Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,551,799 | C→T | I154I (ATC→ATT) | fdnI → | formate dehydrogenase‑N, cytochrome B556 (gamma) subunit, nitrate‑inducible |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,551,799 | 0 | C | T | 100.0% | 241.5 / NA | 74 | I154I (ATC→ATT) | fdnI | formate dehydrogenase‑N, cytochrome B556 (gamma) subunit, nitrate‑inducible |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (34/40); total (34/40) |
CAACGCCGGGCAAAAGATGATGTTCTGGTCGATCATGAGCATGATTTTCGTGCTGCTGGTGACCGGGGTGATTATCTGGCGTCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATCCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCTGATCCATATGTATATGGCATTTTGGGTGAAAGGATCGATTAAAGGGATGATCGAAGGGAAGGTAAGTCGTCGCTGGGCGAAGAAACACCAT > NC_000913/1551664‑1551928 | cAACGCCGGGCAAAAGATGATGTTCTGGTCGATCATGAGCATGATTTTCGTGCTGCTGGTGACCGGGGTGATTATCTGGCGTCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCAc < 1:716515/139‑1 (MQ=255) cGCCGGGCAAAAGATGATGTTCTGGTCGATCATGAGCATGATTTTCGTGCTGCTGGTGACCGGGGTGATTATCTGGCGTCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCAcgcg > 2:106143/1‑139 (MQ=255) ggCAAAAGATGATGTTCTGGTCGATCATGAGCATGATTTTCGTGCTGCTGGTGACCGGGGTGATTATCTGGCGTCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGc > 1:1225906/1‑139 (MQ=255) ggCAAAAGATGATGTTCTGGTCGATCATGAGCATGATTTTCGTGCTGCTGGTGACCGGGGTGATTATCTGGCGTCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGc > 1:1227972/1‑139 (MQ=255) ggCAAAAGATGATGTTCTGGTCGATCATGAGCATGATTTTCGTGCTGCTGGTGACCGGGGTGATTATCTGGCGTCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGc < 2:1227972/139‑1 (MQ=255) aaGATGATGTTCTGGTCGATCATGAGCATGATTTTCGTGCTGCTGGTGACCGGGGTGATTATCTGGCGTCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTa < 2:1225906/139‑1 (MQ=255) gatgTTCTGGTCGATCATGAGCATGATTTTCGTGCTGCTGGTGACCGGGGTGATTATCTGGCGTCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTatcatc < 1:1442078/139‑1 (MQ=255) atgTTCTGGTCGATCATGAGCATGATTTTCGTGCTGCTGGTGACCGGGGTGATTATCTGGCGTCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCgg > 1:1607632/1‑124 (MQ=255) atgTTCTGGTCGATCATGAGCATGATTTTCGTGCTGCTGGTGACCGGGGTGATTATCTGGCGTCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCgg < 2:1369753/124‑1 (MQ=255) atgTTCTGGTCGATCATGAGCATGATTTTCGTGCTGCTGGTGACCGGGGTGATTATCTGGCGTCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCgg > 1:1369753/1‑124 (MQ=255) atgTTCTGGTCGATCATGAGCATGATTTTCGTGCTGCTGGTGACCGGGGTGATTATCTGGCGTCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCgg < 2:1607632/124‑1 (MQ=255) tCTGGTCGATCATGAGCATGATTTTCGTGCTGCTGGTGACCGGGGTGATTATCTGGCGTCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGAt > 1:1019230/1‑139 (MQ=255) tGGTCGATCATGAGCATGATTTTCGTGCTGCTGGTGACCGGGGTGATTATCTGGCGTCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATcc > 2:522160/1‑139 (MQ=255) tCGATCATGAGCATGATTTTCGTGCTGCTGGTGACCGGGGTGATTATCTGGCGTCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACg < 2:57743/139‑1 (MQ=255) cGATCATGAGCATGATTTTCGTGCTGCTGGTGACCGGGGTGATTATCTGGCGTCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGc < 2:1029458/139‑1 (MQ=255) tCATGAGCATGATTTTCGTGCTGCTGGTGACCGGGGTGATTATCTGGCGTCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCAt > 1:1055952/1‑139 (MQ=255) cATGAGCATGATTTTCGTGCTGCTGGTGACCGGGGTGATTATCTGGCGTCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATc < 1:106143/139‑1 (MQ=255) gatacagttttCGTGCTGCTTGTGACCGGTGTTATTATCTGGCTTCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCATGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCCGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCTGa < 2:1050382/132‑1 (MQ=255) aGCATGATTTTCGTGCTGCTGGTGACCGGGGTGATTATCTGGCGTCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCTGa < 2:1019230/139‑1 (MQ=255) gATTTTCGTGCTGCTGGTGACCGGGGTGATTATCTGGCGTCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCTGATCCat > 1:636047/1‑139 (MQ=255) aTTTTCGTGCTGCTGGTGACCGGGGTGATTATCTGGCGTCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCTGa < 2:176249/133‑1 (MQ=255) aTTTTCGTGCTGCTGGTGACCGGGGTGATTATCTGGCGTCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCTGa > 1:176249/1‑133 (MQ=255) tgctgcTGGTGACCGGGGTGATTATCTGGCGTCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCTGATCCATATGTatat < 1:995568/139‑1 (MQ=255) ctgGTGACCGGGGTGATTATCTGGCGTCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCTGATCCATATGTATATGGCAt > 2:35019/1‑139 (MQ=255) ctgGTGACCGGGGTGATTATCTGGCGTCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGAAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATAATCCTGATCCACGCCATCCTGATCCATATGTATCTgtctc > 1:1050382/1‑135 (MQ=255) ggggTGATTATCTGGCGTCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCTGATCCATATGTATATGGCATTTTGGGTGa < 1:522160/139‑1 (MQ=255) gggTGATTATCTGGCGTCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTa < 1:557511/87‑1 (MQ=255) gggTGATTATCTGGCGTCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTa > 2:557511/1‑87 (MQ=255) gggTGATTATCTGGCGTCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCTGATc > 2:843649/1‑113 (MQ=255) gggTGATTATCTGGCGTCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCTGATc > 2:274483/1‑113 (MQ=255) gggTGATTATCTGGCGTCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCTGATc < 1:843649/113‑1 (MQ=255) gggTGATTATCTGGCGTCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCTGATc < 1:274483/113‑1 (MQ=255) gggTGATTATCTGGCGTCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCTGATCCATATGTATATGGCATTTTGGGTGaa > 2:726141/1‑139 (MQ=255) aTTATCTGGCGTCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCgg > 1:1321031/1‑79 (MQ=255) aTTATCTGGCGTCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCgg < 2:1321031/79‑1 (MQ=255) ttATCTGGCGTCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCTGATCCATATGTATATGGCATTTTGGGTGAAAGGATc < 2:1055952/139‑1 (MQ=255) ttATCTGGCGTCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCTGATCCATATGTATATGGCATTTTGGGTGAAAGGATc < 1:35019/139‑1 (MQ=255) tCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCTGATCCATATGTATATGGCATTTTGGGTGa < 2:1660722/122‑1 (MQ=255) tCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCTGATCCATATGTATATGGCATTTTGGGTGa > 1:1660722/1‑122 (MQ=255) ccGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCTGATCCATATGTATATGGCATTTTGGGTGAAAGGATCGATTAAAGGga < 2:636047/139‑1 (MQ=255) cGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTat < 1:854135/70‑1 (MQ=255) cGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTat > 2:854135/1‑70 (MQ=255) cGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTa > 1:500769/1‑69 (MQ=255) cGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTa < 2:500769/69‑1 (MQ=255) cGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATcc > 1:326361/1‑90 (MQ=255) cGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATcc < 2:326361/90‑1 (MQ=255) ttGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCt > 1:1481179/1‑85 (MQ=255) ttGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCt < 2:1481179/85‑1 (MQ=255) tGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCTGATc > 2:230831/1‑88 (MQ=255) tGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCTGATc < 1:230831/88‑1 (MQ=255) tGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCTGATCCATATGTATATGGCATTTTGGGTGAAAGGATCGATTAAAGGGATGATCgaa < 1:726141/139‑1 (MQ=255) cgcAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGAt > 1:1388001/1‑70 (MQ=255) cgcAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGAt < 2:1388001/70‑1 (MQ=255) cgcAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCTGATc > 2:943328/1‑86 (MQ=255) cgcAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCTGATc < 1:943328/86‑1 (MQ=255) tACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCTGATCCATATGTATATGGCATTTTGGGTGAAAGGATCGATTAAAggg > 1:438976/1‑123 (MQ=255) tACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCTGATCCATATGTATATGGCATTTTGGGTGAAAGGATCGATTAAAggg < 2:438976/123‑1 (MQ=255) cccGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTat < 2:146103/51‑1 (MQ=255) cccGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTat > 1:146103/1‑51 (MQ=255) tGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACg < 1:1135752/60‑1 (MQ=255) tGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACg > 2:1135752/1‑60 (MQ=255) gCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCTGATCCATATGTATATGGCATTTTGGGTGAAAGGATCGATTAAAGGGATGATCGAAGGGAAGGTAAGTCGTCGc < 2:876144/139‑1 (MQ=255) gttgttCGCTACAGCCTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCTGATCCATATGTATATGGCATTTTGGGTGAAAGGATCGATTAAAGGGATGATCGAAGGGAAGGTAAGTCGTCGCTggg < 2:1692365/139‑1 (MQ=255) ccTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCTGa > 2:1374069/1‑50 (MQ=255) ccTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCTGa < 1:1374069/50‑1 (MQ=255) ccTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCTGATCCATATGTATATGGCATTTTGGGTGAAAGGATCGATTAAAGGga > 2:386395/1‑95 (MQ=255) ccTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCTGATCCATATGTATATGGCATTTTGGGTGAAAGGATCGATTAAAGGga < 1:386395/95‑1 (MQ=255) ccTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCTGATCCATATGTATATGGCATTTTGGGTGAAAGGATCGATTAAAGGGATGATCGAAGGGAAGGTAAGTCGTCGCTGGGCGAAGAAACACCAt > 1:502376/1‑139 (MQ=255) ccTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCTGATCCATATGTATATGGCATTTTGGGTGAAAGGATCGATTAAAGGGATGATCGAAGGGAAGGTAAGACGTCGCTGGGCgaa > 1:1337177/1‑129 (MQ=255) ccTGCTGATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCTGATCCATATGTATATGGCATTTTGGGTGAAAGGATCGATTAAAGGGATGATCGAAGGGAAGGTAAGACGTCGCTGGGCgaa < 2:1337177/129‑1 (MQ=255) gctgATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATcc > 2:835417/1‑44 (MQ=255) gctgATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATcc < 1:835417/44‑1 (MQ=255) ctgATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCTGATCCATATGTATATGGCATTTTGGGTGAAAGGATCGa > 1:1244414/1‑82 (MQ=255) ctgATTCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCTGATCCATATGTATATGGCATTTTGGGTGAAAGGATCGa < 2:1244414/82‑1 (MQ=255) | CAACGCCGGGCAAAAGATGATGTTCTGGTCGATCATGAGCATGATTTTCGTGCTGCTGGTGACCGGGGTGATTATCTGGCGTCCGTACTTTGCGCAGTACTTCCCGATGCAGGTTGTTCGCTACAGCCTGCTGATCCACGCGGCTGCGGGTATCATCCTGATCCACGCCATCCTGATCCATATGTATATGGCATTTTGGGTGAAAGGATCGATTAAAGGGATGATCGAAGGGAAGGTAAGTCGTCGCTGGGCGAAGAAACACCAT > NC_000913/1551664‑1551928 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |