| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 1,371,482 | (AT)4→3 | coding (1267‑1268/1680 nt) | ycjM → | alpha amylase catalytic domain family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,371,476 | 0 | A | . | 100.0% | 318.9 / NA | 77 | coding (1261/1680 nt) | ycjM | alpha amylase catalytic domain family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base . (39/38); total (39/38) | |||||||||||
| * | NC_000913 | 1,371,477 | 0 | T | . | 100.0% | 318.9 / NA | 77 | coding (1262/1680 nt) | ycjM | alpha amylase catalytic domain family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base . (39/38); total (39/38) | |||||||||||
TACACGCAGTCCGTATGAAATAAATGTGACCTATATGGATGCGTTAAGCCGCCGTGAGAGTAGCGATGAAGAACGTTGCGCCAGGTTTATCCTTGCCCATGCGATTTTGTTAAGTTTCCCCGGTGTGCCAGCGATATATATTCAAAGTATTCTTGGCTCGCGTAATGATTACGCAGGTGTCGAAAAACTCGGATATAACCGTGCGATTAACCGTAAAAAATATCACAGTAAAGAGATAACCCGAGAACTGAACGATGAAG > NC_000913/1371343‑1371602 || tACACGCAGTCCGTATGAAATAAATGTGACCTATATGGATGCGTTAAGCCGCCGTGAGAGTAGCGATGAAGAACGTTGCGCCAGGTTTATCCTTGCCCATGCGATTTTGTTAAGTTTCCCCGGTGTGCCAGCGatatat < 1:1899049/139‑1 (MQ=255) gTCCGTATGAAATAAATGTGACCTATATGGATGCGTTAAGCCGCCGTGAGAGTAGCGATGAAGAACGTTGCGCCAGGTTTATCCTTGCCCATGCGATTTTGTTAAGTTTCCCCGGTGTGCCAGCG‑‑ATATATTCAAAGTa > 2:358273/1‑139 (MQ=255) gTCCGTATGAAATAAATGTGACCTATATGGATGCGTTAAGCCGCCGTGAGAGTAGCGATGAAGAACGTTGCGCCAGGTTTATCCTTGCCCATGCGATTTTGTTAAGTTTCCCCGGTGTGCCAGCG‑‑ATATATTCAAAGTa > 1:1173396/1‑139 (MQ=255) tCCGTATGAAATAAATGTGACCTATATGGATGCGTTAAGCCGCCGTGAGAGTAGCGATGAAGAACGTTGCGCCAGGTTTATCCTTGCCCATGCGATTTTGTTAAGTTTCCCCGGTGTGCCAGCGatatattcaaa < 2:755799/135‑6 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |