Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,176,328 | (T)6→5 | intergenic (‑7/+22) | gatZ ← / ← gatY | D‑tagatose 1,6‑bisphosphate aldolase 2, subunit/D‑tagatose 1,6‑bisphosphate aldolase 2, catalytic subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,176,323 | 0 | T | . | 100.0% | 329.8 / NA | 80 | intergenic (‑2/+27) | gatZ/gatY | D‑tagatose 1,6‑bisphosphate aldolase 2, subunit/D‑tagatose 1,6‑bisphosphate aldolase 2, catalytic subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base . (43/37); total (43/37) |
AGCACTTTGCGCGTGCTGTTGCGATCAAATGCCAGCGCCGCTTCGATAACCAACGGATGGGCAGAACAGACTGAACATATGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATGTTTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTCACCACATCGCGCATTGCGGATTTAGCCGACTGCAAATAATCCCGGGGATCGGTCGCTTC > NC_000913/2176197‑2176451 | aGCACTTTGCGCGTGCTGTAGCGATCAAATGCCAGCGCCGCTTCGATAACCAACGGATGGGCAGAATAGACTGAACGTATGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTa < 1:1173436/139‑1 (MQ=255) tttGCGCGTGCTGTTGCGATCAAATGCCAGCGCCGCTTCGATAACCAACGGATGGGCAGAACAGACTGAACATATGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATgg > 1:1262218/1‑139 (MQ=255) tttGCGCGTGCTGTTGCGATCAAATGCCAGCGCCGCTTCGATAACCAACGGATGGGCAGAACAGACTGAACATATGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATgg > 2:240291/1‑139 (MQ=255) tGCGCGTGCTGTTGCGATCAAATGCCAGCGCCGCTTCGATAACCAACGGATGGGCAGAACAGACTGAACATATGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCa > 1:181846/1‑139 (MQ=255) gcgcGTGCTGTTGCGATCAAATGCCAGCGCCGCTTCGATAACCAACGGATGGGCAGAACAGACTGAACATATGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAg < 1:506078/139‑1 (MQ=255) tgcgTGCTGTTGCGATCAAATGCCAGCGCCGCTTCGATAACCAACGGATGGGCAGAACAGACTGAACATATGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAgg > 2:1552972/2‑139 (MQ=255) gcgTGCTGTTGCGATCAAATGCCAGCGCCGCTTCGAGAACCAACGGATGGGCAGAACAGACTGAACATATGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGt < 2:1127268/139‑1 (MQ=255) gTGCTGTTGCGATCAAATGCCAGCGCCGCTTCGATAACCAACGGATGGGCAGAACAGACTGAACATATGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGc > 2:1147960/1‑139 (MQ=255) tGCTGTTGCGATCAAATGCCAGCGCCGCTTCGATAACCAACGGATGGGCAGAACAGACTGAACATATGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCg > 2:835946/1‑139 (MQ=255) aaaTGCCAGCGCCGCTTCGATAACCAACGGATGGGCAGAACAGACTGAACATATGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTAtgccctgccc > 2:1635949/1‑139 (MQ=255) aTGCCAGCGCCGCTTCGATAACCAACGGATGGGCAGAACAGACTGAACATATGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTc > 2:819099/1‑139 (MQ=255) gcgcCGCTTCGATAACCAACGGATGGGCAGAACAGACTGAACATATGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATgg > 2:491478/1‑110 (MQ=255) gcgcCGCTTCGATAACCAACGGATGGGCAGAACAGACTGAACATATGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATgg < 1:491478/110‑1 (MQ=255) gccgcTTCGATAACCAACGGATGGGCAGAACAGACTGAACATATGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCcac < 1:1455138/139‑1 (MQ=255) cTTCGATAACCAACGGATGGGCAGAACAGACTGAACATATGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTAtg < 1:1576560/117‑1 (MQ=255) cTTCGATAACCAACGGATGGGCAGAACAGACTGAACATATGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTAtg > 2:1576560/1‑117 (MQ=255) aTAACCGACGGATGGGCAGAACAGACTGAACATATGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCaa < 1:1635949/139‑1 (MQ=255) aTAACCAACGGATGGGCAGAACAGACTGAACATATGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCaa > 2:924498/1‑139 (MQ=255) tAACCAACGGATGGGCAGAACAGACTGAACATATGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAAt > 1:939264/1‑139 (MQ=255) aCCAACGGATGGGCAGAACAGACTGAACATATGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCa < 1:1506472/139‑1 (MQ=255) aTGGGCAGAACAGACTGAACATATGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTc > 2:577238/1‑139 (MQ=255) aTGGGCAGAACAGACTGAACATATGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTc > 1:689512/1‑139 (MQ=255) aTGGGCAGAACAGACTGAACATATGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTc < 1:1147960/139‑1 (MQ=255) gggCAGAACAGACTGAACATATGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCa < 2:68753/88‑1 (MQ=255) gggCAGAACAGACTGAACATATGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCa > 1:68753/1‑88 (MQ=255) gCAGAACAGACTGAACATATGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTcacca > 1:615436/1‑139 (MQ=255) aaCAGACTGAACATATGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTAtgc < 1:1080945/94‑1 (MQ=255) aaCAGACTGAACATATGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTAtgc > 2:1080945/1‑94 (MQ=255) aCAGACTGAACATATGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTCACCACATcg < 2:948836/139‑1 (MQ=255) aCTGAACATATGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTCACCACATCGCGCa > 2:1334793/1‑139 (MQ=255) gAACATATGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTCACCACATCGCGCATTg > 2:413460/1‑139 (MQ=255) aCATATGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTCACCACAt < 1:1252731/128‑1 (MQ=255) aCATATGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTCACCACAt > 2:1252731/1‑128 (MQ=255) tatGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTCACCACATCGCGCATTGCGGAt < 1:1334793/139‑1 (MQ=255) atGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTca < 1:1067856/118‑1 (MQ=255) atGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTca > 2:1067856/1‑118 (MQ=255) atGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTCACCACATCGCGCATTGCGGAtt > 2:406479/1‑139 (MQ=255) tGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAg < 1:900499/68‑1 (MQ=255) tGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAg > 2:900499/1‑68 (MQ=255) tGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTCACCACATCGCGCATTGCGGAttt > 1:136451/1‑139 (MQ=255) gATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTca < 1:249293/113‑1 (MQ=255) gATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTca > 2:249293/1‑113 (MQ=255) gATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTCACCACATCGCGCATTGCGGATTTAGcc < 1:1552972/139‑1 (MQ=255) atatGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTCACCACATCGCGCATTGCGGATTTAGCCg > 1:479800/1‑139 (MQ=255) atGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTCACCACATCGCGCATTGCGGATTTAGcc < 2:1386974/136‑1 (MQ=255) atGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTCACCACATCGCGCATTGCGGATTTAGcc > 1:1386974/1‑136 (MQ=255) tGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTCACCACATCGCGCATTGCGGATTTAGCCGACt < 1:835946/139‑1 (MQ=255) tGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTCACCACATCGCGCATTGCGGATTTAGCCGACt < 2:181846/139‑1 (MQ=255) tGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTCACCACATCGCGCATTGCGGATTTAGCCGACt < 2:939264/139‑1 (MQ=255) ttCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCg < 1:1662959/79‑1 (MQ=255) ttCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCg > 2:1662959/1‑79 (MQ=255) cACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTcacc > 2:837734/1‑107 (MQ=255) cACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTcacc < 1:837734/107‑1 (MQ=255) cACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTCACCACATcgcg > 1:298491/1‑115 (MQ=255) cACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTCACCACATcgcg < 2:298491/115‑1 (MQ=255) aCCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACt < 1:928892/97‑1 (MQ=255) aCCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACt > 2:928892/1‑97 (MQ=255) cAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTCACCACATCGCGCATTGCGGATTTAGCCGACTGCAaata > 1:831063/1‑139 (MQ=255) aGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTCACCACATCGCGCATTGCGGATTTAGCCGACTGCAaataa < 2:689512/139‑1 (MQ=255) gCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTCTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCa > 1:760842/1‑74 (MQ=255) gCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTCTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCa < 2:760842/74‑1 (MQ=255) tttATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTCACCACATCGCGCATTGCGGATTTAGCCGACTGCAaata < 2:1312181/135‑1 (MQ=255) tttATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTCACCACATCGCGCATTGCGGATTTAGCCGACTGCAaata > 1:1312181/1‑135 (MQ=255) ttATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTTGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTca > 1:1047604/1‑97 (MQ=255) ttATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTca < 2:1047604/97‑1 (MQ=255) aTGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTCACCACATCGCGCATTGCGGA‑TTAGCCGACTGCAAATAATCCCggg > 2:367286/1‑139 (MQ=255) tGCCGGGCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTCACCACATCGCGCATTGCGGATTTAGCCGACTGCAAATAATCCCggg > 1:1011420/1‑139 (MQ=255) ggCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTc < 2:338832/60‑1 (MQ=255) ggCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTc > 1:338832/1‑60 (MQ=255) ggCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACt > 2:691302/1‑82 (MQ=255) ggCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACt < 1:691302/82‑1 (MQ=255) ggCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTCACCACATCGCGCATTGCGGATTTAGCCGACTGCAAATAATCCCGGGGATCg > 2:388137/1‑139 (MQ=255) ggCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTCACCACATCGCGCATTGCGGATTTAGCCGACTGCAAATAATCCCGGGGATCg > 1:1134098/1‑139 (MQ=255) gCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTCACCACATCGCGCATTGCGGATTTAGCCGACTGCAAATAATCCCGGGGATCgg < 2:1134098/139‑1 (MQ=255) gCAATTAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTCACCACATCGCGCATTGCGGATTTAGCCGACTGCAAATAATCCCGGGGATCgg < 2:1011420/139‑1 (MQ=255) ttAACGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTCACCACATCGCGCATTGCGGATTTAGCCGACTGCAAATAATCCCGGGGATCGGTCGc > 2:1420752/1‑139 (MQ=255) aCGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTCACCACATCGCGCATTGCGGATTTAGCCGACTGCAAATAATCCCGGGGATCGGTCGCTTc < 1:819099/139‑1 (MQ=255) aCGTTTTCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTCACCACATCGCGCATTGCGGATTTAGCCGACTGCAAATAATCCCGGGGATCGGTCGCTTc < 1:240291/139‑1 (MQ=255) tCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTCACCACATCGCGCATTGCGGATTTAGCCGACTGCAAATAATCCCGGGGATCgg < 2:512357/126‑1 (MQ=255) tCATG‑TTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTCACCACATCGCGCATTGCGGATTTAGCCGACTGCAAATAATCCCGGGGATCgg > 1:512357/1‑126 (MQ=255) | AGCACTTTGCGCGTGCTGTTGCGATCAAATGCCAGCGCCGCTTCGATAACCAACGGATGGGCAGAACAGACTGAACATATGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATGTTTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTCACCACATCGCGCATTGCGGATTTAGCCGACTGCAAATAATCCCGGGGATCGGTCGCTTC > NC_000913/2176197‑2176451 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |