Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,767,179 | G→A | *281* (TAG→TAA) | yibA → | putative immunity protein for polymorphic toxin RhsA, HEAT‑domain protein, lethality reduction protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,767,179 | 0 | G | A | 100.0% | 240.1 / NA | 74 | *281* (TAG→TAA) | yibA | putative immunity protein for polymorphic toxin RhsA, HEAT‑domain protein, lethality reduction protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (41/33); total (41/33) |
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atgaCAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAACGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGgtg > 1:1199080/1‑139 (MQ=255) aaTGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAACGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGgtgagtga > 1:992787/1‑139 (MQ=255) aaTGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAACGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGgtgagtga > 1:682467/1‑139 (MQ=255) aaaTTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAACGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGaa < 2:1093613/139‑1 (MQ=255) aaaTTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAACGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGaa < 2:603013/139‑1 (MQ=255) aCTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAACGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGccgccg < 2:1099118/139‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |