| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 1600647 | 87 (1.540) | 5 (0.100) | 4/132 | 5.2 | 6.1% | intergenic (‑595/‑158) | ydfJ/ydfK | predicted transporter/predicted DNA‑binding transcriptional regulator |
| ? | REL606 | = 1601008 | NA (NA) | coding (204/267 nt) | ydfK | predicted DNA‑binding transcriptional regulator | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
AATGTTTATCTACGAACTTTAAGAACACCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATCATATTCAGCATTTTTAGTCATGCC > REL606/1600572‑1600715 | aaTGTTTATCTACGAATTTTAAGAACACCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTc > 1:367853/1‑76 (MQ=255)aaTGTTTATCTACGAACTTTAAGAACACCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTc < 2:1399892/76‑1 (MQ=39) aTGTTTATCTACGAACTTTAAGAACACCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCg > 1:1069496/1‑76 (MQ=39) aTGTTTATCTACGAACTTTAAGAACACCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCg < 1:971382/76‑1 (MQ=39) aTGTTTATCTACGAACTTTAAGAACACCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCg < 1:639544/76‑1 (MQ=39) aTGTTTATCTACGAACTTTAAGAACACCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCg < 1:36432/76‑1 (MQ=39) tGTTTATCTACGAACTTTAAGAACACCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGa < 2:616894/76‑1 (MQ=39) gTTTATCTACGAACTTTAAGAACACCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAg > 1:701940/1‑76 (MQ=39) gTTTATCTACGAACTTTAAGAACACCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAg > 2:694846/1‑76 (MQ=39) tttATCTACGAACTTTAAGAACACCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAgg > 2:1606497/1‑76 (MQ=39) ttATCTACGAACTTTAAGAACACCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGc > 1:1254001/1‑76 (MQ=39) ttATCTACGAACTTTAAGAACACCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGc > 1:342653/1‑76 (MQ=39) tATCTACGAACTTTAAGAACACCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCt < 1:518775/76‑1 (MQ=39) tATCTACGAACTTTAAGAACACCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCt > 1:1063782/1‑76 (MQ=39) aTCTACGAACTTTAAGAACACCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCta > 1:492086/1‑76 (MQ=39) aTCTACGAACTTTAAGAACACCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCta > 2:545148/1‑76 (MQ=39) aTCTACGAACTTTAAGAACACCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCta > 2:992136/1‑76 (MQ=39) aTCTACGAACTTTAAGAACACCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAAATCGCGGCta > 2:992120/1‑76 (MQ=255) tCTACGAACTTTAAGAACACCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCtat > 2:975298/1‑76 (MQ=39) tCTACGAACTTTAAGAACACCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCtat < 1:373799/76‑1 (MQ=39) tACGAACTTTAAGAACACCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTatat < 1:300800/76‑1 (MQ=39) aCGAACTTTAAGAACACCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATg > 2:699033/1‑76 (MQ=255) aaCTTTAAGAACACCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAAc < 2:579080/76‑1 (MQ=255) cTTTAAGAACACCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAg < 2:1634421/76‑1 (MQ=255) tttAAGAACACCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGc < 2:1790442/76‑1 (MQ=255) tttAAGAACACCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGc > 2:92518/1‑76 (MQ=255) tttAAGAACACCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGc < 1:1196303/76‑1 (MQ=255) ttAAGAACACCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCa < 1:1560356/76‑1 (MQ=255) tAAGAACACCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCAt > 1:1825925/1‑76 (MQ=255) tAAGAACACCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCAt > 2:989276/1‑76 (MQ=255) aaGAACACCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATa < 1:1784716/76‑1 (MQ=255) aaGAACACCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATa < 2:1310199/76‑1 (MQ=255) aGAACACCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATAc < 1:1681523/76‑1 (MQ=255) aGAACACCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATAc < 2:1169896/76‑1 (MQ=255) gAACACCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACt > 2:729432/1‑76 (MQ=255) aaCACCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTg > 1:1770547/1‑76 (MQ=255) aaCACCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTg < 1:541299/76‑1 (MQ=255) acCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATa > 2:1307443/1‑76 (MQ=39) cccAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATaa < 2:617157/76‑1 (MQ=39) cAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATc < 1:624920/76‑1 (MQ=39) aaGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCa < 1:802841/76‑1 (MQ=39) aaaaTCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTtctc < 1:919087/76‑1 (MQ=39) aaTCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTtctctc < 2:1472168/76‑1 (MQ=39) aTCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTcc < 1:963741/76‑1 (MQ=39) tCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCt < 2:1467527/76‑1 (MQ=38) cGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCtt < 2:783219/76‑1 (MQ=35) cGTCAACAATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCtt > 1:661388/1‑76 (MQ=25) gTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTa < 1:369788/76‑1 (MQ=34) tCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTAt > 2:152785/1‑76 (MQ=34) cAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATc > 1:918141/1‑76 (MQ=34) cAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATc > 1:1555617/1‑76 (MQ=34) cAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATc < 1:529171/76‑1 (MQ=34) cAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATc > 2:1203705/1‑76 (MQ=34) aaCTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATCa < 2:1198607/76‑1 (MQ=34) aCTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATCat < 1:622633/76‑1 (MQ=34) cTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATACTCACTTCTCTCCTTCTCatc > 1:1376272/1‑75 (MQ=255) cTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATCata > 1:1376283/1‑76 (MQ=34) cTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATCata > 1:67855/1‑76 (MQ=34) cTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATCata < 2:1575647/76‑1 (MQ=34) cTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATCata > 2:1579536/1‑76 (MQ=34) tataTCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATCatat > 1:1224329/1‑76 (MQ=34) tataTCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATCatat > 2:1555677/1‑76 (MQ=34) atatCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATCATAtt > 2:857610/1‑76 (MQ=34) atatCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATCATAtt < 1:396023/76‑1 (MQ=34) atatCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATCATAtt < 2:1011630/76‑1 (MQ=34) atatCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATCATAtt < 1:256871/76‑1 (MQ=34) atatCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATCATAtt > 1:1746230/1‑76 (MQ=34) atatCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATCATAtt > 1:1435645/1‑76 (MQ=34) tatCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATCATATTc > 1:839699/1‑76 (MQ=34) tCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATCATATTCAg < 2:598727/76‑1 (MQ=34) tCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATCATATTCAg < 2:1177751/76‑1 (MQ=34) atatatAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATCATATTCAGCa > 1:649006/1‑76 (MQ=34) tatataACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATCATATTCAGCAt > 1:1732350/1‑76 (MQ=34) atataACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATCATATTCAGCAtt > 1:1419729/1‑76 (MQ=34) tataACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATCATATTCAGCAttt > 1:1395338/1‑76 (MQ=34) taACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATCATATTCAGCAttttt < 2:42471/76‑1 (MQ=34) taACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATCATATTCAGCAttttt > 1:1623168/1‑76 (MQ=34) taACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATCATATTCAGCAttttt < 1:421342/76‑1 (MQ=34) taACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATCATATTCAGCAttttt > 1:1001396/1‑76 (MQ=34) aaCACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATCATATTCAGCATTTTTa > 1:104054/1‑76 (MQ=34) aaCACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATCATATTCAGCATTTTTa > 1:1183114/1‑76 (MQ=34) aaCACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATCATATTCAGCATTTTTa > 1:1183113/1‑76 (MQ=34) cacaTTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATCATATTCAGCATTTTTAGt > 2:1524626/1‑76 (MQ=34) caTTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATCATATTCAGCATTTTTAGTCa > 2:683213/1‑76 (MQ=34) caTTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATCATATTCAGCATTTTTAGTCa > 2:1458900/1‑76 (MQ=34) ttAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATCATATTCAGCATTTTTAGTCATg > 1:669467/1‑76 (MQ=34) aataatTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATCATATTCAGCATTTTTAGTCATGcc > 2:958474/1‑76 (MQ=32) aataatTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATCATATTCAGCATTTTTAGTCATGcc > 2:999153/1‑76 (MQ=32) aataatTCGAGGCTATATGAACAGCAAACTGATTATCACTTCTCACCTTATCATATTCAGCATTTTTAGTCATGcc > 2:958459/1‑76 (MQ=11) | AATGTTTATCTACGAACTTTAAGAACACCCAAGATAAAAATCGTCAACTATATCATATATAACACATTAATAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCTCTCCTTATCATATTCAGCATTTTTAGTCATGCC > REL606/1600572‑1600715 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |