| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 3,664,986 | C→T | *275* (TAG→TAA) | gadX ← | acid resistance regulon transcriptional activator, autoactivator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,664,986 | 0 | C | T | 100.0% | 468.9 / NA | 141 | *275* (TAG→TAA) | gadX | acid resistance regulon transcriptional activator, autoactivator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (70/71); total (70/71) | |||||||||||
Only 100 of 141 total aligned reads displayed.
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ttATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTTTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGt > 2:1920114/1‑114 (MQ=255) cGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTTTATAAt > 2:388217/1‑86 (MQ=255) cGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTTTATAAt < 1:388217/86‑1 (MQ=255) ttattaGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTTTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGt < 2:1177000/104‑1 (MQ=255) taGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTTTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTgccg < 1:1786101/139‑1 (MQ=255) tCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTTTATAATCTTAttcc < 2:1870824/83‑1 (MQ=255) tCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTTTATAATCTTAt < 2:1970029/80‑1 (MQ=255) tCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTTTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGt > 2:718190/1‑97 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |