| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 3022275 = | 81 (1.640) | 9 (0.190) | 5/140 | 5.2 | 9.7% | coding (410/1140 nt) | ECB_02821 | hypothetical protein |
| ? | REL606 | 3022861 = | 92 (1.990) | intergenic (‑177/+397) | ECB_02821/ECB_02822 | hypothetical protein/bifunctional Ribulose 5‑phosphate reductase/CDP‑ribitol pyrophosphorylase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TATCTTTAACAATTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCTAAATGAAAT > REL606/3022787‑3022936 | tATCTTTAACAATTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCtt < 2:1361624/76‑1 (MQ=255)tATCTTTAACAATTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCtt < 1:1256092/76‑1 (MQ=255) aTCTTTAACAATTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTa > 1:1076216/1‑76 (MQ=255) aTCTTTAACAATTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTa < 1:833827/76‑1 (MQ=255) aTCTTTAACAATTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTa < 1:833847/76‑1 (MQ=255) tCTTTAACAATTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTAt > 1:1116901/1‑76 (MQ=255) tCTTTAACAATTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTAt > 1:1116918/1‑76 (MQ=255) tCTTTAACAATTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTAt > 2:475016/1‑76 (MQ=255) cTTTAACAATTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTAtt < 1:1485976/76‑1 (MQ=255) cTTTAACAATTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTAtt < 1:318149/76‑1 (MQ=255) cTTTAACAATTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTAtt < 1:318161/76‑1 (MQ=255) tttAACAATTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTc < 1:276265/76‑1 (MQ=255) tttAACAATTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTc < 1:276266/76‑1 (MQ=255) ttAACAATTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCACTTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCt > 1:707931/1‑76 (MQ=255) ttAACAATTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCt > 1:1294455/1‑76 (MQ=255) ttAACAATTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCt > 1:847463/1‑76 (MQ=255) ttAACAATTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCt > 1:1298088/1‑76 (MQ=255) tAACAATTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCtt < 2:486710/76‑1 (MQ=255) aCAATTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTtaa < 2:370747/76‑1 (MQ=255) ttATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATaaa < 2:51296/76‑1 (MQ=255) tataAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATaaaa < 2:138176/76‑1 (MQ=255) tataAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATaaaa < 1:859407/76‑1 (MQ=255) tataAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTAAATaaaa < 1:115092/76‑1 (MQ=255) ataAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATaaaaa > 1:347327/1‑76 (MQ=255) ataAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATaaaaa > 1:347324/1‑76 (MQ=255) ataAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATaaaaa < 1:210667/76‑1 (MQ=255) ataAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTACTCTTAATaaaaa > 1:608289/1‑76 (MQ=255) taAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATaaaaan < 1:78578/76‑2 (MQ=255) taAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATaaaaaa < 1:9044/76‑1 (MQ=255) taAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATaaaaaa < 1:9051/76‑1 (MQ=255) taAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATaaaaaa > 2:539705/1‑76 (MQ=255) aaaaaCACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAAt < 1:771164/76‑1 (MQ=255) aaaaaCACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAAt < 1:1264/76‑1 (MQ=255) aaaaCACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATaaaaaacg < 1:429482/76‑3 (MQ=255) aaaaCACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATg < 1:142187/76‑1 (MQ=255) aaaaCACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATg < 1:429494/76‑1 (MQ=255) cacaAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAGAATCTTATTCTTAATAAAAAATgtagt < 1:1169605/76‑1 (MQ=255) cacaAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATgtagt < 1:1588591/76‑1 (MQ=255) cacaAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATgtagt > 1:711825/1‑76 (MQ=255) cacaAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATgtagt > 2:1213967/1‑76 (MQ=255) acaAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATgtagta < 1:735470/76‑1 (MQ=255) acaAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATgtagta > 2:1582367/1‑76 (MQ=255) aaaCCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTaaa < 1:901879/76‑1 (MQ=255) aaaCCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTaaa < 1:901866/76‑1 (MQ=255) aaCCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTaaaa < 1:361069/76‑1 (MQ=255) aCCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAAt < 2:1473825/76‑1 (MQ=255) aCCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAAt < 1:847145/76‑1 (MQ=255) ccAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATc > 1:1365073/1‑76 (MQ=255) ccAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATATAGTAAAATc < 2:1470948/76‑1 (MQ=255) cAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTATTAAAATCt < 1:1037229/76‑1 (MQ=255) cAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCt < 1:1037214/76‑1 (MQ=255) aaTAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCtt < 1:734681/76‑1 (MQ=255) aaTAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCtt > 2:828299/1‑76 (MQ=255) aaTAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATCCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCtt < 2:1140363/76‑1 (MQ=255) aTAGCTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTg < 1:543497/76‑1 (MQ=255) aTAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTg < 1:148214/76‑1 (MQ=255) tAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGt > 2:1106102/1‑76 (MQ=255) aCTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTaa < 2:537845/76‑1 (MQ=255) cTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTaaa > 2:695589/1‑76 (MQ=255) tATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTaaaa > 1:1039093/1‑76 (MQ=255) tATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTaaaa < 1:781149/76‑1 (MQ=255) tGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAaaataaa < 1:399741/76‑1 (MQ=255) gCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAaaataaat > 1:1345099/1‑76 (MQ=255) aaTTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAAttt > 1:408980/1‑76 (MQ=255) aTTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTta < 2:1247622/76‑1 (MQ=255) tttATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTtat > 1:1367441/1‑76 (MQ=255) ttATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTtata < 2:39375/76‑1 (MQ=255) ttATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTtata < 1:235081/76‑1 (MQ=255) ttATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTtata > 1:701358/1‑76 (MQ=255) ttATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTtata < 1:102620/76‑1 (MQ=255) tATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATaa > 1:501199/1‑76 (MQ=255) cTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGc < 2:1223243/76‑1 (MQ=255) ggAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCtt < 1:1211712/76‑1 (MQ=255) aGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTa < 2:28686/76‑1 (MQ=255) aGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTa < 2:28674/76‑1 (MQ=255) aGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTa < 2:134477/76‑1 (MQ=255) aGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTa < 2:134470/76‑1 (MQ=255) gCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTAt < 1:1430055/76‑1 (MQ=255) gCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTAt < 2:1158417/76‑1 (MQ=255) cAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATg < 1:180696/76‑1 (MQ=255) aTGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGa > 1:66519/1‑76 (MQ=255) gCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGaaa < 2:361083/76‑1 (MQ=255) cTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGaaaa < 1:1309103/76‑1 (MQ=255) cTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGaaaa < 1:1309111/76‑1 (MQ=255) aTTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAAcc > 1:1398016/1‑76 (MQ=255) aTTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAAcc > 1:293471/1‑76 (MQ=255) aTTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAAcc > 1:1398021/1‑76 (MQ=255) aTTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAAcc > 1:1081728/1‑76 (MQ=255) tttAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCt < 2:523512/76‑1 (MQ=255) tttAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCt > 2:57483/1‑76 (MQ=255) aaaaTCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCTaaa > 1:364487/1‑76 (MQ=255) aaaaTCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCTaaa > 1:651776/1‑76 (MQ=255) aaTCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCTAAATg < 1:492348/76‑1 (MQ=255) aTCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCTAAATGa < 1:1366669/76‑1 (MQ=255) aTCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCTAAATGa < 1:429375/76‑1 (MQ=255) tCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCTAAATGaa < 1:1115534/76‑1 (MQ=255) cTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCTAAATGaaa > 1:1339484/1‑76 (MQ=255) cTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCTAAATGaaa > 1:478420/1‑76 (MQ=255) ttATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCTAAATGAAat < 1:1467520/76‑1 (MQ=255) | TATCTTTAACAATTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCTAAATGAAAT > REL606/3022787‑3022936 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |