| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,604,202 | G→A | *242* (TAG→TAA) E15K (GAA→AAA) |
yjjQ → bglJ → |
putative transcriptional regulator bgl operon transcriptional activator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,604,202 | 0 | G | A | 100.0% | 228.2 / NA | 71 | *242* (TAG→TAA) E15K (GAA→AAA) | yjjQ bglJ | putative transcriptional regulator bgl operon transcriptional activator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (35/36); total (35/36) | |||||||||||
TCACAGCAACGCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAGCTCCATACCTATACCAGTCAGGAGTCATTTCAGGATGCCATGTCGCGGATCT > NC_000913/4604070‑4604322 | tCACAGCAACGCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAAt < 2:743790/139‑1 (MQ=255) gCAACGCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTc < 2:732730/139‑1 (MQ=255) gCAACGCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTc > 1:24075/1‑139 (MQ=255) cGCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGa > 2:685003/1‑139 (MQ=255) gCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGag < 2:24075/139‑1 (MQ=255) cTGAAATGTATGCATGGATAAAGAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑ATAGAAATGTCGCACTCATAAAATAATGCGTCATGagt < 2:458015/139‑1 (MQ=255) aaTGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAgtagta < 2:229948/139‑1 (MQ=255) tGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATc < 1:647963/139‑1 (MQ=255) gTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCg < 1:570906/139‑1 (MQ=255) aTGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGt > 2:157106/1‑139 (MQ=255) tGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTa > 2:282220/1‑139 (MQ=255) gCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTc < 1:231341/122‑1 (MQ=255) gCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTc > 2:231341/1‑122 (MQ=255) aTGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTg < 1:678793/139‑1 (MQ=255) aTGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTg > 2:678793/1‑139 (MQ=255) aTGGATAAATAGCGCGCAGGGTCCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTg > 1:634838/1‑139 (MQ=255) aaTAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCa < 2:43282/114‑1 (MQ=255) aaTAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCa > 1:43282/1‑114 (MQ=255) cgcgcAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCa > 2:422233/1‑139 (MQ=255) cgcgcAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCa > 1:212815/1‑139 (MQ=255) cgcAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGa > 2:387545/1‑139 (MQ=255) cgcAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGa > 2:38788/1‑139 (MQ=255) cgcAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGa > 2:766026/1‑139 (MQ=255) cgcAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGa > 2:575321/1‑139 (MQ=255) cgcAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGa > 2:612738/1‑139 (MQ=255) cgcAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGa > 1:144554/1‑139 (MQ=255) cgcAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATCGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑ACAGAAATGTCGCACTCATAAAAAACTGCGTCATGAGTAGTATCCGTATTGAGAGGTTATTCCGa > 1:447175/1‑139 (MQ=255) agagAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCggg < 1:343656/139‑1 (MQ=255) agagAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCggg < 1:344212/139‑1 (MQ=255) gagaACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGt < 1:387545/139‑1 (MQ=255) gaACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTaa < 2:554098/139‑1 (MQ=255) aacttaacttGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAAc > 1:411538/1‑139 (MQ=255) aacttaacttGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAAc > 1:193522/1‑139 (MQ=255) cttaacttGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGAAGAGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAAc > 1:637283/1‑139 (MQ=255) cttaacttGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAgtagta > 1:511109/1‑99 (MQ=255) cttaacttGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAgtagta < 2:511109/99‑1 (MQ=255) acttGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTtat < 2:168797/139‑1 (MQ=255) cttGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTtata < 2:438670/139‑1 (MQ=255) tGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAg < 1:282220/139‑1 (MQ=255) gCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAGc < 1:16381/139‑1 (MQ=255) cTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAGCTc < 1:422233/139‑1 (MQ=255) cTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACGCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAGCTc < 1:575321/139‑1 (MQ=255) cTTCTGTTTATGGACATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACACAGAAAAAAATGCGTCATGAGTAGCATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAGCTc < 2:490705/139‑1 (MQ=255) ttCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGt > 1:440745/1‑123 (MQ=255) ttCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGt < 2:440745/123‑1 (MQ=255) ttCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAGCTcc < 2:634838/139‑1 (MQ=255) ttCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAGCTcc < 2:193522/139‑1 (MQ=255) ttCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAGCTcc < 2:53229/139‑1 (MQ=255) cTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAGCTCCAt > 2:341551/1‑139 (MQ=255) gTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAGCTCCATAc < 2:546064/139‑1 (MQ=255) gaTGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTGATGag < 1:601874/70‑1 (MQ=255) gaTGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGag > 2:601874/1‑70 (MQ=255) 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(MQ=255) cacaGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAGCTCCATACCTATACCAGTCAGGAGTCATTTCAgg < 1:685003/139‑1 (MQ=255) aGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAGCTCCATACCTATACCAGTCAGGAGTCATTTCAGGATg > 2:561376/1‑139 (MQ=255) aGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTAATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATAGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAGCTCCATACCTATACCAGTCAGCAGTCATTTCAGGATg > 1:365170/1‑139 (MQ=255) ccGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAGCTCCATACCTATACCAGTCAGGAGTCATTTCAGGATGcc < 1:571695/139‑1 (MQ=255) ccGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGATTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAGCTCCATACCTATACCAGTCAGGAGTCATTTCAGGATGcc > 2:391616/1‑139 (MQ=255) aaTTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCg < 2:45365/53‑1 (MQ=255) aaTTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAAAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCg > 1:45365/1‑53 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TCACAGCAACGCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGA‑‑AGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAGCTCCATACCTATACCAGTCAGGAGTCATTTCAGGATGCCATGTCGCGGATCT > NC_000913/4604070‑4604322 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |