑M1/17‑76 (MQ=255) gCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggtt < 2:1361026‑M2/76‑53 (MQ=255) gAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttga > 2:1642557‑M2/1‑22 (MQ=255) gcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCt > 1:4348‑M1/14‑76 (MQ=255) aaaTGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgac > 1:721313‑M2/1‑21 (MQ=255) 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AACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGaa < 2:498880‑M1/76‑1 (MQ=255) acgtatgaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatcgg > 2:113004‑M2/1‑7 (MQ=255) ACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAg < 1:970027‑M1/76‑1 (MQ=255) gtatgaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatcggta < 2:16562‑M2/76‑72 (MQ=255) gtatgaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatcggta < 1:221714‑M2/76‑72 (MQ=255) gtatgaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatcggta < 2:1365271‑M2/76‑72 (MQ=255) atgaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatcggtatg < 1:831415‑M2/76‑74 (MQ=255) aTGGAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGCATGGAAGTTAc > 1:1138304/1‑76 (MQ=255) aTGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTAc > 2:806974/1‑76 (MQ=255) aTGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTAc > 2:751421/1‑76 (MQ=255) tGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTAcc < 1:1006298/76‑1 (MQ=255) | AAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACC > REL606/1733220‑1733369 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |