| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | REL606 | 1,733,297 | (CGTATGAA)1→2 | coding (333/1413 nt) | pykF → | pyruvate kinase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 1733288 = | 6 (0.110) | 77 (1.410) | 52/146 | 0.0 | 92.3% | coding (324/1413 nt) | pykF | pyruvate kinase |
| ? | REL606 | = 1733295 | 7 (0.130) | coding (331/1413 nt) | pykF | pyruvate kinase | |||||
Only 100 of 162 total aligned reads displayed.
TTCTCTGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAA > REL606/1733213‑1733363 | ttCTCTGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTa > 2:1115309/1‑76 (MQ=255)aagctggtcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatga < 2:1323231‑M1/1‑1 (MQ=255) tctcTGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGCaa < 2:1023134/76‑1 (MQ=255) agctggtcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaa > 1:1338325‑M1/75‑76 (MQ=255) tctGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACg < 2:1552839/76‑1 (MQ=255) ctggtcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacg < 2:476291‑M1/4‑1 (MQ=255) ctggtcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacg < 2:850643‑M1/4‑1 (MQ=255) ctggtcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacg < 2:1062791‑M1/4‑1 (MQ=255) tGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTATAACCACTGATAAATNTGTTATCGGCAACAGNGAAATGTTTGCGGTAACGTa > 2:1817184/1‑76 (MQ=255) ggtcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgta > 2:422861‑M1/71‑76 (MQ=255) ggtcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgta < 2:1773478‑M1/6‑1 (MQ=255) cagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgtatga < 2:1545781‑M1/9‑1 (MQ=255) cagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgtatga > 1:1280578‑M1/68‑76 (MQ=255) agacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgtatgaa < 2:692392‑M1/10‑1 (MQ=255) agacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgtatgaa < 2:1065248‑M1/10‑1 (MQ=255) agacctttactttcaccactgataaatctgctatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgtatgaa < 2:1305337‑M1/10‑1 (MQ=255) aGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaa > 1:1338325‑M2/1‑74 (MQ=255) gaccgttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAg > 2:235034‑M1/66‑76 (MQ=255) gCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaac < 1:887132‑M2/76‑4 (MQ=255) gCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaac < 2:721965‑M2/76‑4 (MQ=255) cTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacg < 2:476291‑M2/76‑5 (MQ=255) tttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGttt > 1:1233604‑M1/62‑76 (MQ=255) actttcacnactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCac < 1:1756783‑M1/18‑1 (MQ=255) aGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaa < 2:1183666‑M2/76‑11 (MQ=255) ttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCactac > 1:1532341‑M1/56‑76 (MQ=255) tcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCactact < 1:385499‑M1/22‑1 (MQ=255) tcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCactact < 1:560775‑M1/22‑1 (MQ=255) tcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCactact < 1:1551041‑M1/22‑1 (MQ=255) tcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCactact < 2:1597564‑M1/22‑1 (MQ=255) tACTTTCACCACTGATAAATATGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAAGGTATCaatgtatgaaggtttca < 1:87044‑M2/76‑18 (MQ=255) tgataaatctgtcatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTTGCctgt < 2:62770‑M1/29‑1 (MQ=255) tCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactact < 1:385499‑M2/76‑23 (MQ=255) gataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctgtc < 2:1116062‑M1/30‑1 (MQ=255) ataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctgtct > 2:705898‑M1/46‑76 (MQ=255) accacTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactga > 2:1389707‑M2/1‑52 (MQ=255) atctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaccgnatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGCGCTGTCTGTTg < 1:1787986‑M1/35‑1 (MQ=255) atctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTg < 1:213140‑M1/35‑1 (MQ=255) acTGATAAATCTGTTGTCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacct > 1:1515529‑M2/1‑49 (MQ=255) acTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacct > 1:1140248‑M2/1‑49 (MQ=255) gATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtc < 2:1262607‑M2/76‑31 (MQ=255) gATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtc < 1:631117‑M2/76‑31 (MQ=255) gttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGttt > 2:76606‑M1/38‑52 (MQ=255) gttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCaa < 2:1639215‑M1/39‑1 (MQ=255) gttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCaa < 1:68273‑M1/39‑1 (MQ=255) aTAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtct > 2:705898‑M2/1‑45 (MQ=255) ttatcggccacagcgaaatggttgcggtaacgtatcAACGTATGAATGTTTCACTAGTGACATGTCTGTTGGCAac < 2:34635‑M1/40‑1 (MQ=255) tatcggcaacagcgcaaagatttcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCTCTACTGACCTGTCTGTTGGCAaca > 1:90470‑M1/36‑76 (MQ=255) tatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAaca < 1:328659‑M1/41‑1 (MQ=255) atcggcaacagcgacatcggtgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAacac > 1:91380‑M1/35‑76 (MQ=255) atcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAacac < 2:852784‑M1/42‑1 (MQ=255) aTCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTACCGNATGaacgtatgaaggtttcactactgcgctgtctgttg < 1:1787986‑M2/76‑36 (MQ=255) aTCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttg > 1:914843‑M2/1‑41 (MQ=255) gcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTa < 2:1156254‑M1/46‑1 (MQ=255) 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1:1603245‑M1/30‑76 (MQ=255) ttATCGGCAACTGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactagtgacctgtctgttggcaac < 1:50176‑M2/76‑41 (MQ=255) tATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaaca < 1:328659‑M2/76‑42 (MQ=255) aTCGGCAACAGCGACATCGGTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacac > 1:91380‑M2/1‑34 (MQ=255) aTCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacac > 2:1661065‑M2/1‑34 (MQ=255) agcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGt < 2:1004313‑M1/51‑1 (MQ=255) gcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGtt < 2:1412994‑M1/52‑1 (MQ=255) cgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTg < 2:1534796‑M1/53‑1 (MQ=255) gCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgta < 2:1156254‑M2/76‑47 (MQ=255) gCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgta > 2:1243563‑M2/1‑30 (MQ=255) gCAACAACGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaagttttcactactgacctgtctgttggcaacaccgta > 2:48882‑M2/1‑30 (MQ=255) cAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtac < 2:1429954‑M2/76‑48 (MQ=255) cAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatcaaggtttcactnctgacctgtctgttggcaacaccgtac > 1:1603245‑M2/1‑29 (MQ=255) aaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGAc < 2:132808‑M1/55‑1 (MQ=255) aaCAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtact < 1:1445909‑M2/76‑49 (MQ=255) cAGCGAANCGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactgg < 2:1476383‑M2/76‑51 (MQ=255) ggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATg < 2:930505‑M1/59‑1 (MQ=255) tgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTc > 1:911569‑M1/15‑76 (MQ=255) tgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTc > 1:976597‑M1/15‑76 (MQ=255) tgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTc > 1:764923‑M1/15‑76 (MQ=255) aaaTGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgac < 2:132808‑M2/76‑56 (MQ=255) aaTGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacg > 2:1524476‑M2/1‑20 (MQ=255) aaTGGTTGCGGNAANGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcatcaccgtaatggttgacg > 2:286947‑M2/1‑20 (MQ=255) tGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgaagat < 1:1347127‑M2/76‑59 (MQ=255) gtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGAt < 1:1747870‑M1/66‑1 (MQ=255) ggTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatg > 1:410823‑M2/1‑17 (MQ=255) ggTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatg < 2:930505‑M2/76‑60 (MQ=255) aacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCg < 1:614381‑M1/68‑1 (MQ=255) ttGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggt < 2:848122‑M2/76‑62 (MQ=255) tGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtc > 1:764923‑M2/1‑14 (MQ=255) atgaaCGTATGAAGGTTTCNCNATTGACCNGTCTGTTGGCAACGCCGTACTNGTNGACGATGGTCTGATCGGTATg < 2:260429/73‑1 (MQ=255) atgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATg > 1:1026765‑M1/4‑76 (MQ=255) atgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATg < 1:77623‑M1/73‑1 (MQ=255) tgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATgg > 1:1428109‑M1/3‑76 (MQ=255) gTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgat > 2:168486‑M2/1‑10 (MQ=255) tAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatc < 1:678557‑M2/76‑68 (MQ=255) aacgtatgaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatcg < 1:614381‑M2/76‑69 (MQ=255) AACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGaa > 1:1062792‑M1/1‑76 (MQ=255) | TTCTCTGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAA > REL606/1733213‑1733363 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |