Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 406,492 | T→C | F30L (TTT→CTT) | aroL → | shikimate kinase II |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 406,492 | 0 | T | C | 100.0% | 361.5 / NA | 100 | F30L (TTT→CTT) | aroL | shikimate kinase II |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (51/49); total (51/49) |
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
ATGACACCGGCTTTCGCCGCATTGCGACCTATTGGGGAAAACCCACGATGACACAACCTCTTTTTCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGTTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCGGAGATCGTCGAAAGGGAAGAGTGGGCGGGATTTCGCGCCAGAGAAACGGCGGCGCTGGAAGCGGTAACTGCGCCATCCACCGTTA > NC_000913/406358‑406627 | aTGACACCGGCTTTCGCCGCATTGCGACCTATTGGGGAAAACCCACGCTGACACAACCTCTTTTTCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGACCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGt < 1:1903214/139‑1 (MQ=255) aTGACACCGGCTTTCGCCGCATTGCGACCTATTGGGGAAAACCCACGATGACACAACCTCTTTTTCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGt > 2:1254063/1‑139 (MQ=255) aTGACACCGGCTTTCGCCGCATTGCGACCTATTGGGGAAAACCCACGATGACACAACCTCTTTTTCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGt > 1:608536/1‑139 (MQ=255) aTGACACCGGCTTTCGCCGCATTGCGACCTATTGGGGAAAACCCACGATGACACAACCTCTTTTTCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGt < 1:1254063/139‑1 (MQ=255) aTGACACCGGCTTTCGCCGCATTGCGACCTATTGGGGAAAACCCACGATGACACAACCTCTTTTTCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGt > 2:1611126/1‑139 (MQ=255) aTGACACCGGCTTTCGCCGCATTGCGACCTATTGGGGAAAACCCACGATGACACAACCTCTTTTTCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGt > 1:1925021/1‑139 (MQ=255) aTGACACCGGCTTTCGCCGCATTGCGACCTATTGGGGAAAACCCACGATGACACAACCTCTTTTTCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGt > 2:1903214/1‑139 (MQ=255) gACACCGGCTTTCGCCGCATTGCGACCTATTGGGGAAAACCCACGATGACACAACCTCTTTTTCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCg > 2:238174/1‑139 (MQ=255) cacCGGCTTTCGCCGCATTGCGACCTATTGGGGAAAACCCACGATGACACAACCTCTTTTTCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGAt < 2:752113/139‑1 (MQ=255) acCGGCTTTCGCCGCATTGCGACCTATTGGGGAAAACCCACGATGACACAACCTCTTTTTCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATa < 2:1925021/139‑1 (MQ=255) acCGGCTTTCGCCGCATTGCGACCTATTGGGGAAAACCCACGATGACACAACCTCTTTTTCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATa < 1:710375/139‑1 (MQ=255) cGGCTTTCGCCGCATTGCGACCTATTGGGGAAAACCCACGATGACACAACCTCTTTTTCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATAcc > 2:253291/1‑139 (MQ=255) ggCTTTCGCCGCATTGCGACCTATTGGGGAAAACCCACGATGACACAACCTCTTTTTCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCg < 2:2023271/139‑1 (MQ=255) gCTTTCGCCGCATTGCGACCTATTGGGGAAAACCCACGATGACACAACCTCTTTTTCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGCCGGAATGGCCGTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATcccta > 1:1309267/1‑137 (MQ=255) cTTTCGCCGCATTGCGACCTATTGGGGAAAACCCACGATGACACAACCTCTTTTTCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGAt < 2:589071/139‑1 (MQ=255) gccgcATTGCGACCTATTGGGGAAAACCCACGATGACACAACCTCTTTTTCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTg < 1:1611126/139‑1 (MQ=255) aTTGCGACCTATTGGGGAAAACCCACGATGACACAACCTCTTTTTCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGc < 2:608536/139‑1 (MQ=255) tATTGGGGAAAACCCACGATGACACAACCTCTTTTTCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGc > 1:1192352/1‑139 (MQ=255) aTTGGGGAAAACCCACGATGACACAACCTCTTTTTCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCt < 1:238174/139‑1 (MQ=255) aaCCCACGATGACACAACCTCTTTTTCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGAt < 2:116903/110‑1 (MQ=255) aaCCCACGATGACACAACCTCTTTTTCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGAt > 1:116903/1‑110 (MQ=255) aaCCCACGATGACACAACCTCTTTTTCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGAc > 2:1867802/1‑139 (MQ=255) cccACGATGACACAACCTCTTTTTCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTTGATACCGATCAg > 2:843875/1‑111 (MQ=255) cccACGATGACACAACCTCTTTTTCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTTGATACCGATCAg < 1:843875/111‑1 (MQ=255) cccACGATGACACAACCTCTTTTTCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCa < 1:446034/110‑1 (MQ=255) cccACGATGACACAACCTCTTTTTCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCa > 2:446034/1‑110 (MQ=255) cccACGATGACACAACCTCTTTTTCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACgg > 1:1530556/1‑139 (MQ=255) cccACGATGACACAACCTCTTTTTCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACg < 1:884385/138‑1 (MQ=255) cccACGATGACACAACCTCTTTTTCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACg > 2:884385/1‑138 (MQ=255) aCGATGACACAACCTCTTTTTCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTcg > 2:1564139/1‑139 (MQ=255) aaCCTCTTTTTCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCGGAGAtcgt < 1:519854/139‑1 (MQ=255) ccTCTTTTTCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATa > 2:1405304/1‑88 (MQ=255) ccTCTTTTTCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATa < 1:1405304/88‑1 (MQ=255) ccTCTTTTTCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCGGAGAtcgtcg < 1:1564139/139‑1 (MQ=255) ccTCTTTTTCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCGGAGAtcgtcg > 2:2040401/1‑139 (MQ=255) ctTTTTCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCGGAGATCGTCGaaa < 1:1593496/139‑1 (MQ=255) ctTTTTCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCGGAGATCGTCGaaa > 2:2046904/1‑139 (MQ=255) tttttCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCGGAGATCGTCGAAAg > 2:1619118/1‑139 (MQ=255) tGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCGGAGAtcgtcg > 1:325069/1‑129 (MQ=255) tGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCGGAGAtcgtcg < 2:325069/129‑1 (MQ=255) gATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACg < 2:1352558/112‑1 (MQ=255) gATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCACTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACg > 1:1352558/1‑112 (MQ=255) aTCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAg > 1:737818/1‑84 (MQ=255) aTCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAg < 2:737818/84‑1 (MQ=255) aTCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATca > 2:1977901/1‑96 (MQ=255) aTCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATca < 1:1977901/96‑1 (MQ=255) cGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATca > 2:929747/1‑94 (MQ=255) cGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATca < 1:929747/94‑1 (MQ=255) gCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGc > 2:770744/1‑95 (MQ=255) gCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGc < 1:770744/95‑1 (MQ=255) gCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCGGAGATCGTCGAAAGGGAAGAGTGGGCg < 1:1867802/139‑1 (MQ=255) ccTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCGGAGATCGTCGAAAGGGAAGAGTGGGCgg < 2:1192352/139‑1 (MQ=255) ggggCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTcgcg > 1:1601971/1‑107 (MQ=255) ggggCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTcgcg < 2:1601971/107‑1 (MQ=255) tgtgGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAAt < 2:1721446/79‑1 (MQ=255) tgtgGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAAt > 1:1721446/1‑79 (MQ=255) tgtgGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCgg > 2:1655001/1‑103 (MQ=255) tgtgGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCgg < 1:1655001/103‑1 (MQ=255) gtgGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCGGAGATCGTCGAAAGGGAAGAGTGGGCGGGATTTCgcgc < 1:253291/139‑1 (MQ=255) tgGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCGGAGAtcgt > 1:1343975/1‑108 (MQ=255) tgGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCGGAGAtcgt < 2:1343975/108‑1 (MQ=255) tgGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCGGAGATCGTCGAAAGGGAAGAGTGGGCGGGATTTCGCGcc > 1:1725113/1‑139 (MQ=255) gTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCGGAGATCGTCGAAAGGGAAGAGTGGGCGGGATTTCGCGCCag > 1:1297277/1‑139 (MQ=255) acGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGa > 2:1209462/1‑53 (MQ=255) acGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGa < 1:1209462/53‑1 (MQ=255) acGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCGGAGATCGTCGAAAGGGAAGAGTGGGCGGGATTTCGCGCCAGAGAAAcgg > 2:1704677/1‑139 (MQ=255) acGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCGGAGATCGTCGAAAGGGAAGAGTGGGCGGGATTTCGCGCCAGAGAAAcgg < 1:1619118/139‑1 (MQ=255) cGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATa > 2:1147195/1‑48 (MQ=255) cGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATa < 1:1147195/48‑1 (MQ=255) cGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGAt < 1:2047635/53‑1 (MQ=255) cGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGAt > 2:2047635/1‑53 (MQ=255) ggTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCGGAGATCGTCGAAAGGGAAGAGTGGGCGGGATTTCGCGCCAGAGAAAcggcg > 1:102433/1‑139 (MQ=255) gTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTcg < 2:948920/85‑1 (MQ=255) gTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTcg > 1:948920/1‑85 (MQ=255) gTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCGGAGATCGTCGaa > 2:1874920/1‑99 (MQ=255) gTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCGGAGATCGTCGaa < 1:1874920/99‑1 (MQ=255) tCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCGGAGATCGTCGAAAGGGAAGAGTGGGCGGGAttt > 2:218290/1‑119 (MQ=255) tCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCGGAGATCGTCGAAAGGGAAGAGTGGGCGGGAttt < 1:218290/119‑1 (MQ=255) cGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCGGAGATCGTCGAAAGGGAAGAGTGGGCGGGATTTCGCGCCAGAGAAACGgcggcg < 2:102433/139‑1 (MQ=255) aaTGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCGGAGATCGTCGAAAGGGAAGAGTGGGCGGGATTTCGCGCCAGAGAAACGGCGGCGCTg < 1:1704677/139‑1 (MQ=255) aaTGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCGGAGATCGTCGAAAGGGAAGAGTGGGCGGGATTTCGCGCCAGAGAAACGGCGGCGCTg < 1:988426/139‑1 (MQ=255) tGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTg > 1:126029/1‑42 (MQ=255) tGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTg < 2:126029/42‑1 (MQ=255) tGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCGGAGATCGTCGAAAGGGAAGAGTGGGCGGGATTTCgcgc < 2:633961/111‑1 (MQ=255) tGCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCGGAGATCGTCGAAAGGGAAGAGTGGGCGGGATTTCgcgc > 1:633961/1‑111 (MQ=255) gCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGa > 1:513124/1‑64 (MQ=255) gCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGa < 2:513124/64‑1 (MQ=255) gCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCGGAGAtcgtcg > 2:1399478/1‑82 (MQ=255) gCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCGGAGAtcgtcg < 1:1399478/82‑1 (MQ=255) gCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCGGAGATCGTCGAAAGGGAAGAGTGGGCGGGATTTCGCGCCAGAGAAACGgcggcg > 1:710441/1‑126 (MQ=255) gCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCGGAGATCGTCGAAAGGGAAGAGTGGGCGGGATTTCGCGCCAGAGAAACGgcggcg < 2:710441/126‑1 (MQ=255) gCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCGGAGATCGTCGAAAGGGAAGAGTGGGCGGGATTTCGCGCCAGAGAAACGGCGGCGCTGGa > 2:1182790/1‑131 (MQ=255) gCCGATTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCGGAGATCGTCGAAAGGGAAGAGTGGGCGGGATTTCGCGCCAGAGAAACGGCGGCGCTGGa < 1:1182790/131‑1 (MQ=255) aTTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACg < 1:304413/62‑1 (MQ=255) aTTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACg > 2:304413/1‑62 (MQ=255) aTTCGCTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCGGAGATCGTCGAAAGGGAAGAGTGGGCGGGATTTCGCGCCAGAGAAACGGCGGCGCTGGAAGCGGTAACTgc > 2:1802195/1‑139 (MQ=255) cTTAACCGTCGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCGGAGATCGTCGAAAGGGAAGAGTGGGCGGGATTTCGCGCCAGAGAAACGGCGGCGCTGGAAGCGGTAACTGCGCCAt > 1:1587366/1‑139 (MQ=255) cGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTcgc < 1:176019/53‑1 (MQ=255) cGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTcgc > 2:176019/1‑53 (MQ=255) cGGCTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCGGAGATCGTCGAAAGGGAAGAGTGGGCGGGATTACGCGCCAGAGAAACGGCGGCGCTGGAAGCGGTAACTGCGCCATCCACCGTTa > 1:1509536/1‑139 (MQ=255) | ATGACACCGGCTTTCGCCGCATTGCGACCTATTGGGGAAAACCCACGATGACACAACCTCTTTTTCTGATCGGGCCTCGGGGCTGTGGTAAAACAACGGTCGGAATGGCCCTTGCCGATTCGCTTAACCGTCGGTTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATGACGGTCGCGGAGATCGTCGAAAGGGAAGAGTGGGCGGGATTTCGCGCCAGAGAAACGGCGGCGCTGGAAGCGGTAACTGCGCCATCCACCGTTA > NC_000913/406358‑406627 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |