| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,454,292 | C→A | G122G (GGC→GGA) | paaA → | ring 1,2‑phenylacetyl‑CoA epoxidase subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,454,292 | 0 | C | A | 100.0% | 146.2 / NA | 46 | G122G (GGC→GGA) | paaA | ring 1,2‑phenylacetyl‑CoA epoxidase subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (22/24); total (22/24) | |||||||||||
ATAGCGCCGCCGAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGA > NC_000913/1454165‑1454390 | ataGCGCCGCCGAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGa < 2:511124/139‑1 (MQ=255) cgccgcCGAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGCTATCGGTGTTATCGTATGGCTGGTGGa > 1:1241586/1‑135 (MQ=255) cgccgcCGAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGa < 2:1241586/135‑1 (MQ=255) cgccgAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCggatggc > 2:855036/1‑125 (MQ=255) cgccgAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCggatggc < 1:855036/125‑1 (MQ=255) cgcCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATc < 1:499453/134‑1 (MQ=255) cgcCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATc > 2:499453/1‑134 (MQ=255) gCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCg < 1:1225756/139‑1 (MQ=255) cTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCg < 1:266173/114‑1 (MQ=255) cTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCg > 2:266173/1‑114 (MQ=255) cTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGt > 1:1415749/1‑139 (MQ=255) cggacggaTGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAGTCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATg > 1:319634/1‑128 (MQ=255) cggacggaTGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAGTCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATg < 2:319634/128‑1 (MQ=255) cggaTGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCagag < 2:1415749/139‑1 (MQ=255) cctccATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTa < 2:781718/95‑1 (MQ=255) cctccATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTa > 1:781718/1‑95 (MQ=255) cTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGc > 1:665503/1‑66 (MQ=255) cTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGc < 2:665503/66‑1 (MQ=255) aaTTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAAt < 2:1048211/72‑1 (MQ=255) aaTTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATAGCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAAt > 1:1048211/1‑72 (MQ=255) tCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGAt < 1:1357271/60‑1 (MQ=255) tCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGAt > 2:1357271/1‑60 (MQ=255) tCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGAGCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCg > 1:1269266/1‑100 (MQ=255) tCCGACATGGGGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCg < 2:1269266/100‑1 (MQ=255) atatCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGa > 1:1222506/1‑39 (MQ=255) atatCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGa < 2:1222506/39‑1 (MQ=38) atatCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATc > 1:724946/1‑41 (MQ=255) atatCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATc < 2:724946/41‑1 (MQ=255) atatCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCaa < 1:1083018/46‑1 (MQ=255) atatCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCaa > 2:1083018/1‑46 (MQ=255) atatCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCAc > 2:373315/1‑67 (MQ=255) atatCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCAc < 1:373315/67‑1 (MQ=255) atatCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTa < 2:411511/82‑1 (MQ=255) atatCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTa > 1:411511/1‑82 (MQ=255) atatCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCagag < 2:846549/90‑1 (MQ=255) atatCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCagag > 1:846549/1‑90 (MQ=255) atatCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAAt < 2:1637750/94‑1 (MQ=255) atatCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAAt > 1:1637750/1‑94 (MQ=255) atatCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAagaaga > 2:865706/1‑115 (MQ=255) atatCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAagaaga < 1:865706/115‑1 (MQ=255) ggTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCg > 1:1100975/1‑75 (MQ=255) ggTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCg < 2:1100975/75‑1 (MQ=255) gtgtTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTa > 1:443713/1‑76 (MQ=255) gtgtTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTa < 2:443713/76‑1 (MQ=255) tgtTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGc > 1:705857/1‑55 (MQ=255) tgtTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGc < 2:705857/55‑1 (MQ=255) ttATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCa > 1:813700/1‑99 (MQ=255) ttATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCa < 2:813700/99‑1 (MQ=255) | ATAGCGCCGCCGAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGA > NC_000913/1454165‑1454390 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |