| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,841,897 | G→A | *136* (TAG→TAA) T80I (ACT→ATT) |
nudG → ynjH ← |
CTP pyrophosphohydrolase, also hydrolyzes 2‑hydroxy‑dATP, 8‑hydroxy‑dGTP, 5‑hydroxy‑CTP, dCTP and 5‑methyl‑dCTP DUF1496 family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,841,897 | 0 | G | A | 100.0% | 146.2 / NA | 45 | *136* (TAG→TAA) T80I (ACT→ATT) | nudG ynjH | CTP pyrophosphohydrolase, also hydrolyzes 2‑hydroxy‑dATP, 8‑hydroxy‑dGTP, 5‑hydroxy‑CTP, dCTP and 5‑methyl‑dCTP DUF1496 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (23/22); total (23/22) | |||||||||||
CGTTACAGGCACATGAACATCAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACT > NC_000913/1841764‑1842017 | cGTTACAGGCACATGAACATCAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTa > 1:955645/1‑139 (MQ=255) acaTGAACATCAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTa > 2:300646/1‑129 (MQ=255) acaTGAACATCAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTa < 1:300646/129‑1 (MQ=255) acaTGAACATCAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGt > 2:338454/1‑139 (MQ=255) caTGAACATCAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGtc > 2:930053/1‑139 (MQ=255) tGAACATCAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGtcat > 2:834415/1‑139 (MQ=255) tGAACATCAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGtcat > 2:396921/1‑139 (MQ=255) tCAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCt < 2:589131/139‑1 (MQ=255) tCAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCt < 1:930053/139‑1 (MQ=255) cAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTg > 1:985964/1‑139 (MQ=255) aGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTgg < 2:985964/139‑1 (MQ=255) ggCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGc > 1:878048/1‑139 (MQ=255) cgcTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCAt < 1:285657/139‑1 (MQ=255) ctggtctggtGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTg < 2:1098208/139‑1 (MQ=255) gtctggtGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTgcag < 1:202841/139‑1 (MQ=255) gtctggtGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTgcag < 1:227694/139‑1 (MQ=255) gtGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTg < 1:1072270/131‑1 (MQ=255) gtGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTg > 2:1072270/1‑131 (MQ=255) aaGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCt < 1:338454/139‑1 (MQ=255) gcTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTgcag < 1:32909/116‑1 (MQ=255) gcTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTgcag > 2:32909/1‑116 (MQ=255) tCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCtt < 1:892722/139‑1 (MQ=255) ggCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGtcat > 1:329171/1‑85 (MQ=255) ggCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGtcat < 2:329171/85‑1 (MQ=255) ccccTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGaataa > 2:960325/1‑139 (MQ=255) aTTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTg > 2:41342/1‑139 (MQ=255) ccATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCt > 1:835654/1‑75 (MQ=255) ccATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCt < 2:835654/75‑1 (MQ=255) attaGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGAt < 1:254912/133‑1 (MQ=255) attaGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGAt > 2:254912/1‑133 (MQ=255) ttaGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACgca < 1:396921/139‑1 (MQ=255) gCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTg > 1:80461/1‑139 (MQ=255) gCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCACTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACt < 2:211982/138‑1 (MQ=255) gCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCACTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACt > 1:211982/1‑138 (MQ=255) gTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCt > 1:532907/1‑61 (MQ=255) gTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCt < 2:532907/61‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTa > 1:118035/1‑139 (MQ=255) tATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGAt > 2:516669/1‑121 (MQ=255) tATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGAt < 1:516669/121‑1 (MQ=255) gCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAggg < 2:80461/139‑1 (MQ=255) cgccAGACCAGCGGATCAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACt > 1:932295/1‑139 (MQ=255) cGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTg < 1:887280/39‑1 (MQ=255) cGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTg > 2:887280/1‑39 (MQ=37) ggATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGAt > 2:83209/1‑94 (MQ=255) ggATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGAt < 1:83209/94‑1 (MQ=255) | CGTTACAGGCACATGAACATCAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACT > NC_000913/1841764‑1842017 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |