| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,104,494 | C→T | V6I (GTC→ATC) *197* (TAG→TAA) |
wbbK ← wbbJ ← |
lipopolysaccharide biosynthesis protein putative lipopolysaccharide biosynthesis O‑acetyl transferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,104,494 | 0 | C | T | 100.0% | 80.4 / NA | 26 | V6I (GTC→ATC) *197* (TAG→TAA) | wbbK wbbJ | lipopolysaccharide biosynthesis protein putative lipopolysaccharide biosynthesis O‑acetyl transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (13/13); total (13/13) | |||||||||||
ACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAAACTGACATTTTCTTTATTATTAGTTGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAATTGGCGCCGACTACGACTCCATTACC > NC_000913/2104360‑2104625 | aCTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAAACTGACATTTTCTTTATTATTAGTTGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGATTATg < 1:491055/139‑1 (MQ=255) tAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAAACTGACATTTTCTTTATTATTAGTTGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGATTATGCTTTTTccc < 1:94377/139‑1 (MQ=255) ctctTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAAACTGACATTTTCTTTATTATTAGTTGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGATTATGCTTTTTCCCATa > 1:136986/1‑139 (MQ=255) tttAGCAGAATGGACTAATGCGATAAAACTGACATTTTCTTTATTATTAGTTGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGATTATGCTTTTTCCCATAAtt > 2:9806/1‑139 (MQ=255) gCAGAATGGACTAATGCGATAAAACTGACATTTTCTTTATTATTAGTTGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGATTATGCTTTTTCCCATAATTTGGt < 2:551822/139‑1 (MQ=255) tGGACTAATGCGATAAAACTGACATTTTCTTTATTATTAGTTGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGATTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATg > 1:680905/1‑139 (MQ=255) ggACTAATGCGATAAAACTGACATTTTCTTTATTATTAGTTGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGATTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGa < 2:680905/139‑1 (MQ=255) aCTAATGCGATAAAACTGACATTTTCTTTATTATTAGTTGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGATTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGAtt > 2:533940/1‑139 (MQ=255) tAATGCGATAAAACTGACATTTTCTTTATTATTAGTTGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGATTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGt < 1:533940/139‑1 (MQ=255) tGCGATAAAACTGACATTTTCTTTATTATTAGTTGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGATTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTAtt > 2:714775/1‑139 (MQ=255) ttattaGTTGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGATTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTcc < 2:136986/139‑1 (MQ=255) aGTTGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACAGCAGAAACAACGATTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCaa > 2:791016/1‑139 (MQ=255) ctgcCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGATTATGCTTTTTCCCATAATTTGGtct > 1:123088/1‑92 (MQ=255) ctgcCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGATTATGCTTTTTCCCATAATTTGGtct < 2:123088/92‑1 (MQ=255) ctgcCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGATTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACa > 1:378436/1‑139 (MQ=255) aaaTGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGATTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGaa < 2:378436/139‑1 (MQ=255) aCCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGATTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCAt < 2:28644/64‑1 (MQ=255) aCCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGATTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCAt > 1:28644/1‑64 (MQ=255) aCCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGATTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGAtttt > 1:771021/1‑86 (MQ=255) aCCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGATTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGAtttt < 2:771021/86‑1 (MQ=255) cGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGATTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGaa > 1:346138/1‑139 (MQ=255) cGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGATTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGaa > 1:408095/1‑139 (MQ=255) aaaaTTGACCGCAGAAACAACGATTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAATTGGCGCCGa > 1:389985/1‑139 (MQ=255) gACCGCAGAAACAACGATTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAATTGGCGCCGACTACGa < 2:74622/139‑1 (MQ=255) cAGAAACAACGATTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAATTGGCGCCGACTACGACTCCa < 2:346138/139‑1 (MQ=255) acaacGATTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAATTGGCGCCGACTACGACTCCATTAcc < 1:714775/139‑1 (MQ=255) | ACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAAACTGACATTTTCTTTATTATTAGTTGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAATTGGCGCCGACTACGACTCCATTACC > NC_000913/2104360‑2104625 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |