| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | REL606 | 1,733,297 | (CGTATGAA)1→2 | coding (333/1413 nt) | pykF → | pyruvate kinase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 1733288 = | 9 (0.140) | 61 (0.990) | 44/146 | 0.3 | 88.6% | coding (324/1413 nt) | pykF | pyruvate kinase |
| ? | REL606 | = 1733295 | 7 (0.110) | coding (331/1413 nt) | pykF | pyruvate kinase | |||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
AAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCG > REL606/1733220‑1733370 | aaaaCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGACATGGTTGCGGTAACGCATg > 2:1999415/1‑76 (MQ=255) aganctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacaccgaaatggttgcggtaacgtatgaacgtatgaa < 1:1829802‑M1/10‑1 (MQ=255) agacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggctgcggtaacgtatgaacgtatgaa < 2:1933267‑M1/10‑1 (MQ=255) cTGGACAGACCTATACTTTCAGCACTGATAAATCTGTTGTCGGCACCAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacg > 1:1705687‑M2/1‑72 (MQ=255) tGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgt < 1:1190060‑M2/76‑6 (MQ=255) tGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgt < 1:787550‑M2/76‑6 (MQ=255) cctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGt < 1:561919‑M1/13‑1 (MQ=255) cctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGAATGAAGGt > 2:1399360‑M1/64‑76 (MQ=255) ggTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgta < 1:1490018‑M2/76‑7 (MQ=255) ctttactttcaccattgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACTTATGAAGGtt > 1:158513‑M1/63‑76 (MQ=255) ctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGtt > 2:1458643‑M1/63‑76 (MQ=255) ttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTc > 2:1864382‑M1/61‑76 (MQ=255) aGANCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACACCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaa < 1:1829802‑M2/76‑11 (MQ=255) aGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGCTGCGGTAACGTATGaacgtatgaa < 2:1933267‑M2/76‑11 (MQ=255) ctttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCact < 1:1437415‑M1/19‑1 (MQ=255) ctttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCact > 2:1575634‑M1/58‑76 (MQ=255) ctttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCact < 1:1222076‑M1/19‑1 (MQ=255) ccTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggt < 2:488909‑M2/76‑14 (MQ=255) ccTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggt < 1:561919‑M2/76‑14 (MQ=255) ccTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgaatgaaggt > 2:1399360‑M2/1‑63 (MQ=255) tcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCactact > 1:1528165‑M1/55‑76 (MQ=255) tcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCactact < 2:1250081‑M1/22‑1 (MQ=255) tttACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggttt < 1:997764‑M2/76‑16 (MQ=255) caccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTNCACTACTg > 1:1970941‑M1/54‑76 (MQ=255) ttACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttc > 2:1864382‑M2/1‑60 (MQ=255) accactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGa > 2:186980‑M1/53‑76 (MQ=255) cactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTGCACTACTGAcc > 1:48440‑M1/51‑76 (MQ=255) cTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcact > 2:1800379‑M2/1‑57 (MQ=255) cTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcact > 2:1575634‑M2/1‑57 (MQ=255) cTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcact < 1:1222076‑M2/76‑20 (MQ=255) cTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcact < 1:1437415‑M2/76‑20 (MQ=255) ttCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactac > 1:649148‑M2/1‑55 (MQ=255) tCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactact < 2:1250081‑M2/76‑23 (MQ=255) gataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctgtc < 1:1643272‑M1/30‑1 (MQ=255) ataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctgtct > 2:469963‑M1/46‑76 (MQ=255) taaatctgttatcggcagcagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGCTTTCACTACTGACctgtctg < 1:2031677‑M1/32‑1 (MQ=255) accacTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactga > 2:1939887‑M2/1‑52 (MQ=255) aaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctgtctgt > 2:1161988‑M1/44‑76 (MQ=255) aaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctgtctgt < 1:519073‑M1/33‑1 (MQ=255) aatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGtt < 2:650226‑M1/34‑1 (MQ=255) tctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTgg > 2:561918‑M1/41‑76 (MQ=255) tgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCa > 1:979750‑M1/39‑76 (MQ=255) tgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTATGTTGGCa > 1:1899728‑M1/39‑76 (MQ=255) gATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtc < 1:1643272‑M2/76‑31 (MQ=255) gttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaccgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCaa > 1:31339‑M1/38‑76 (MQ=255) gttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGGATGAAGGTTTCANTACTGACTTGNCTGCTGGCaa > 2:2008896‑M1/38‑76 (MQ=255) aTAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtct > 2:469963‑M2/1‑45 (MQ=255) aTAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtct > 2:1267725‑M2/1‑45 (MQ=255) tAAATCTGTTATCGGCAGCAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaagctttcactactgacctgtctg < 1:2031677‑M2/76‑33 (MQ=255) aaaTCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgt < 1:519073‑M2/76‑34 (MQ=255) aaaTCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgt > 2:1161988‑M2/1‑43 (MQ=255) aaTCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgtt < 2:650226‑M2/76‑35 (MQ=255) cggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCg < 2:1893337‑M1/44‑1 (MQ=255) cggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCg > 2:1053219‑M1/33‑76 (MQ=255) cggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCg > 2:1088878‑M1/33‑76 (MQ=255) tGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggca > 1:979750‑M2/1‑38 (MQ=255) tGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtatgttggca > 1:1899728‑M2/1‑38 (MQ=255) gTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTACCGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaa > 1:31339‑M2/1‑37 (MQ=255) gTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacggatgaaggtttcantactgacttgnctgctggcaa > 2:2008896‑M2/1‑37 (MQ=255) aacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACt > 1:480066‑M1/29‑76 (MQ=255) aTCGGCAAAAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacac < 1:1891273‑M2/76‑43 (MQ=255) cGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgcaggtttcactactgccctgtctgttggcaacaccg < 2:1619240‑M2/76‑45 (MQ=255) cGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccg > 2:1053219‑M2/1‑32 (MQ=255) cGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccg < 2:1893337‑M2/76‑45 (MQ=255) gaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGa < 1:967858‑M1/54‑1 (MQ=255) aaCAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtact > 1:480066‑M2/1‑28 (MQ=255) tggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGAt > 1:1562671‑M1/19‑76 (MQ=255) gttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATgg < 1:29724‑M1/60‑1 (MQ=255) ttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGt < 1:866814‑M1/61‑1 (MQ=255) cGAAATCGTTNCGGTAACGTANGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttg < 2:2014953‑M2/76‑54 (MQ=255) gAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttga < 2:676760‑M2/76‑55 (MQ=255) gAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttga < 1:967858‑M2/76‑55 (MQ=255) ggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGa > 2:643714‑M1/12‑76 (MQ=255) tGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgat > 1:1562671‑M2/1‑18 (MQ=255) ggTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatg > 1:441863‑M2/1‑17 (MQ=255) aacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTGTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCg < 1:1714857‑M1/68‑1 (MQ=255) ttGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggt < 1:866814‑M2/76‑62 (MQ=255) cgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGt < 1:1274603‑M1/70‑1 (MQ=255) cgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGt < 1:365122‑M1/70‑1 (MQ=255) gtatgAACGTAAGAAGGTTTCACTACTGACCTGCCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTa < 1:1876678‑M1/71‑1 (MQ=255) 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gtatgaacgtaagaaggtttcactactgacctgcctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatcggta < 1:1876678‑M2/76‑72 (MQ=255) gTATGAATGTTTCTCCACTGATCTGTCAGTTGACAAAAGCGTACTCACTCAAGATGGTATGATCGGTATGGAAGtt < 1:2041430/76‑1 (MQ=255) gTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGtt > 1:1562809/1‑76 (MQ=255) tatgaacgtatgtaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgataggtat < 2:79999‑M2/76‑73 (MQ=255) atgaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatcggtatg < 2:1791478‑M2/76‑74 (MQ=255) atgaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatcggtatg < 2:505230‑M2/76‑74 (MQ=255) atgaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatcggtatg < 2:1533899‑M2/76‑74 (MQ=255) tGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTAcc < 2:1715689/76‑1 (MQ=255) tGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTAcc > 1:1052517/1‑76 (MQ=255) gaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatcggtatgga > 1:1286126‑M2/1‑1 (MQ=255) gAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCg > 2:835676/1‑76 (MQ=255) | AAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCG > REL606/1733220‑1733370 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |