Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | REL606 | 546990–547700 | 573919 | 26220–26930 | 16 [15] | [15] 16 | [insB‑6]–ECB_00530 | [insB‑6],insA‑6,nmpC,ybcR,ybcS,ybcT,ybcU,ECB_00510,nohB,ECB_00512,ECB_00513,ECB_00514,ECB_00515,ECB_00516,ECB_00517,appY,ompT,envY,ybcH,nfrA,nfrB,nfrB,ECB_00524,yhhI,ECB_00526,ECB_00527,ECB_00528,ECB_00529,ECB_00530 |
TAACATGATCTGCACATTGCACATCTTAACGTTGTTAAATACTGGCTCAATAGTGGATATTTTAAATTAGGAATTTATCAAATTCACTTGATAAATAGATTGAGTGAATAATATAACAATTAATGATGATTAATCGCGATTAAATTATTCA > REL606/573845‑573995 | tAACATGATCTGCACATTGCACATCTCAACGTTGTTAAATACTGGCTCAATAGTGGATATTTTAAATTAGGAAttt < 2:1082436/76‑1 (MQ=255) gtGATCTGCACATTGCACATCTTAACGTTGTTAAATACTGGCTCAATAGTGGATATTTTAAATTAGGAATTTATcg < 1:1039229/75‑2 (MQ=255) tGATCTGCACATTGCACATCTTAACGTTGTTAAATACTGGCTCAATAGTGGATATTTTAAATTAGGAATTTATCaa < 1:1125974/76‑1 (MQ=255) cattgcacatCTTAACGTTGTTAAATACTGGCTCAATAGTGGATATTTTAAATTAGGAATTTATCAAATTCACTTg < 2:172264/76‑1 (MQ=255) cTTAACGTTGTTAAATACTGGCTCAATAGTGGATATTTTAAATTAGGAATTTATCAAATTCACTTGATAAATAGAt > 1:1804452/1‑76 (MQ=255) gttgttAAATACTGNCTCAATAGTGGATATTTTAAATTAGGAATTTATCAAATTCACTTGATAAATAGATTGAGTg > 1:1083641/1‑76 (MQ=255) gttgttAAATACTGNCTCAATAGTGGATATTTTAAATTAGGAATTTATCAAATTCACTTGATAAATAGATTGAGTg > 1:1083653/1‑76 (MQ=255) aaTACTGGCTCAATAGTGGATATTTTAAATTAGGAATTTATCAAATTCACTTGATAAATAGATTGAGTGAataata < 2:1722283/76‑1 (MQ=255) aaTACTGGCTCAATAGTGGATATTTTAAATTAGGAATTTATCAAATTCACTTGATAAATAGATTGAGTGAataata > 2:234070/1‑76 (MQ=255) aCTGGCTCAATAGTGGATATTTTAAATTAGGAATTTATCAAATTCACTTGATAAAGAGAGTGAGTGAATAAgatag < 1:1039348/76‑2 (MQ=25) cTCAATAGTGGATATTTTAAATTAGGAATTTATCAAATTCACTTGATAAATAGATTGAGTGAATAATATAACAAtt > 2:1988702/1‑76 (MQ=255) aGTGGATATTTTAAATTAGGTATTTATCAAATTCACTTGATAAATAGATTGAGTGAATAATATAACAATTAatgat < 1:454631/76‑1 (MQ=255) ttttAAATTAGGAATTTATCAAATTCACTTGATAAATAGATTGAGTGAATAATATAACAATTAATGATGATTAATc > 1:74731/1‑76 (MQ=255) aTTAGGAATTTATCAAATTCACTTGATAAATAGATTGAGTGAATAATATAACAATTAATGATGATTAATCGCGAtt < 2:19257/76‑1 (MQ=255) aTTTATCAAATTCACTTGATAAATAGATTGAGTGAATAATATAACAATTAATGATGATTAATCGCGATTAAattat > 2:1330681/1‑76 (MQ=255) tATCAAATTCACTTGATAAATAGATTGAGTGAATAATATAACAATTAATGATGATTAATCGCGATTAAATTATTCa > 1:76537/1‑76 (MQ=255) | TAACATGATCTGCACATTGCACATCTTAACGTTGTTAAATACTGGCTCAATAGTGGATATTTTAAATTAGGAATTTATCAAATTCACTTGATAAATAGATTGAGTGAATAATATAACAATTAATGATGATTAATCGCGATTAAATTATTCA > REL606/573845‑573995 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |