| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1287084 | 5 (0.080) | 54 (1.050) | 29/162 | 0.6 | 71.5% | noncoding (153/171 nt) | rttR | rtT sRNA, processed from tyrT transcript |
| ? | NC_000913 | 1287557 = | 39 (0.760) | noncoding (66/85 nt) | tyrT | tRNA‑Tyr | |||||
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
TGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACGCG > NC_000913/1287421‑1287690 | caacgctctctcgctggcgctcgagccgaaccttaatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGa > 2:751510‑M2/137‑139 (MQ=255) gctctctcgctagcgctcgagccgaaccttaatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCt < 1:1095197‑M2/7‑1 (MQ=255) ctcGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTc > 2:1588039/1‑139 (MQ=255) ggcgctcgagccgaaccttaatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGAt < 1:1541476‑M2/18‑1 (MQ=255) gcgctcgagccgaaccttaatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGaa < 2:646527‑M2/4‑1 (MQ=255) cTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATg > 2:1314311/1‑139 (MQ=255) ttCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGAc > 1:126834/1‑139 (MQ=255) gagccgaaccttaatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCa < 2:1511142‑M2/25‑1 (MQ=255) ttAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTg < 2:126834/139‑1 (MQ=255) atcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTg < 1:1235428‑M2/38‑1 (MQ=255) atcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTg < 2:1256378‑M2/38‑1 (MQ=255) aGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGAt > 2:145678/1‑117 (MQ=255) aGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGAt < 1:145678/117‑1 (MQ=255) gcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCt > 1:336373‑M2/96‑139 (MQ=255) aCCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTc < 1:342084/139‑1 (MQ=255) tccccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTg > 2:701115‑M2/84‑121 (MQ=255) tccccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTg < 1:701115‑M2/38‑1 (MQ=255) tccccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGc > 1:1008128‑M2/84‑132 (MQ=255) tccccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGc < 2:1008128‑M2/49‑1 (MQ=255) ccccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCggg > 2:1287721‑M2/83‑139 (MQ=255) cTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCggg < 1:1588039/139‑1 (MQ=255) ccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGaa < 1:751510‑M2/59‑1 (MQ=255) gcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGc > 1:122022‑M2/79‑127 (MQ=255) gcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGc < 2:122022‑M2/49‑1 (MQ=255) gcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAc < 1:1370877‑M2/60‑1 (MQ=255) gcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAc > 2:1370877‑M2/79‑138 (MQ=255) gggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCccac > 1:805830‑M2/75‑139 (MQ=255) tGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGAt < 2:763756/87‑1 (MQ=255) tGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCgg > 1:1064893/1‑125 (MQ=255) tGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACgg > 2:1157072/1‑139 (MQ=255) tGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGCTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCgg < 2:1064893/125‑1 (MQ=255) gaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAggg < 2:895834‑M2/70‑1 (MQ=255) cAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACgggg > 2:130228/1‑139 (MQ=255) atatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGt < 2:805830‑M2/72‑1 (MQ=255) atatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGt > 2:1549672‑M2/68‑139 (MQ=255) ttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTg < 2:760096‑M2/38‑1 (MQ=255) ttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTg > 1:760096‑M2/64‑101 (MQ=255) tgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTg < 2:366551‑M2/38‑1 (MQ=255) tgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTg > 1:366551‑M2/63‑100 (MQ=255) tgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTaattc > 2:1215361‑M2/63‑137 (MQ=255) cacaATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGaa > 1:1572360/1‑118 (MQ=255) cacaATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGaa < 2:1572360/118‑1 (MQ=255) tgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCccacc < 2:186761‑M2/66‑1 (MQ=255) cggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGa > 1:966758‑M2/57‑59 (MQ=255) cggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGc < 2:1578659‑M2/49‑1 (MQ=255) cggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGc > 1:1578659‑M2/57‑105 (MQ=255) cggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCa‑ggggtaattcaaattt > 2:544402‑M2/57‑131 (MQ=255) gattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCggg > 1:1045058‑M2/55‑111 (MQ=255) tcACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTg > 2:908484/1‑90 (MQ=255) tcACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTg < 1:908484/90‑1 (MQ=255) cGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCt < 1:723177/139‑1 (MQ=255) gTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCccacca > 2:58075/1‑111 (MQ=255) gTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCccacca < 1:58075/111‑1 (MQ=255) gTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTc > 2:206164/1‑139 (MQ=255) gagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCa < 2:245266‑M2/25‑1 (MQ=255) gagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCa > 1:245266‑M2/44‑68 (MQ=255) agggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTg > 2:1328137‑M2/38‑75 (MQ=255) agggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTg < 1:1328137‑M2/38‑1 (MQ=255) cGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGa < 2:443398/37‑1 (MQ=255) cGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGa > 1:443398/1‑37 (MQ=255) cGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACa < 2:1350587/67‑1 (MQ=255) cGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACa > 1:1350587/1‑67 (MQ=255) cttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCg > 1:619315‑M2/33‑83 (MQ=255) cttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCg < 2:619315‑M2/51‑1 (MQ=255) tttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAc < 1:321409‑M2/60‑1 (MQ=255) tttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAc > 2:321409‑M2/31‑90 (MQ=255) gtggtgAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACt > 1:582437/1‑116 (MQ=255) ttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAc < 1:1673233‑M2/60‑1 (MQ=255) tggtgAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCg > 2:1233878/1‑39 (MQ=255) tggtgAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCg < 1:1233878/39‑1 (MQ=255) aaTTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCggg > 2:1047603/1‑81 (MQ=35) aaTTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCggg < 1:1047603/81‑1 (MQ=35) aaTTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAcc > 1:1311034/1‑85 (MQ=35) aaTTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAcc < 2:1311034/85‑1 (MQ=35) aaTTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCt > 2:616267/1‑115 (MQ=255) aaTTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCt < 1:616267/115‑1 (MQ=255) tgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTg > 2:389178‑M2/23‑60 (MQ=255) tATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACgg > 1:521010/1‑44 (MQ=32) tATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACgg < 2:521010/44‑1 (MQ=32) tggtggtgggggaaggattCGAACCTTTGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCg > 2:1010557‑M2/20‑74 (MQ=255) tggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGa < 2:720759‑M2/17‑1 (MQ=255) tggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGa > 1:720759‑M2/20‑36 (MQ=255) tggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCg < 1:1010557‑M2/55‑1 (MQ=255) tggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCgggg < 2:295598‑M2/113‑1 (MQ=255) tggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCgggg > 1:295598‑M2/20‑132 (MQ=255) gtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGc > 2:1573018‑M2/18‑106 (MQ=255) gtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCGCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGc < 1:1573018‑M2/89‑1 (MQ=255) gtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCgggg < 2:327581‑M2/113‑1 (MQ=255) gtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCgggg > 1:327581‑M2/15‑127 (MQ=255) tgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACg > 2:688169‑M2/14‑35 (MQ=255) tgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACg < 1:688169‑M2/22‑1 (MQ=255) ggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACa < 2:1108670‑M2/33‑1 (MQ=255) aggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTg > 1:1673831‑M2/7‑44 (MQ=255) aggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTg < 2:1673831‑M2/38‑1 (MQ=255) ggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGAcgcg < 1:1157072‑M2/134‑1 (MQ=255) attCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCggg < 2:1552613‑M2/57‑1 (MQ=255) attCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAc > 1:1416840‑M2/4‑63 (MQ=255) attCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAc < 2:1416840‑M2/60‑1 (MQ=255) cGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGc > 2:1023886/1‑89 (MQ=255) cGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGc < 1:1023886/89‑1 (MQ=255) | TGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACGCG > NC_000913/1287421‑1287690 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |