| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 703,652 | A→G | intergenic (‑41/‑292) | nagB ← / → nagE | glucosamine‑6‑phosphate deaminase/N‑acetyl glucosamine specific PTS enzyme IIC, IIB, and IIA components |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 703,652 | 0 | A | G | 100.0% | 239.8 / NA | 63 | intergenic (‑41/‑292) | nagB/nagE | glucosamine‑6‑phosphate deaminase/N‑acetyl glucosamine specific PTS enzyme IIC, IIB, and IIA components |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (37/26); total (37/26) | |||||||||||
GACGATCGGCAGTCGGTTTGAACGCATTGATACGATTGACGATATGGCGAGCAGCCCATTTGCCGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATTTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGT > NC_000913/703512‑703798 | gACGATCGGCAGTCGGTTTGAACGCATTGATACGATTGACGATATGGCGAGCAGCCCATTTGCCGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTGGGCATCttt < 1:362702/150‑1 (MQ=255) aTCGGCAGTCGGTTTGAACGCATTGATACGATTGACGATATGGCGAGCAGCCCATTTGCCGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTGGGCATCTTTAAGc < 2:173206/150‑1 (MQ=255) aTCGGCAGTCGGTTTGAACGCATTGATACGATTGACGATATGGCGAGCAGCCCATTTGCCGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTGGGCATCTTTAAGCg < 1:360497/151‑1 (MQ=255) aTCGGCAGTCGGTTTGAACGCATTGATACGATTGACGATATGGCGAGCAGCCCATTTGCCGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGAGTGGGCATCTTTAAGc < 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> NC_000913/703512‑703798 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |