| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1287084 | 25 (0.300) | 31 (0.470) | 22/166 | 1.6 | 53.8% | noncoding (153/171 nt) | rttR | rtT sRNA, processed from tyrT transcript |
| ? | NC_000913 | 1287557 = | 33 (0.500) | noncoding (66/85 nt) | tyrT | tRNA‑Tyr | |||||
CGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTG > NC_000913/1286952‑1287217 | cGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaacc > 2:898231‑M1/1‑133 (MQ=255)cGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAg > 2:1573270/1‑139 (MQ=11) ctcGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTgc < 1:743773/139‑1 (MQ=11) ctcGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGA‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTgc < 1:117085/139‑1 (MQ=11) ggcGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCtt < 1:1713752/137‑1 (MQ=11) agcgcCCGAGCCGAACCTTATGCGTAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgat < 1:1381256‑M1/137‑19 (MQ=255) gCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCCTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCCCATGAG‑AGTTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGc > 1:838516/1‑139 (MQ=11) tCGAGCTGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATT < 2:1866757‑M1/116‑1 (MQ=255) tCGAGCTGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATT > 1:1866757‑M1/1‑116 (MQ=255) gAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggca > 2:1879421‑M1/1‑114 (MQ=255) aGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcag < 2:386340‑M1/139‑27 (MQ=255) atcGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctg < 1:898231‑M1/138‑39 (MQ=255) aGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcga < 1:16470‑M1/113‑18 (MQ=255) aGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcga > 2:16470‑M1/1‑96 (MQ=255) tctcATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcga > 1:1289230‑M1/1‑92 (MQ=255) tctcATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcga < 2:1289230‑M1/95‑4 (MQ=255) ccTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGA‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGctctct > 2:656436/1‑139 (MQ=11) tCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGA‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGc > 2:300813/1‑131 (MQ=14) tCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGA‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGc < 1:300813/131‑1 (MQ=14) ccccGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctg < 2:34823‑M1/120‑39 (MQ=255) ccccGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctg > 1:34823‑M1/1‑82 (MQ=255) ccccGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGA‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCt > 1:788975/1‑139 (MQ=11) ccccGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCG‑TTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGAATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCt > 2:1123346/1‑139 (MQ=11) cATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaac > 2:1966387‑M1/1‑77 (MQ=255) cATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaac < 1:1966387‑M1/137‑61 (MQ=255) aTGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGA‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCt > 2:1381256/1‑139 (MQ=14) ggCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccacc < 1:1879421‑M1/139‑67 (MQ=255) ggCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctg < 2:1929056‑M1/111‑39 (MQ=255) ggCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctg > 1:1929056‑M1/1‑73 (MQ=255) ggCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGA‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCt > 2:2055945/1‑136 (MQ=11) ggCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGA‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCGGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCt < 1:2055945/136‑1 (MQ=11) cAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCTGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggc < 2:180187‑M1/120‑50 (MQ=255) cAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCTGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggc > 1:180187‑M1/1‑71 (MQ=255) aaTATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccagggg > 1:783155‑M1/1‑68 (MQ=255) tatTTAATTGCGGATTCGTTGGGA‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAAc > 2:1936311/1‑139 (MQ=11) tGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccaggggtaattc < 2:783155‑M1/139‑78 (MQ=255) tGCGGATTCGTTGGGA‑AGTTCGGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCt > 2:150206/1‑121 (MQ=11) tGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccacc < 2:1209928‑M1/124‑67 (MQ=255) tGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccacc > 1:1209928‑M1/1‑58 (MQ=255) tGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacgg < 1:874813‑M1/81‑24 (MQ=255) tGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacgg > 2:874813‑M1/1‑58 (MQ=255) tGCGGATTCG‑TTGGGAAGTTCGGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCt < 1:150206/121‑1 (MQ=11) cGGATTCGTTGGGA‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCgg > 1:993723/1‑98 (MQ=11) cGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccaggggtaattcaaattt > 1:553859‑M1/1‑56 (MQ=255) cGGATTCG‑TTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCgg < 2:993723/98‑1 (MQ=11) ggATTCGTTGGGA‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAg < 1:656436/139‑1 (MQ=11) gATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgg > 1:1743399‑M1/1‑54 (MQ=255) gATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgg < 2:1743399‑M1/110‑57 (MQ=255) gattcgttgggaagTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGc < 1:1936311/127‑1 (MQ=11) ttgggaagTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCgg > 1:813154/7‑90 (MQ=255) ttgggaagTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCgg < 2:813154/84‑1 (MQ=255) gACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcggg < 2:1306479‑M1/91‑58 (MQ=255) gACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcggg > 1:1306479‑M1/1‑34 (MQ=255) tGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAgccg < 1:216581/98‑4 (MQ=14) cgATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAgc < 1:1984711/89‑2 (MQ=17) cgATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAgc > 2:1984711/2‑89 (MQ=17) gATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatga < 2:89014‑M1/41‑21 (MQ=255) gATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatga > 1:89014‑M1/1‑21 (MQ=255) tggtggtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatca > 2:2023276‑M1/1‑19 (MQ=255) tggtggtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcgggg < 2:895855‑M1/132‑114 (MQ=255) tggtggtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcgggg > 1:895855‑M1/1‑19 (MQ=255) gtggtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcata > 1:542806‑M1/1‑17 (MQ=255) tggtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatat > 1:1256793‑M1/1‑16 (MQ=255) gtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatca > 2:531585‑M1/1‑14 (MQ=255) gtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttgaccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctccctta > 1:302572‑M1/1‑14 (MQ=255) gtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttgaccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctccctta < 2:302572‑M1/114‑101 (MQ=255) ggggAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcg > 2:142992‑M1/1‑11 (MQ=255) ggggAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcg < 1:142992‑M1/121‑111 (MQ=255) ggAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatga > 2:1832726‑M1/1‑9 (MQ=255) ggAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaacc < 1:1105933‑M1/70‑62 (MQ=255) ggAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaacc > 2:1105933‑M1/1‑9 (MQ=255) aaGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacg < 1:531585‑M1/139‑133 (MQ=255) aaGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacg < 2:1256793‑M1/139‑133 (MQ=255) aGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgcttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcg < 1:1126173‑M1/139‑134 (MQ=255) aTTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggagccccacc > 2:413567‑M1/1‑3 (MQ=255) aTTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggagccccacc < 1:413567‑M1/69‑67 (MQ=255) aTTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaacc < 1:1253680‑M1/64‑62 (MQ=255) aTTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaacc > 2:1253680‑M1/1‑3 (MQ=255) tcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctg > 2:466698‑M1/1‑1 (MQ=255) tcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctg < 1:466698‑M1/39‑39 (MQ=255) | CGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTG > NC_000913/1286952‑1287217 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |