| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 2038724 = | 117 (2.070) | 28 (0.560) | 14/134 | 2.6 | 21.9% | coding (225/822 nt) | wbbB | putative glycosyltransferase WbbB |
| ? | REL606 | 2039214 = | 96 (1.900) | coding (481/747 nt) | wbbA | putative glycosyltransferase WbbA | |||||
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
TGCATTATGTTTCAAGAACAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATATGAAATCCCTTC > REL606/2038649‑2038799 | tGCATTATGTTTCAAGAACAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTAtcttct > 1:1323082/1‑76 (MQ=255)tGCATTATGTTTCAAGAACAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTAtcttct > 1:1323070/1‑76 (MQ=255)atataagatgggatatggcaacgctttatgatcatccagataaatatagtgaatattgtgaacatcttgattcatt > 1:756852‑M1/76‑76 (MQ=255) tataagatgggatatggcaacgctttatgatcatccagataaatatagtgaatattgtgaacatcttgattcatTa > 2:745245‑M1/75‑76 (MQ=255) cATTATGTTTCAAGAACAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTaa > 1:1154266/1‑76 (MQ=255) cATTATGTTTCAAGAACAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTaa > 2:1172731/1‑76 (MQ=255) cATTATGTTTCAAGAACAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTaa > 1:1341036/1‑76 (MQ=255) ataagatgggatatggcaacgctttatgatcatccagataaatatagtgaatattgtgaacatcttgattcatTaa < 1:1649780‑M1/3‑1 (MQ=255) taagatgggatatggcaacgctttatgatcatccagataaatatagtgaatattgtgaacatcttgattcatTaaa < 2:430378‑M1/4‑1 (MQ=255) aTTATGTTTCAAGAACAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTaaa > 2:854245/1‑76 (MQ=255) ttATGTTTCAAGAACAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTaaaa > 1:1593053/1‑76 (MQ=255) tATGTTTCAAGAACAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTaaaaa > 2:1458847/1‑76 (MQ=255) tATGTTTCAAGAACAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTaaaaa > 1:1580310/1‑76 (MQ=255) gatgggatatggcaacgctttatgatcatccagataaatatagtgaatattgtgaacatctcgattcatTaaaaaa < 1:1251825‑M1/7‑1 (MQ=255) tGTTTCAAGAACAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAAt > 1:65350/1‑76 (MQ=255) atgggatatggcaacgctttatgatcatccagataaatatagtgaatattgtgaacatcttgattcatTAAAAAAt > 2:1543672‑M1/69‑76 (MQ=255) tttCAAGAACAATNTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCt > 1:1235252/1‑76 (MQ=255) aGAACAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTAttcc > 1:920057/1‑76 (MQ=255) aaCAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTAttcctt < 1:1690416/76‑1 (MQ=255) gTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTtat < 1:1638075/76‑1 (MQ=255) gTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTtat < 1:693879/76‑1 (MQ=255) tATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTtata > 2:59834/1‑76 (MQ=255) aTTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCa < 1:189467/76‑1 (MQ=255) ttgaaaaTGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAg > 1:524536/4‑76 (MQ=255) ttCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAg < 2:919793/76‑1 (MQ=255) cAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGaa < 1:1708224/76‑1 (MQ=255) cAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGaa > 1:602614/1‑76 (MQ=255) cAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGaa < 1:1063606/76‑1 (MQ=255) aaaaTGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGaaa > 1:405689/1‑76 (MQ=255) aaaaTGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGaaa > 1:987798/1‑76 (MQ=255) catccagataaatatagtgaatattgtgaacatcttgattcatTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGaaaa < 2:616637‑M1/33‑1 (MQ=255) aaTGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAAc < 1:895585/76‑1 (MQ=255) tGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTc > 1:1754454/1‑76 (MQ=255) tGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTc > 1:1754446/1‑76 (MQ=255) tGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTc < 2:437526/76‑1 (MQ=255) ataaatatagtgaatattgtgaacatcttgattcatTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCaaaa < 2:759233‑M1/40‑1 (MQ=255) ataaatatagtgaatattgtgaacatcttgattcatTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCaaaa < 2:656624‑M1/40‑1 (MQ=255) ttGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAag > 1:337736/1‑76 (MQ=255) tGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAagg < 1:483110/76‑2 (MQ=255) aatatagtgaatattgtgaacatcttgattcatTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAaga < 2:1345882‑M1/43‑1 (MQ=255) aatatagtgaatattgtgaacatcttgattcatTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAaga < 2:1345867‑M1/43‑1 (MQ=255) aatatagtgaatattgtgaacatcttgattcatTAAAAAATCTATTCCTCCCTTATAGGCAGAAACCtcaaaaaaa < 2:309050‑M1/43‑3 (MQ=255) atatagtgaatattgtgaacatcttgattcatTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAagag < 2:1103396‑M1/44‑1 (MQ=255) tatagtgaatattgtgaacatcttgattcatTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAaagagc < 2:1730962‑M1/45‑2 (MQ=255) tACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAANACTCAAAAAGAGaa < 1:999092/76‑1 (MQ=255) tACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGaa < 1:1160635/76‑1 (MQ=255) aCTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAAt > 1:368744/1‑76 (MQ=255) cTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAAtt < 1:1478190/76‑1 (MQ=255) atCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAAtt > 1:1008604/2‑76 (MQ=255) ccTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTg < 1:712029/76‑1 (MQ=255) ccTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTg > 1:274430/1‑76 (MQ=255) ccTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTg > 1:476354/1‑76 (MQ=255) ccTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAACCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGGGAATTTg < 1:1176876/76‑1 (MQ=255) tGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGTATTTGTc > 2:45217/1‑76 (MQ=255) tGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAAtttatt < 2:661134/76‑4 (MQ=255) tGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAAtttatt < 2:661128/76‑4 (MQ=255) tGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTc > 1:533839/1‑76 (MQ=255) gATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTcc > 2:963919/1‑76 (MQ=255) aTGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTccc < 1:1519963/76‑1 (MQ=255) attgtgaacatcttgattcatTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCg < 2:1537499‑M1/55‑1 (MQ=255) gTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGtt > 1:37226/1‑76 (MQ=255) gTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGtt > 1:1317571/1‑76 (MQ=255) gTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGtt > 1:1452355/1‑76 (MQ=255) taataaTGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGttt > 1:497604/1‑76 (MQ=255) aacatcttgattcatTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCg < 2:15610‑M1/61‑1 (MQ=255) acatcttgattcatTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGa < 2:157670‑M1/62‑1 (MQ=255) acatcttgattcatTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTCTTCGa < 2:1811153‑M1/62‑1 (MQ=255) aatGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGa > 1:821324/1‑76 (MQ=255) catcttgattcatTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGat < 2:1305522‑M1/63‑1 (MQ=255) atGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGat > 1:12334/1‑76 (MQ=255) tGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCACAAAGAGCATTTGTCCCGCTTTCGaca > 1:1569773/1‑74 (MQ=255) tGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGata > 1:1512732/1‑76 (MQ=255) tGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGata > 1:1512719/1‑76 (MQ=255) tGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGata > 1:412943/1‑76 (MQ=255) tGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGata < 2:1127968/76‑1 (MQ=255) tcttgattcatTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAACAAGAGACTTTGTCCCGTTTTCGatat < 2:1241972‑M1/65‑1 (MQ=255) tcttgattcatTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGatat < 2:1566159‑M1/65‑1 (MQ=255) gAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGatat > 1:1475586/1‑76 (MQ=255) cttgattcatTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATATg < 2:1740433‑M1/66‑1 (MQ=255) cttgattcatTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATATg < 2:600133‑M1/66‑1 (MQ=255) gCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATATGa > 1:385882/1‑76 (MQ=255) gCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATATGa > 1:6409/1‑76 (MQ=255) gCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATATGa > 1:6402/1‑76 (MQ=255) gCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATATGa > 1:385888/1‑76 (MQ=255) gCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATATGa > 1:502843/1‑76 (MQ=255) gCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATATGa > 1:849719/1‑76 (MQ=255) gCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATATGa > 1:528330/1‑76 (MQ=255) gCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATATGa < 1:536505/76‑1 (MQ=255) cTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATATGaa > 1:1838606/1‑76 (MQ=255) cTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATATGaa > 1:1364312/1‑76 (MQ=255) cTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATATGaa > 1:1464766/1‑76 (MQ=255) cTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATATGaa < 2:1204993/76‑1 (MQ=255) aTCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATATGAAAt > 2:1310630/1‑76 (MQ=255) aTCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATATGAAAt < 1:120165/76‑1 (MQ=255) aTCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATAGGAAAt > 2:1812535/1‑76 (MQ=255) tcttctAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATATGAAATc > 2:1082624/1‑76 (MQ=255) ttctAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATATGAAATccc < 2:384710/76‑1 (MQ=255) catTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATCTGAACTccc < 2:498013‑M1/73‑1 (MQ=255) tctAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATATGAAATCCCt < 2:1598275/76‑1 (MQ=255) TAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATATGAAATCCCTTc > 1:1537559‑M1/1‑76 (MQ=255) | TGCATTATGTTTCAAGAACAATGTATCATTCAAAATGAGAATTGGTACTCCTGATGGTAATAATGAGCTATCTTCTAAAAAATCTATTCCTTCCTTATAGGCAGAAAACTCAAAAAGAGAATTTGTCCCGTTTTCGATATGAAATCCCTTC > REL606/2038649‑2038799 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |