| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,434,577 | G→A | A122T (GCA→ACA) | fmt → | 10‑formyltetrahydrofolate:L‑methionyl‑tRNA(fMet) N‑formyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,434,577 | 0 | G | A | 100.0% | 120.9 / NA | 38 | A122T (GCA→ACA) | fmt | 10‑formyltetrahydrofolate:L‑methionyl‑tRNA(fMet) N‑formyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (16/22); total (16/22) | |||||||||||
AACTGCAGGCTGATGTTATGGTCGTCGTCGCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTA > NC_000913/3434452‑3434712 | aaCTGCAGGCTGATGTTATGGTCGTCGTCGCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTACACCAATCCAACg < 2:567855/139‑1 (MQ=255) aTGTTATGGTCGTCGTCGCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGTAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTACACCAATCCAACGCTCACTATGGGc > 1:716828/1‑139 (MQ=255) tGTTATGGTCGTCGTCGCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTACACCAATCCAACGCTCACTATGGGCg > 2:1017219/1‑139 (MQ=255) aTGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTACACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGgtgt < 1:1017219/139‑1 (MQ=255) aTGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTACACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGgtgt < 1:447287/139‑1 (MQ=255) tAATTCTGCCGAAAGTAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTACACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTAGTGTGACCAt < 2:716828/139‑1 (MQ=255) gCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTacac > 2:490549/1‑83 (MQ=255) gCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTacac < 1:490549/83‑1 (MQ=255) gCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTACACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCaa > 1:850095/1‑139 (MQ=255) gCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTACACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATg < 1:868596/139‑1 (MQ=255) tGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTACACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGttt < 2:850095/139‑1 (MQ=255) agaTGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTACACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGa < 1:960893/139‑1 (MQ=255) gTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTACACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGa > 1:1099404/1‑139 (MQ=255) cTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTACACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGata < 2:313284/139‑1 (MQ=255) tATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTACACCAATcc < 1:686552/53‑1 (MQ=255) tATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTACACCAATcc > 2:686552/1‑53 (MQ=255) cGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTACACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGctc > 1:796762/1‑139 (MQ=255) cATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTACACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGgtgt < 1:143183/80‑1 (MQ=255) cATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTACACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGgtgt > 2:143183/1‑80 (MQ=255) cATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTACACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATg < 1:346260/123‑1 (MQ=255) cATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTACACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATg > 2:346260/1‑123 (MQ=255) cATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTACACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCt > 2:1095185/1‑139 (MQ=255) tGGTTCACTGCTGCCGCGCTGGCGCGGAGCTACAGCAATCCATCGCACACTATGGGCGGGTGAGGCAGAAACAGGTGTGACCCTTATGCAAACGGATGTCGGTTTAGACACTGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGc < 2:71116/139‑1 (MQ=255) cACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTACACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGt < 1:886162/56‑1 (MQ=255) cACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTACACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGt > 2:886162/1‑56 (MQ=255) aCTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTACACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGgtgt < 2:1083540/72‑1 (MQ=255) aCTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTACACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGgtgt > 1:1083540/1‑72 (MQ=255) tgctgcCACGCTGGCGCGGTGCTACACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGaaa > 1:229329/1‑63 (MQ=255) tgctgcCACGCTGGCGCGGTGCTACACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGaaa < 2:229329/63‑1 (MQ=255) ctgcCACGCTGGCGCGGTGCTACACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTg < 1:487856/139‑1 (MQ=255) tgcCACGCTGGCGCGGTGCTACACCAATCCAACGCTCACTATgg > 2:873277/1‑44 (MQ=255) tgcCACGCTGGCGCGGTGCTACACCAATCCAACGCTCACTATgg < 1:873277/44‑1 (MQ=255) aCGCTGGCGCGGTGCTACACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCagaa < 2:317601/139‑1 (MQ=255) gCTGGCGCGGTGCTACACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCagaaga < 1:1010166/139‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGCTACACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGacac > 1:561727/1‑93 (MQ=255) cTGGCGCGGTGCTACACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGacac < 2:561727/93‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGCTACACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATg > 1:873990/1‑103 (MQ=255) cTGGCGCGGTGCTACACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATg < 2:873990/103‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGCTACACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGa > 2:778795/1‑88 (MQ=255) ggCGCGGTGCTACACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGa < 1:778795/88‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGCTACACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATAc < 2:969133/139‑1 (MQ=255) gctacACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTa < 1:1095185/139‑1 (MQ=255) | AACTGCAGGCTGATGTTATGGTCGTCGTCGCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTA > NC_000913/3434452‑3434712 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |