| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 799331 | 85 (1.730) | 8 (0.180) | 5/140 | 4.7 | 10.0% | intergenic (‑56/+728) | ECB_00739/ybhB | hypothetical protein/predicted kinase inhibitor |
| ? | REL606 | = 799578 | 65 (1.420) | intergenic (‑303/+481) | ECB_00739/ybhB | hypothetical protein/predicted kinase inhibitor | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TATTGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAATGCAATATGGCATACTTTCGCTAAAAATACAAAGAGATAGAA > REL606/799256‑799404 | tatTGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCAt > 1:1483642/1‑76 (MQ=255) atTGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCAtt > 2:104750/1‑76 (MQ=255) atTGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCAtt > 1:624160/1‑76 (MQ=255) ttGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTa > 1:796236/1‑76 (MQ=255) ttGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTa > 2:936824/1‑76 (MQ=255) tggaaTGATAATATCATATGATTTGCCTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTaa < 2:1103336/73‑1 (MQ=255) tGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTaa > 2:1422426/1‑76 (MQ=255) tGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTaa < 2:1433878/76‑1 (MQ=255) tGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTaa < 2:1433890/76‑1 (MQ=255) tGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTaa < 2:1103348/76‑1 (MQ=255) tGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTaa > 2:1422419/1‑76 (MQ=255) tAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAAc > 1:582417/1‑76 (MQ=255) tAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAAc < 2:972818/76‑1 (MQ=255) tAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAAc < 2:1001975/76‑1 (MQ=255) gATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGaa < 2:62647/76‑1 (MQ=255) ataataTCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGaaa < 1:719337/76‑1 (MQ=255) taataTCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAaac < 1:7721/76‑1 (MQ=255) aataTCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAaaca < 2:549916/76‑1 (MQ=255) aataTCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAaaca > 1:486980/1‑76 (MQ=255) atatCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAaacaa > 2:284149/1‑76 (MQ=255) atatCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAaacaa > 2:1237367/1‑76 (MQ=255) atCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACg > 1:895735/1‑76 (MQ=255) tatGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCAc > 1:190597/1‑76 (MQ=255) tatGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCAc > 1:190601/1‑76 (MQ=255) atGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACg > 1:87892/1‑76 (MQ=255) atGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACg > 2:698620/1‑76 (MQ=255) atGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACg > 1:1147871/1‑76 (MQ=255) 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< 2:988029/76‑1 (MQ=255) tGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGa < 2:988010/76‑1 (MQ=255) tGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGa > 1:1323614/1‑76 (MQ=255) tGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGa > 1:408544/1‑76 (MQ=255) ggATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGaa > 2:1398686/1‑76 (MQ=255) ggATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGaa > 2:281074/1‑76 (MQ=255) ggATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGaa < 2:872612/76‑1 (MQ=255) gATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAAt > 1:1139700/1‑76 (MQ=255) gATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAAt > 1:1385312/1‑76 (MQ=255) gATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAAt < 2:212512/76‑1 (MQ=255) gATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAAAAACGCCACGCTCTATTAGAAt > 1:514278/1‑76 (MQ=255) gATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAAATATTTAAATCATTAAACAGAAAAAACGCCACGTTATATTAGAAt > 1:658722/1‑76 (MQ=255) tataATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAATGc < 1:458822/76‑1 (MQ=255) ataATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAATGCa > 1:1048589/1‑76 (MQ=255) aaTTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAATGCAat < 2:779522/76‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAATGCAATATg < 1:799985/76‑1 (MQ=255) ncAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAATGCAATATGGCATAc > 1:1459397/2‑76 (MQ=255) gCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAATGCAATATGGCATAc > 1:985998/1‑76 (MQ=255) gCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAATGCAATATGGCATAc > 1:485841/1‑76 (MQ=255) gCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAATGCAATATGGCATAc < 1:807481/76‑1 (MQ=255) cAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAATGCAATATGGCATACt > 1:897819/1‑76 (MQ=255) cAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAATGCAATATGGCATACt > 1:209160/1‑76 (MQ=255) aaTATTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAATGCAATATGGCATACttt < 1:253627/76‑1 (MQ=255) atatTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAATGCAATATGGCATACTTTc < 1:1272048/76‑1 (MQ=255) atatTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAATGCAATATGGCATACTTTc > 1:1291087/1‑76 (MQ=255) atatTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAATGCAATATGGCATACTTTc > 1:1266431/1‑76 (MQ=255) atatTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAATGCAATATGGCATACTTTc < 1:76059/76‑1 (MQ=255) atatTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAATGCAATATGGCATACTTTc > 2:1217321/1‑76 (MQ=255) tattatGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAATGCAATATGGCATACTTTCg > 1:199277/1‑76 (MQ=255) tattatGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAATGCAATATGGCATACTTTCg < 2:1234934/76‑1 (MQ=255) tatGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAATGCAATATGGCATACTTTCGCTa > 1:1298404/1‑76 (MQ=255) atGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAATGCAATATGGCATACTTTCGCTaa > 1:1408826/1‑76 (MQ=255) atGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAATGCAATATGGCATACTTTCGCTaa > 1:781664/1‑76 (MQ=255) tGTTGAACTTTTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAATGCAATATGGCATACTTTCGCTaaa > 1:737516/1‑76 (MQ=255) tGTTGAACTGTTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAATGCAATATGGCATACTTTCGCTaaa > 2:1050982/1‑76 (MQ=255) tGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAATGCAATATGGCATACTTTCGCTaaa > 1:737523/1‑76 (MQ=255) gTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAATGCAATATGGCATACTTTCGCTaaaa > 2:1472223/1‑76 (MQ=255) aaCTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAATGCAATATGGGATACTTTCGCTAAAAATAc < 2:1198016/76‑1 (MQ=255) aaCTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAATGCAATATGGCATACTTTCGCTAAAAATAc > 1:509278/1‑76 (MQ=255) tATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAATGCAATATGGCATACTTTCGCTAAAAATACaaa > 1:1400022/1‑76 (MQ=255) aTTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAATGCAATATGGCATACTTTCGCTAAAAATACAAag > 2:1238006/1‑76 (MQ=255) tttAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAATGCAATATGGCATACTTTCGCTAAAAATACAAaga > 1:305678/1‑76 (MQ=255) tttAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAATGCAATATGGCATACTTTCGCTAAAAATACAAaga < 1:464651/76‑1 (MQ=255) ttAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAATGCAATATGGCATACTTTCGCTAAAAATACAAagag < 2:1296766/76‑1 (MQ=255) aaaTCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAATGCAATATGGCATACTTTCGCTAAAAATACAAAGAGAt < 2:1337645/76‑1 (MQ=255) tCATTAAGCAGAAACAACGCCACGCTATATCAGAATGCAATATAGCATTCTTTCGCTAAAAAAACAAAGCGACaga < 2:181610/76‑1 (MQ=255) cATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAATGCAATATGGCATACTTTCGCTAAAAATACAAAGAGATagaa < 2:271904/76‑1 (MQ=255) cATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAATGCAATATGGCATACTTTCGCTAAAAATACAAAGAGATagaa > 1:1205307/1‑76 (MQ=255) cATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAATGCAATATGGCATACTTTCGCTAAAAATACAAAGAGATagaa < 2:271899/76‑1 (MQ=255) cATTAAACAGAAACAACGAGACGTTATATTAGAATGCAATATGGCAGTCTTTGGCTAAAAATACAAAGAGATagaa < 2:271903/76‑1 (MQ=255) | TATTGTAATGATAATATCATATGATTTGCTTGGATATAATTTGTTAGCAAATATTATGTTGAACTATTTAAATCATTAAACAGAAACAACGCCACGTTATATTAGAATGCAATATGGCATACTTTCGCTAAAAATACAAAGAGATAGAA > REL606/799256‑799404 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |