| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,789,352 | G→A | R244C (CGC→TGC) | waaH ← | LPS(HepIII)‑glucuronic acid glycosyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,789,352 | 0 | G | A | 100.0% | 332.8 / NA | 100 | R244C (CGC→TGC) | waaH | LPS(HepIII)‑glucuronic acid glycosyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (41/59); total (41/59) | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
CCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAG > NC_000913/3789215‑3789475 | ccGTTGGCGGGTAAGA‑‑ATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGt < 2:1924630/139‑1 (MQ=255) gTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGt < 2:945974/139‑1 (MQ=255) gTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGt < 1:1129077/139‑1 (MQ=255) gTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGt < 1:575482/139‑1 (MQ=255) 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aTTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAg > 2:1995152/1‑139 (MQ=255) caggcaggTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTccc > 2:910762/1‑51 (MQ=255) caggcaggTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTccc < 1:910762/51‑1 (MQ=255) | CCGTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAATTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAG > NC_000913/3789215‑3789475 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |