| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 4327459 | 152 (2.430) | 6 (0.100) | 3/138 | 6.7 | 4.1% | coding (1/1341 nt) | dcuB | C4‑dicarboxylate antiporter |
| ? | REL606 | = 4327699 | 141 (2.450) | intergenic (‑240/+331) | dcuB/dcuR | C4‑dicarboxylate antiporter/DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with DcuS | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 158 total aligned reads displayed.
ATTTATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTA > REL606/4327624‑4327774 | aTTTATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAg < 1:1515799/76‑1 (MQ=255) tttATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGa > 2:816872/1‑76 (MQ=255) ttATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGAt > 2:1668273/1‑76 (MQ=255) ttATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGAt > 2:493931/1‑76 (MQ=255) ttATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGAt > 2:1232967/1‑76 (MQ=255) tATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCCGGCGATGAGTTTAAAGTTTGTACTGCGAAGAta > 2:21692/1‑75 (MQ=255) tGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGtt < 2:71906/76‑1 (MQ=255) gCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTa > 1:136638/1‑76 (MQ=255) gCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTa > 1:1895600/1‑76 (MQ=255) gCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTa < 1:1796473/76‑1 (MQ=255) gCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTa < 1:808207/76‑1 (MQ=255) gCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTa < 2:597114/76‑1 (MQ=255) cACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTaa > 2:828213/1‑76 (MQ=255) cACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTaa > 1:1856167/1‑76 (MQ=255) cTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTGAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAAtg > 2:362287/1‑76 (MQ=255) cTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAAtg < 2:139792/76‑1 (MQ=255) tgtgATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAAtgt > 1:1109176/1‑76 (MQ=255) tgtgATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAAtgt < 2:1157409/76‑1 (MQ=255) tgtgATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAAtgt < 2:1864001/76‑1 (MQ=255) tgtgATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAAtgt < 2:1870447/76‑1 (MQ=255) gtgATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAAtgtt > 2:623044/1‑76 (MQ=255) tgATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAAtgttt > 2:1164138/1‑76 (MQ=255) tgATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAAtgttt < 2:742857/76‑1 (MQ=255) gATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAAtgtttt < 2:1945430/76‑1 (MQ=255) gATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAAtgtttt < 2:491770/76‑1 (MQ=255) gATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAAtgtttt > 1:707422/1‑76 (MQ=255) aTAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAAtgttttg < 1:261766/76‑1 (MQ=255) tAAGCGGTTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAAtgttttgt > 1:1270980/1‑76 (MQ=255) tAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAAtgttttgt < 1:1880597/76‑1 (MQ=255) aaGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAAtgttttgtt > 1:1461000/1‑76 (MQ=255) aGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAAtgttttgttt > 2:213273/1‑76 (MQ=255) gCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTtttgtttg > 1:566367/1‑76 (MQ=255) ttttCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTa < 1:1747045/76‑1 (MQ=255) ttttCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTa < 1:1989907/76‑1 (MQ=255) tttCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTAt > 1:907088/1‑76 (MQ=255) tttCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTAt > 2:888846/1‑76 (MQ=255) tttCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTAt < 2:1287486/76‑1 (MQ=255) tttCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTAt < 2:411271/76‑1 (MQ=255) tttCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTAt > 1:1969904/1‑76 (MQ=255) tttCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTAt < 2:613322/76‑1 (MQ=255) tttCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTAt > 1:1484377/1‑76 (MQ=255) ttCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATc < 1:1616257/76‑1 (MQ=255) ttCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATc > 1:1436479/1‑76 (MQ=255) tCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCt < 2:1804422/76‑1 (MQ=255) cAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCtt > 2:1712860/1‑76 (MQ=255) cAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCtt > 1:453076/1‑76 (MQ=255) gagagaAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTAt < 1:1072738/76‑1 (MQ=255) gagaAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTg < 1:567087/76‑1 (MQ=255) gagaAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTg < 2:1850282/76‑1 (MQ=255) aaaGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGata > 1:953524/1‑76 (MQ=255) aaaGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGata > 1:953513/1‑76 (MQ=255) aaGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGatat > 1:1555403/1‑76 (MQ=255) aGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATAtt < 2:1396231/76‑1 (MQ=255) aGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATAtt < 1:1232967/76‑1 (MQ=255) gACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATAttt < 2:1049353/76‑1 (MQ=255) aCTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTa > 2:767840/1‑76 (MQ=255) aCTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTa > 1:1248631/1‑76 (MQ=255) ctctGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCg > 1:140535/1‑76 (MQ=255) tctGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCgg > 1:32314/1‑76 (MQ=255) tctGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCgg < 2:651854/76‑1 (MQ=255) tctGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCgg < 2:1543012/76‑1 (MQ=255) tctGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCgg > 2:1060198/1‑76 (MQ=255) ctGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGt > 2:1224606/1‑76 (MQ=255) ctGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGt > 2:1478712/1‑76 (MQ=255) ggCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCt > 1:407929/1‑76 (MQ=255) ggCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCt < 1:715260/76‑1 (MQ=255) gCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTa < 2:1068181/76‑1 (MQ=255) cGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTAt > 1:836393/1‑76 (MQ=255) gggTTTAAAGTTTGTACTGCGCGGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTAttttt > 1:1930734/1‑76 (MQ=255) gTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTg < 1:898637/76‑1 (MQ=255) tttAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGt > 2:540785/1‑76 (MQ=255) tttAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGt > 1:824818/1‑76 (MQ=255) tttAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGt > 1:1007104/1‑76 (MQ=255) ttAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGtt > 1:1784816/1‑76 (MQ=255) tAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGCtc > 1:1723900/1‑76 (MQ=255) aaaGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTtct > 1:618581/1‑76 (MQ=255) aaaGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTtct > 1:1495415/1‑76 (MQ=255) aaGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTtctc > 2:1987366/1‑76 (MQ=255) aaGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTtctc < 2:765348/76‑1 (MQ=255) aaGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTtctc < 1:1417262/76‑1 (MQ=255) aGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCa < 2:1478024/76‑1 (MQ=255) gTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAg > 1:1048716/1‑76 (MQ=255) tttGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAgg > 2:1808623/1‑76 (MQ=255) tttGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAgg < 1:655028/76‑1 (MQ=255) ttGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAggg < 2:1758734/76‑1 (MQ=255) ttGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAggg > 1:482531/1‑76 (MQ=255) tGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGc < 2:170199/76‑1 (MQ=255) gTACTGCGCAGATNTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCa > 1:1344262/1‑76 (MQ=255) gTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTAT‑GGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAg > 1:671350/1‑76 (MQ=255) tACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAg > 2:592820/1‑76 (MQ=255) tACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAg < 1:1465480/76‑1 (MQ=255) tACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAg > 1:1367832/1‑76 (MQ=255) cTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGAt < 1:1541237/76‑1 (MQ=255) cTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGAt > 1:409521/1‑76 (MQ=255) tGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATg < 1:32984/76‑1 (MQ=255) gcgcAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGt < 1:434806/76‑1 (MQ=255) cAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCAt > 1:1681722/1‑76 (MQ=255) aGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCANGGCAGATGTCAtt < 1:1335093/76‑1 (MQ=255) gATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTa < 1:290048/76‑1 (MQ=255) gATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTa < 2:342321/76‑1 (MQ=255) | ATTTATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATGGGTTTAAAGTTTGTACTGCGCAGATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTA > REL606/4327624‑4327774 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |