| Read alignment evidence... | |||||||||||
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ACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCG‑CATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAAC‑ATCTGAACATTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCG‑CTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAG‑CTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCG > NC_000913/3813130‑3813417 | aCGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGGAGCG‑CCTTTTTTGCCCGGCa > 2:1685641/1‑151 (MQ=255) gcaTAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAGTGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCG‑CGTTTTTCTCCCCTCAACGa > 1:646252/1‑150 (MQ=255) gcaTAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGGG‑CATTTTTTGcccccccacgca > 1:1245188/1‑142 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |