Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 941,832 | A→G | T292A (ACA→GCA) | dmsA → | dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit A |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 941,832 | 0 | A | G | 100.0% | 325.6 / NA | 91 | T292A (ACA→GCA) | dmsA | dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit A |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (43/48); total (43/48) |
AGTGGCGGTGGGGTGACTTACTATCTTGAACAGGCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAACAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTCCTCGATAAATATTGCGTTGGCTACGATGAGAAAACCCTGCCAGCCAGTGCGCCGAAAAATGGCCA > NC_000913/941700‑941965 | aGTGGCGGTGGGGTGACTTACTATCTTGAACAGGCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATg < 2:236818/139‑1 (MQ=255) cGGTGGGGTGATTTACTATCTTGAACAGGCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCACATGCCGCa < 2:1334573/139‑1 (MQ=255) ggggTGACTTACTATCTTGAACAGGCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCa < 2:265380/135‑1 (MQ=255) ggggTGACTTACTATCTTGAACAGGCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGAACCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCa > 1:265380/1‑135 (MQ=255) tGACTTACTATCTTGAACAGGCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTaa < 1:724900/139‑1 (MQ=255) cTTACTATCTTGAACAGGCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACTGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACgg < 1:1402579/139‑1 (MQ=255) ttACTATCTTGAACAGGCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGt < 2:1871657/139‑1 (MQ=255) tCTTGAACAGGCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCg > 2:1600783/1‑119 (MQ=255) tCTTGAACAGGCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCg < 1:1600783/119‑1 (MQ=255) tCTTGAACAGGCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCg < 1:455412/139‑1 (MQ=255) cTTGAACAGGCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCCATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGt < 2:11787/139‑1 (MQ=255) ttGAACAGGCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCg > 1:1169413/1‑137 (MQ=255) ttGAACAGGCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCg < 2:1169413/137‑1 (MQ=255) ttGAACAGGCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGt > 2:1924299/1‑138 (MQ=255) ttGAACAGGCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGt < 1:1924299/138‑1 (MQ=255) gAACAGGCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGGTCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGc > 1:1572454/1‑116 (MQ=255) gAACAGGCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGGTCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGc < 2:1572454/116‑1 (MQ=255) aaCAGGCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACgg < 2:488355/127‑1 (MQ=255) aaCAGGCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACgg > 1:488355/1‑127 (MQ=255) gCACGCCAGAAATCTAATGCCCTCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGa > 2:1513622/1‑139 (MQ=255) gCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTgg > 2:438599/1‑127 (MQ=255) gCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTgg < 1:438599/127‑1 (MQ=255) gCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCg > 1:685106/1‑129 (MQ=255) gCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCg < 2:685106/129‑1 (MQ=255) aTGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCa < 2:32519/95‑1 (MQ=255) aTGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCa > 1:32519/1‑95 (MQ=255) cGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATc > 1:2021580/1‑139 (MQ=255) atcatcGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTcc < 1:538386/139‑1 (MQ=255) catcGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGt < 2:805924/98‑1 (MQ=255) catcGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGt > 1:805924/1‑98 (MQ=255) tcGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCa > 2:1608983/1‑77 (MQ=255) tcGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCa < 1:1608983/77‑1 (MQ=255) tcGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTCCTCGa < 2:1725689/139‑1 (MQ=255) tCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTcc > 1:1429980/1‑131 (MQ=255) tCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTcc < 2:1429980/131‑1 (MQ=255) tCCGCGCCATACCGACACCGGTGCAGGGCGCGAAGATGAGGGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTCCTCGATaaa > 2:1255890/1‑139 (MQ=255) cgcgCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCa > 1:1342491/1‑71 (MQ=255) cgcgCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCa < 2:1342491/71‑1 (MQ=255) cgcTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCTTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCg < 2:1374770/87‑1 (MQ=255) cgcTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTCCTCGATAAATAtt < 1:1513622/139‑1 (MQ=255) cgcTATACCGACACCAGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCg > 1:1374770/1‑87 (MQ=255) acacCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCtggtgg > 1:27621/1‑105 (MQ=255) acacCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCtggtgg < 2:27621/105‑1 (MQ=255) acacCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTCCTCGATAAATATTGCGTTGGc < 1:812959/137‑1 (MQ=255) acacCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTCCTCGATAAATATTGCGTTGGc > 2:812959/1‑137 (MQ=255) acacCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCAGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTCCTCGATAAATATTGCGTTGGCTa > 2:646459/1‑139 (MQ=255) ccGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTTTATCCCTATTCGTCCGGGAGCATATGCCGCACTGGTTAACGGTCTTGCGTACGTCATTATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTCCTCGATAAATATTGCGTTGGCTACGa < 1:459683/139‑1 (MQ=255) ggTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGt < 1:1160830/66‑1 (MQ=255) ggTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGt > 2:1160830/1‑66 (MQ=255) ggTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCg < 1:310579/72‑1 (MQ=255) ggTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCg > 2:310579/1‑72 (MQ=255) ggTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTCCTCGATAAATATTGCGTTGGCTACGATg > 1:624811/1‑139 (MQ=255) gTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTCCTCGAt < 1:916597/116‑1 (MQ=255) gTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTCCTCGAt > 2:916597/1‑116 (MQ=255) tGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTTGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTCCTCGATAAATATTGCGTTGGCTACGATgag > 2:459683/1‑139 (MQ=255) tGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTCCTCGATAAATATTGCGTTGGCTACGATgag > 2:694386/1‑139 (MQ=255) tGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTCCTCGATAAATATTGCGTTGGCTACGATgag > 2:1884930/1‑139 (MQ=255) gCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGAt < 2:298198/80‑1 (MQ=255) gCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGAt > 1:298198/1‑80 (MQ=255) ggCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTAc > 1:951447/1‑68 (MQ=255) ggCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTAc < 2:951447/68‑1 (MQ=255) cgcgAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGAt > 1:704912/1‑74 (MQ=255) cgcgAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGAt < 2:704912/74‑1 (MQ=255) aaGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTCCTCGATAAATATTGCGTTGGCTACGATGAGAAAACCCTgcc < 1:1873514/139‑1 (MQ=255) aaGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTCCTCGATAAATATTGCGTTGGCTACGATGAGAAAACCCTgcc > 2:1873514/1‑139 (MQ=255) 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2:580078/1‑47 (MQ=255) ccGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGAt > 1:920296/1‑47 (MQ=255) ccGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGAt < 2:920296/47‑1 (MQ=255) ccGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTCCTCGATAAATATTGCGTTGGCTACGATGAGAAAACCCTGCCAGCCAGTGCGCCGAAAAATGGcc > 1:1213397/1‑139 (MQ=255) ccGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTCCTCGATAAATATTGCGTTGGCTACGATGAGAAAACCCTGCCAGCCAGTGCGCCGAAAAATGGc < 1:212299/138‑1 (MQ=255) ccGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTCCTCGATAAATATTGCGTTGGCTACGATGAGAAAACCCTGCCAGCCAGTGCGCCGAAAAATGGc > 2:212299/1‑138 (MQ=255) cGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTCCTCGATAAATATTGCGTTGGCTACGATGAGAAAACCCTGCCAGCCAGTGCGCCGAAAAATGGCCa < 2:624811/139‑1 (MQ=255) | AGTGGCGGTGGGGTGACTTACTATCTTGAACAGGCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAACAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTCCTCGATAAATATTGCGTTGGCTACGATGAGAAAACCCTGCCAGCCAGTGCGCCGAAAAATGGCCA > NC_000913/941700‑941965 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |