| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 941,832 | A→G | T292A (ACA→GCA) | dmsA → | dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 941,832 | 0 | A | G | 100.0% | 202.4 / NA | 56 | T292A (ACA→GCA) | dmsA | dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (28/28); total (28/28) | |||||||||||
GTGGGGTGACTTACTATCTTGAACAGGCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAACAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTCCTCGATAAATATTGCGTTGGCTACGATGAGAAAACCCTGCCAGCCAGTGCGCCGAAAAATGGC > NC_000913/941707‑941963 | gTGGGGTGACTTACTATCTTGAACAGGCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACt > 2:1079694/1‑139 (MQ=255) tGGGGTGACTTACTATCTTGAACAGGCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGCTCATCATAGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCAGTg < 2:126729/139‑1 (MQ=255) aCTTACTATCTTGAACAGGCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTaa > 2:357177/1‑137 (MQ=255) aCTTACTATCTTGAACAGGCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTaa < 1:357177/137‑1 (MQ=255) aCTTACTATCTTGAACAGGCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACg > 1:924746/1‑139 (MQ=255) ttACTATCTTGAACAGGCACGCCAGAAATCCAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGt < 1:583198/139‑1 (MQ=255) aTCTTGAACAGGCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGc > 1:338498/1‑139 (MQ=255) tCTTGAACAGGCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATATCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCg < 2:687425/139‑1 (MQ=255) tCTTGAACAGGCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCg < 2:431820/139‑1 (MQ=255) cTTGAACAGGCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGt < 1:596431/139‑1 (MQ=255) cAGGCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCa < 1:1030662/139‑1 (MQ=255) gCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCg > 2:805929/1‑109 (MQ=255) gCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCg < 1:805929/109‑1 (MQ=255) gCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCa < 2:500876/111‑1 (MQ=255) gCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCa > 1:500876/1‑111 (MQ=255) gCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGt > 1:1100676/1‑123 (MQ=255) gCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGt < 2:1100676/123‑1 (MQ=255) gCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGa > 2:855103/1‑139 (MQ=255) aaaTCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGaaa < 2:924746/139‑1 (MQ=255) aaTGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCtgg > 2:468014/1‑139 (MQ=255) ccGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGAt < 1:468014/139‑1 (MQ=255) cGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATc > 2:392325/1‑139 (MQ=255) cATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAg > 2:634020/1‑139 (MQ=255) cATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAg > 1:310308/1‑139 (MQ=255) tcatcatcGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCAtt < 1:634020/139‑1 (MQ=255) catcGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCg > 1:75118/1‑97 (MQ=255) catcGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCg < 2:75118/97‑1 (MQ=255) tcGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGaa < 1:563570/113‑1 (MQ=255) tcGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGaa > 2:563570/1‑113 (MQ=255) cGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTCCTCGAt < 1:1079694/139‑1 (MQ=255) gATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTCCTCGATa > 1:245624/1‑139 (MQ=255) aTCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCa > 1:1079501/1‑74 (MQ=255) aTCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCa < 2:1079501/74‑1 (MQ=255) aTCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGAt > 2:3602/1‑103 (MQ=255) aTCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGAt < 1:3602/103‑1 (MQ=255) aTCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTCCTCGATaa > 1:522895/1‑139 (MQ=255) aTCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTCCTCGATaa > 2:189634/1‑139 (MQ=255) tCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGt < 1:797831/85‑1 (MQ=255) tCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGt > 2:797831/1‑85 (MQ=255) cgcgCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTCCTCGATAAata < 1:392325/139‑1 (MQ=255) cgcTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATg > 2:222626/1‑64 (MQ=255) cgcTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATg < 1:222626/64‑1 (MQ=255) acacCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACt > 1:480465/1‑92 (MQ=255) acacCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACt < 2:480465/92‑1 (MQ=255) acacCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTCCTCGATAAATATTGCGTTGGCTa > 1:953663/1‑139 (MQ=255) ccGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCa < 2:1107937/56‑1 (MQ=255) ccGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCa > 1:1107937/1‑56 (MQ=255) tGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTCCTCGATAAATATTGCGTTGGCTACGATgag < 1:189634/139‑1 (MQ=255) gcgAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTCCTCGATAAATATTGCGTTGGCTACGATGAGAAAACCCt < 1:855103/139‑1 (MQ=255) gTCCGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTCCTCGATAAATATTGCGTTGGCTACGATGAGAAAACCCTGCCAGCCAGTGCGCCGAAAAATgg > 2:560923/1‑139 (MQ=255) ccGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTCCTCGATAAATATTGCGTTGGc < 2:301308/96‑1 (MQ=255) ccGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTCCTCGATAAATATTGCGTTGGc > 1:301308/1‑96 (MQ=255) ccGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTCCTCGATAAATATTGCGTTGGCTACGATGAGaaaa < 2:401441/109‑1 (MQ=255) ccGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTCCTCGATAAATATTGCGTTGGCTACGATGAGaaaa > 1:401441/1‑109 (MQ=255) ccGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTCCTCGATAAATATTGCGTTGGCTACGATGAGAAAACCCTGCCAGCCAGTGCGCCGAAAAATGGc < 1:958268/138‑1 (MQ=255) ccGGGAGCAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTCCTCGATAAATATTGCGTTGGCTACGATGAGAAAACCCTGCCAGCCAGTGCGCCGAAAAATGGc > 2:958268/1‑138 (MQ=255) | GTGGGGTGACTTACTATCTTGAACAGGCACGCCAGAAATCTAATGCCCGCATGATCATCATCGATCCGCGCTATACCGACACCGGTGCCGGGCGCGAAGATGAGTGGATCCCTATTCGTCCGGGAACAGATGCCGCACTGGTTAACGGTCTGGCGTACGTCATGATCACTGAAAACCTGGTGGATCAGGCATTCCTCGATAAATATTGCGTTGGCTACGATGAGAAAACCCTGCCAGCCAGTGCGCCGAAAAATGGC > NC_000913/941707‑941963 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |