| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,331,634 | C→T | A378V (GCG→GTG) | proP → | proline/glycine betaine transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,331,634 | 0 | C | T | 100.0% | 93.6 / NA | 30 | A378V (GCG→GTG) | proP | proline/glycine betaine transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (14/16); total (14/16) | |||||||||||
CCCTGTTTGTGTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGATGCCTGC > NC_000913/4331502‑4331763 | cccTGTTTGTGTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGtt > 2:789856/1‑139 (MQ=255) cTGTTTGTGTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATACTGGCGGTGATTCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTcc < 1:520039/139‑1 (MQ=255) tttGTGTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGa > 1:286042/1‑139 (MQ=255) gtTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCat < 1:789856/139‑1 (MQ=255) gtTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCat < 1:57479/139‑1 (MQ=255) gATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATGTTTGCCTGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTgtcggcg < 1:584695/139‑1 (MQ=255) tAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAat > 1:389124/1‑139 (MQ=255) cTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGACaa < 1:458590/139‑1 (MQ=255) tGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACAGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTggcgg < 1:460861/90‑1 (MQ=255) tGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACAGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTggcgg > 2:460861/1‑90 (MQ=255) ggCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTggcggcg > 1:774095/1‑91 (MQ=255) ggCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTggcggcg < 2:774095/91‑1 (MQ=255) ggCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTggcg > 2:402379/1‑139 (MQ=255) cGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTggcggc > 1:647532/1‑139 (MQ=255) gCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAgcgcg < 2:436518/65‑1 (MQ=255) gCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAgcgcg > 1:436518/1‑65 (MQ=255) cTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGc > 2:400344/1‑139 (MQ=255) cTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGc > 2:210961/1‑139 (MQ=255) tttACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCt < 1:144479/139‑1 (MQ=255) tACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCg < 2:286042/139‑1 (MQ=255) aTGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCat < 1:451673/36‑1 (MQ=255) aTGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCat > 2:451673/1‑36 (MQ=255) cTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGATGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTAGCAGAATCTGATGAtgcc < 1:285477/139‑1 (MQ=255) cTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAAt < 1:683792/128‑1 (MQ=255) cTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAAt > 2:683792/1‑128 (MQ=255) cTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGAtgcc < 1:402379/139‑1 (MQ=255) aCCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGAtgcctg > 2:132120/1‑139 (MQ=255) ccTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGAtgcctgc < 1:132120/139‑1 (MQ=255) tGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCa < 1:91372/118‑1 (MQ=255) tGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCa > 2:91372/1‑118 (MQ=255) | CCCTGTTTGTGTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGATGCCTGC > NC_000913/4331502‑4331763 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |