Missing coverage evidence... | ||||||||||
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AGTGGAGCAAAATGTTGTTAAAGTGGAAAAATGATAAAAAAGTAAGTTTATTATATTACATTTTACCATTTAAATTTTGGTTGTCTTTAAGAACTGATATCGCTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTATGTTTCCTTCAATGTAATCAAGCAATGTTCTGGTATTGATAGGTCTTCCCTGTTTTGCTACTTCCACTACAGCATCCCCTAGGATAATTCTTACTTCA > NC_000913/1433936‑1434180 | aGTGGAGCAAAATGTTGTTAAAGTGGAAAAATGATAAAAAAGTAAGTTTATTATATTACATTTTACCATTTAAATTTTGGTTGTCTTTAAGAACTGATATCGCTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGt < 2:1252902/139‑1 (MQ=31) tCTTTAAGAACTGATATCGCTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTATGTTTCCTTCAATGTAATCAAGCa < 1:1158019/88‑1 (MQ=35) tCTTTAAGAACTGATATCGCTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTATGTTTCCTTCAATGTAATCAAGCa > 2:1158019/1‑88 (MQ=35) cTGATATCGCTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTATGTTTCCTTCAATGTAATCAAGCAATGTTCTGGTATTGATAGGTCTTCCCTGTTTTGCTACTTCCACTACAGc < 2:507506/127‑1 (MQ=32) cTGATATCGCTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTATGTTTCCTTCAATGTAATCAAGCAATGTTCTGGTATTGATAGGTCTTCCCTGTTTTGCTACTTCCACTACAGc > 1:507506/1‑127 (MQ=33) cTGATATCGCTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTATGTTTCCTTCAATGTAATCAAGCAATGTTCTGGTATTGATAGGTCTTCCCTGTTTTGCTACTTCCACTACAGCATCCCCTAGGAt > 1:1626006/1‑139 (MQ=33) gATATCGCTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTATGTTTcc < 2:886568/59‑1 (MQ=38) gATATCGCTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTATGTTTcc > 1:886568/1‑59 (MQ=35) cTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTATGTTTCCTTCAATGTAATCAAGCAATGTTCTGGTATTGATAGGTCTTCCCTGTTTTGCTACTTCCACTACAGc < 1:616478/118‑1 (MQ=33) cTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTATGTTTCCTTCAATGTAATCAAGCAATGTTCTGGTATTGATAGGTCTTCCCTGTTTTGCTACTTCCACTACAGc > 2:616478/1‑118 (MQ=32) gTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTATGTTTCCTTCAATGTAATCAAGCAATGTTCTGGTATTGATAGGTCTTCCCTGTTTTGCTACTTCCACTACAGCa < 1:385494/117‑1 (MQ=32) gTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTATGTTTCCTTCAATGTAATCAAGCAATGTTCTGGTATTGATAGGTCTTCCCTGTTTTGCTACTTCCACTACAGCa > 2:385494/1‑117 (MQ=33) ttGTAATAATTCTTTGTTATCCAGTCATGATGTTTTCTTTATGTTTCCTTCAATGTAATCAAGCAATGTTCTGGTATTGATAGGTCTTCCCTGTTTTGCTACTTCCACTACAGCATCCCCTAGGATAATTCTTa < 2:367084/134‑1 (MQ=17) ttGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTATGTTTCCTTCAATGTAATCAAGCa > 2:1135179/1‑65 (MQ=35) ttGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTATGTTTCCTTCAATGTAATCAAGCa < 1:1135179/65‑1 (MQ=37) ttGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTATGTTTCCTTCAATGTAATCAAGCAATGtt < 2:1369172/70‑1 (MQ=37) ttGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTATGTTTCCTTCAATGTAATCAAGCAATGtt > 1:1369172/1‑70 (MQ=35) ttGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTATGTTTCCTTCAATGTAATCAAGCAATGTTCTGGTATTGATAGGTCTTCCCTGTTTTGCTACTTCCACTACAGCATCCCCTAGGATAATTCTTa > 1:367084/1‑134 (MQ=32) ttGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTATGTTTCCTTCAATGTAATCAAGCAATGTTCTGGTATTGATAGGTCTTCCCTGTTTTGCTACTTCCACTACAGCATCCCCTAGGATAATTCTTACTTCa > 1:1411833/1‑139 (MQ=33) | AGTGGAGCAAAATGTTGTTAAAGTGGAAAAATGATAAAAAAGTAAGTTTATTATATTACATTTTACCATTTAAATTTTGGTTGTCTTTAAGAACTGATATCGCTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTATGTTTCCTTCAATGTAATCAAGCAATGTTCTGGTATTGATAGGTCTTCCCTGTTTTGCTACTTCCACTACAGCATCCCCTAGGATAATTCTTACTTCA > NC_000913/1433936‑1434180 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |