| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 3022200 = | 38 (0.730) | 8 (0.160) | 7/142 | 4.4 | 15.2% | coding (485/1140 nt) | ECB_02821 | hypothetical protein |
| ? | REL606 | 3022657 = | 53 (1.080) | coding (28/1140 nt) | ECB_02821 | hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTATTT > REL606/3022585‑3022730 | tGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCtatatatat > 1:953468/1‑76 (MQ=255)tGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCtatatatat > 1:953486/1‑76 (MQ=255) ttattaAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCtatatatatat > 1:809508/1‑76 (MQ=255) ttaAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATatataat < 2:699345/76‑1 (MQ=255) ttaAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATatataat > 1:395287/1‑76 (MQ=255) ttaAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATatataat > 1:395303/1‑76 (MQ=255) taAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATatataata > 1:275071/1‑76 (MQ=255) taAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATatataata < 1:1251347/76‑1 (MQ=255) aaaTACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATatataatat < 1:574488/76‑1 (MQ=255) aaaTACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATatataatat < 1:1457090/76‑1 (MQ=255) aCTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGc < 1:157385/76‑1 (MQ=255) aCTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGc < 1:157391/76‑1 (MQ=255) tgtgATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCtat < 1:1357847/76‑1 (MQ=255) gATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCtattat < 1:1273773/76‑1 (MQ=255) aTTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTattatt > 1:1434383/1‑76 (MQ=255) gAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGa < 1:424993/76‑1 (MQ=255) gAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGa > 1:938130/1‑76 (MQ=255) aaaGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGAc > 2:349910/1‑76 (MQ=255) aaaGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGAc > 1:1515342/1‑76 (MQ=255) tAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATaa < 2:498515/76‑1 (MQ=255) aaCGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAAt < 1:1082643/76‑1 (MQ=255) aCGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATg < 1:1614871/76‑1 (MQ=255) aCGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATg > 1:1132382/1‑76 (MQ=255) aCGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATg < 1:600630/76‑1 (MQ=255) gAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTa < 1:226068/76‑1 (MQ=255) aaGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGcc > 1:23927/1‑76 (MQ=255) aGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGccc > 1:1178415/1‑76 (MQ=255) tCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGta > 1:964802/1‑76 (MQ=255) tCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTCGta > 1:720402/1‑76 (MQ=255) aTGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGtattta < 2:1636340/76‑1 (MQ=255) cACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTg > 1:875414/1‑76 (MQ=255) cACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTg < 2:390889/76‑1 (MQ=255) ccTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTc > 1:432763/1‑76 (MQ=255) ccTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTc > 1:1456366/1‑76 (MQ=255) ccTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTc > 1:1488649/1‑76 (MQ=255) ccTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTc > 1:1456387/1‑76 (MQ=255) cTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCa > 1:113258/1‑76 (MQ=255) ttttATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCat > 1:73881/1‑76 (MQ=255) ttATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCatat > 1:632815/1‑76 (MQ=255) tATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCGCCGTGTATTTATTGACATAtt > 2:86404/1‑76 (MQ=255) aTCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTa < 2:1468725/76‑1 (MQ=255) tATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCta < 2:361353/76‑1 (MQ=255) aTCTTTATATTTATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAATATCtat > 2:939014/1‑76 (MQ=255) aTCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCtat < 1:996028/76‑1 (MQ=255) aTCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCtat > 2:1377163/1‑76 (MQ=255) aTCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCCTTTATTTTTTTTCATATTTAAATCtat > 1:938995/1‑76 (MQ=255) tCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCtatt > 2:334058/1‑76 (MQ=255) tCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGCCATATTAACATCtatt > 2:334051/1‑76 (MQ=255) cTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCtattt < 2:985971/76‑1 (MQ=255) cTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCtattt < 2:606606/76‑1 (MQ=255) cTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCtattt < 2:593556/76‑1 (MQ=255) cTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCtattt > 1:178024/1‑76 (MQ=255) cTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCtattt < 2:120592/76‑1 (MQ=255) tatatatataATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCtatttatt < 1:1593374/76‑1 (MQ=255) atatatataATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTatttattt < 2:478699/76‑1 (MQ=255) atatatataATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTatttattt > 1:1442651/1‑76 (MQ=255) atatatataATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTatttattt < 2:478691/76‑1 (MQ=255) atatatataATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTatttattt > 2:1554244/1‑76 (MQ=255) atatatataATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTatttattt > 2:1554223/1‑76 (MQ=255) | TGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGTCATATTAACATCTATTTATTT > REL606/3022585‑3022730 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |