| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 1519016 | 76 (1.460) | 12 (0.250) | 6/138 | 4.7 | 15.9% | coding (850/957 nt) | yddK | hypothetical protein |
| ? | REL606 | = 1519475 | 57 (1.200) | coding (391/957 nt) | yddK | hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
AAGTTCCAATATCGGATGTATTATTAGTATCAATGTGGGTTATTTTATTATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTATATATTTCAACTGGTTGTTAGCAGCGTTTAATGTCTGAACATTGCA > REL606/1518941‑1519091 | aaGTTCCAATATCGGATTTATTATTAGTATCAATGTGGGTTATTTTATTATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGa < 1:806252/76‑1 (MQ=255) cAATATCGGATGTATTATTAGTATCAATGTGGGTTATTTTATTATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAg > 2:268456/1‑76 (MQ=255) aaTATCGGATGTATTATTAGTATCAATGTGGGTTATTTTATTATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGa < 1:1488847/76‑1 (MQ=255) aaTATCGGATGTATTATTAGTATCAATGTGGGTTATTTTATTATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGa < 1:460193/76‑1 (MQ=255) atatCGGATGTATTATTAGTATCAATGTGGGTTATTTTATTATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGAt < 2:597764/76‑1 (MQ=255) tatCGGATGTATTATTAGTATCAATGTGGGTTATTTTATTATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATa > 1:309424/1‑76 (MQ=255) atCGGATGTATTATTAGTATCAATGTGGGTTATTTTATTATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATaa < 1:1159961/76‑1 (MQ=255) atCGGATGTATTATTAGTATCAATGTGGGTTATTTTATTATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATaa > 2:1648615/1‑76 (MQ=255) atCGGATGTATTATTAGTATCAATGTGGGTTATTTTATTATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATaa > 1:1237652/1‑76 (MQ=255) tCGGATGTATTATTAGTATCAATGTGGGTTATTTTATTATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAg < 1:176905/76‑1 (MQ=255) ggATGTATTATTAGTATCAATGTGGGTTATTTTATTATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTc > 2:1072888/1‑76 (MQ=255) ggATGTATTATTAGTATCAATGTGGGTTATTTTATTATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTc < 1:1340233/76‑1 (MQ=255) gATGTATTATTAGTATCAATGTGGGTTATTTTATTATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCa < 1:586136/76‑1 (MQ=255) tGTATTATTAGTATCAATGTGGGTTATTTTATTATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAgg > 1:528897/1‑76 (MQ=255) tGTATTATTAGTATCAATGTGGGTTATTTTATTATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAgg < 2:1246144/76‑1 (MQ=255) tGTATTATTAGTATCAATGTGGGTTATTTTATTATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAgg > 1:231872/1‑76 (MQ=255) tGTATTATTAGTATCAATGTGGGTTATTTTATTATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAgg > 1:11046/1‑76 (MQ=255) tattatTAGTATCAATGTGGGTTATTTTATTATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGaa < 1:744340/76‑1 (MQ=255) tattaGTATCAATGTGGGTTATTTTATTATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATc > 1:806540/1‑76 (MQ=255) ttaGTATCAATGTGGGTTATTTTATTATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGCTAAGTCAGGCAATCaa > 1:372044/1‑76 (MQ=255) ttaGTATCAATGTGGGTTATTTTATTATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCaa < 1:96397/76‑1 (MQ=255) ttaGTATCAATGTGGGTTATTTTATTATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCaa > 1:863292/1‑76 (MQ=255) taGTATCAATGTGGGTTATTTTATTATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAg > 1:16443/1‑76 (MQ=255) aGTATCAATGTGGGTTATTTTATTATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGa > 2:1265011/1‑76 (MQ=255) tATCAATGTGGGTTATTTTATTATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGAtt > 2:275130/1‑76 (MQ=255) tATCAATGTGGGTTATTTTATTATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGAtt < 1:1198108/76‑1 (MQ=255) tATCAATGTGGGTTATTTTATTATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGAtt < 1:1198106/76‑1 (MQ=255) tCAATGTGGGTTATTTTATTATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTta < 1:596834/76‑1 (MQ=255) cAATGTGGGTTATTTTATTATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTtat > 2:1323455/1‑76 (MQ=255) cAATGTGGGTTATTTTATTATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTtat > 2:69133/1‑76 (MQ=255) aTGTGGGTTATTTTATTATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTtatat < 2:151582/76‑1 (MQ=255) tgtgGGTTATTTTATTATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTtatata < 2:1429421/76‑1 (MQ=255) tgtgGGTTATTTTATTATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTtatata < 2:1568653/76‑1 (MQ=255) gtgGGTTATTTTATTATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTatatat > 1:1657577/1‑76 (MQ=255) gtgGGTTATTTTATTATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTatatat > 2:1632563/1‑76 (MQ=255) gtgGGTTATTTTATTATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTatatat < 2:586667/76‑1 (MQ=255) gTTATTTTATTATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTATATATTTCa < 2:738776/76‑1 (MQ=255) ttattttattATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGACGATAAGTCAGGACATCAAGATTTATATATTTCaa > 1:116058/1‑76 (MQ=255) ttattttattATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTATATATTTCaa > 1:1463470/1‑76 (MQ=255) ttattttattATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTATATATTTCaa > 1:678731/1‑76 (MQ=255) ttattttattATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTATATATCTCac > 1:1223167/1‑75 (MQ=255) attttattATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGGAGATATGTCAGGAAACAATGATTTATATATTTCATCt > 1:1219857/1‑76 (MQ=255) attttattATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGCAATCAAGATTTATATATTTCAACt > 1:540877/1‑76 (MQ=255) attttattATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTATATATTTCAACt > 1:1219848/1‑76 (MQ=255) attttattATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTATATATTTCAACt > 1:540865/1‑76 (MQ=255) attttattATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTATATATTTCAACt > 2:1259330/1‑76 (MQ=255) ttttattATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTATATATTTCAACTg > 1:1320780/1‑76 (MQ=255) ttttattATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTATATATTTCAACTg > 1:1595343/1‑76 (MQ=255) tttattATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTATATATTTCAACTgg > 1:1589711/1‑76 (MQ=255) ttattaTTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTATATATTTCAACTGgt > 2:176965/1‑76 (MQ=255) ttattaTTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTATATATTTCAACTGgt > 1:173015/1‑76 (MQ=255) attattGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTATATATTTCAACTGgttg > 1:326510/1‑76 (MQ=255) attattGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTATATATTTCAACTGgttg > 1:689164/1‑76 (MQ=255) ttattGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTATATATTTCAACTGgttgt > 1:1443681/1‑76 (MQ=255) ttattGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTATATATTTCAACTGgttgt > 2:1051222/1‑76 (MQ=255) ttattGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTATATATTTCAACTGgttgt > 1:110029/1‑76 (MQ=255) tattGTCTAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGGAATCAAGATTTATATATTTCAACTGgttgtt > 1:912532/1‑76 (MQ=255) tattGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTATATATTTCAACTGgttgtt > 1:868536/1‑76 (MQ=255) ttGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTATATATTTCAACTGGTTGTTag < 2:205643/76‑1 (MQ=255) ttGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTATATATTTCAACTGGTTGTTag < 1:217938/76‑1 (MQ=255) ttGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTATATATTTCAACTGGTTGTTag > 1:1229556/1‑76 (MQ=255) tGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTATATATTTCAACTGGTTGTTagc > 1:1358436/1‑76 (MQ=255) tGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTATATATTTCAACTGGTTGTTagc > 1:719091/1‑76 (MQ=255) tGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTATATATTTCAACTGGTTGTTagc < 2:627158/76‑1 (MQ=255) tCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTATATATTTCAACTGGTTGTTagcag > 2:1348882/1‑76 (MQ=255) ccAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTATATATTTCAACTGGTTGTTagcagc > 2:1542120/1‑76 (MQ=255) ttAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTATATATTTCAACTGGTTGTTAGCAGCGTTTaa > 2:679221/1‑76 (MQ=255) aaCTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTATATATTTCAACTGGTTGTTAGCAGCGTTTAATGt < 1:1049115/76‑1 (MQ=255) ttGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTATATATTTCAACTGGTTGTTAGCAGCGTTTAATGTCTGaa > 1:1248412/1‑76 (MQ=255) ngATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTATATATTTCAACTGGTTGTTAGCAGCGTTTAATGTCTGAAc > 1:1313039/2‑76 (MQ=255) aTAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTATATATTTCAACTGGTTGTTAGCAGCGTTTAATGTCTGAACAt > 1:127199/1‑76 (MQ=255) aGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTATATATTTCAACTGGTTGTTAGCAGCGTTTAATGTCTGAACATTg < 1:1023687/76‑1 (MQ=255) aTGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTATATATTTCAACTGGTTGTTAGCAGCGTTTACTGTCTGAACATTGCa > 1:481809/1‑76 (MQ=255) aTGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTATATATTTCAACTGGTTGTTAGCAGCGTTTAATGTCTGAACATTGCa < 1:854431/76‑1 (MQ=255) aTGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTATATATTTCAACTGGTTGTTAGCAGCGTTTAATGTCTGAACATTGCa > 1:222574/1‑76 (MQ=255) aTGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTATATATTTCAACTGGTTGTTAGCAGCGTTTAATGTCTGAACATTGCa > 1:222594/1‑76 (MQ=255) aTGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTATATATTTCAACTGGTTGTTAGCAGCGTTTAATGTCTGAACATTGCa > 1:481789/1‑76 (MQ=255) | AAGTTCCAATATCGGATGTATTATTAGTATCAATGTGGGTTATTTTATTATTGTCCAGTCTTAAACTTTTGATAGATGGAAGATAAGTCAGGAAATCAAGATTTATATATTTCAACTGGTTGTTAGCAGCGTTTAATGTCTGAACATTGCA > REL606/1518941‑1519091 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |