| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 1520237 = | 81 (1.450) | 4 (0.090) | 3/118 | 5.7 | 5.7% | intergenic (‑58/+201) | yddL/yddG | predicted lipoprotein/predicted methyl viologen efflux pump |
| ? | REL606 | 1520253 = | 69 (1.580) | intergenic (‑74/+185) | yddL/yddG | predicted lipoprotein/predicted methyl viologen efflux pump | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTG > REL606/1520180‑1520328 | ttAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATa > 2:719757/1‑76 (MQ=255)ttAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATa < 1:299719/76‑1 (MQ=255) tAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATAc > 2:230410/1‑76 (MQ=255) tAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATAc > 1:742483/1‑76 (MQ=255) tAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATAc > 1:209240/1‑76 (MQ=255) aaCAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACt > 1:195373/1‑76 (MQ=255) cAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGt > 2:447201/1‑76 (MQ=255) gAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGttt < 2:1658940/76‑1 (MQ=255) gAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGttt < 1:1594811/76‑1 (MQ=255) gAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGttt < 1:373056/76‑1 (MQ=255) gAATCCGTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGttt < 2:365041/76‑1 (MQ=255) aaTCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGtttt > 2:555559/1‑76 (MQ=255) aaTCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGtttt < 2:1015013/76‑1 (MQ=255) aTCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGttttt < 2:769567/76‑1 (MQ=255) aTCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGttttt < 1:1628075/76‑1 (MQ=255) ttttAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTaaaa > 1:1159159/1‑76 (MQ=255) tAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGCCATACTGTTTTTAAAATAg > 2:463865/1‑76 (MQ=255) tAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAg > 2:463879/1‑76 (MQ=255) aaTTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGa > 1:1285763/1‑76 (MQ=255) aaTTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGa > 1:571796/1‑76 (MQ=255) aaTTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGa < 1:407967/76‑1 (MQ=255) aTTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGaa > 1:438513/1‑76 (MQ=255) ttATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAAt > 2:341391/1‑76 (MQ=255) ttATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAAt > 2:546890/1‑76 (MQ=255) ttATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAAt > 2:1701761/1‑76 (MQ=255) ttATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAAt > 2:839927/1‑76 (MQ=255) tATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATg > 1:775676/1‑76 (MQ=255) tATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATg > 2:1160065/1‑76 (MQ=255) aTCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATgg > 1:1387206/1‑76 (MQ=255) aTCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATgg > 1:1780009/1‑76 (MQ=255) aTCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATgg > 1:1735084/1‑76 (MQ=255) gTTTAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGa > 2:1364904/1‑76 (MQ=255) ttAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGAt > 2:844154/1‑76 (MQ=255) ttAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGAt > 2:1655968/1‑76 (MQ=255) tAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGAtt > 2:916358/1‑76 (MQ=255) tAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGAtt < 1:1152859/76‑1 (MQ=255) aaaCGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGAtca < 2:794972/76‑3 (MQ=255) aaaCGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTa < 2:629350/76‑1 (MQ=255) aaaCGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTa < 1:117516/76‑1 (MQ=255) aaaCGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTa > 1:734966/1‑76 (MQ=255) aaaCGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTa < 2:794952/76‑1 (MQ=255) aaaCGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTa > 1:295967/1‑76 (MQ=255) aaaCGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTa < 2:268772/76‑1 (MQ=255) gTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTaaaaa > 2:1417239/1‑76 (MQ=255) tATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAAc < 1:1568491/76‑1 (MQ=255) tATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAAc < 1:1568508/76‑1 (MQ=255) ttCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATg < 2:584166/76‑1 (MQ=255) cTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATgag > 1:388697/1‑76 (MQ=255) cTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATgag > 1:312378/1‑76 (MQ=255) cTAAACGAATTTTAAACGGCGGCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATgag > 1:1485463/1‑76 (MQ=255) aaaCGAATTTTAAACTTCGTCATTTCTATATCACATACTTTTCTTAAAATATAATCGCGATTAAAAACAATGAGaa > 2:355947/1‑76 (MQ=255) aaaCGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGaa > 2:834985/1‑76 (MQ=255) aaaCGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGaa < 2:259639/76‑1 (MQ=255) aaaCGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGaa > 1:657111/1‑76 (MQ=255) aaaCGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGaa > 2:1544531/1‑76 (MQ=255) aaaCGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGaa < 1:99472/76‑1 (MQ=255) aaCGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGaaa < 2:653585/76‑1 (MQ=255) aaCGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGaaa < 2:653603/76‑1 (MQ=255) gAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAAt < 1:982558/76‑1 (MQ=255) aaTTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATa > 2:134714/1‑76 (MQ=255) aTTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAg < 2:1334525/76‑1 (MQ=255) aTTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAg < 2:311748/76‑1 (MQ=255) ttAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATg < 1:128011/76‑1 (MQ=255) tAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGa < 1:1340400/76‑1 (MQ=255) tAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGa < 1:1598584/76‑1 (MQ=255) tAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGa < 1:344314/76‑1 (MQ=255) cGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAaata < 1:72915/76‑1 (MQ=255) cGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAaata > 2:246555/1‑76 (MQ=255) ggCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAaataa > 1:217952/1‑76 (MQ=255) aTACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATAtgtg < 1:391811/76‑1 (MQ=255) | TTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTG > REL606/1520180‑1520328 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |