| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,447,869 | Δ1 bp | coding (3758/3780 nt) | tamB → | translocation and assembly module for autotransporter export, inner membrane subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,447,867 | 0 | T | . | 100.0% | 299.6 / NA | 73 | coding (3756/3780 nt) | tamB | translocation and assembly module for autotransporter export, inner membrane subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base . (41/32); total (41/32) | |||||||||||
CAGCGGCTATGTATTGCCAGGTCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAGTTG > NC_000913/4447729‑4447998 | cAGCGGCTATGTATTGCCAGGTCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGAt > 1:950758/1‑139 (MQ=255) gCGGCTATGTATTGCCAGGTCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGAttg < 2:263863/139‑2 (MQ=255) cGGCTATGTATTGCCAGGTCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGAt > 1:1663977/1‑136 (MQ=255) cGGCTATGTATTGCCAGGTCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGAt < 2:1663977/136‑1 (MQ=255) ggCTATGTATTGCCAGGTCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGAttgct < 2:727383/139‑4 (MQ=255) ttGCCAGGTCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGtt < 2:552088/139‑1 (MQ=255) gTCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGttt > 1:1251481/1‑139 (MQ=255) tCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGtttt > 2:575341/1‑139 (MQ=255) tCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGtttt > 1:440248/1‑139 (MQ=255) aaGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACaa > 2:1211581/1‑139 (MQ=255) cGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATTAGTTCGCGTTTTAACAATGCGAATATTTGt > 2:877934/1‑139 (MQ=255) cGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGt > 1:1612854/1‑139 (MQ=255) gggTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTa < 2:1251481/139‑1 (MQ=255) tatTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCa > 1:1645904/1‑139 (MQ=255) ctctATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACg > 1:1238049/1‑139 (MQ=255) cTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGAttgc > 2:550928/1‑73 (MQ=255) cTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGAttgc < 1:550928/75‑3 (MQ=255) cTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGc > 1:569093/1‑139 (MQ=255) cTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGc > 2:1731057/1‑139 (MQ=255) cTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTT‑CGCCACAAACAAGGCa > 2:13764/1‑139 (MQ=255) cTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGAGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGATCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCGACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGc > 1:1508980/1‑139 (MQ=255) cACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCaa < 1:965671/139‑1 (MQ=255) cACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCaa < 2:950758/139‑1 (MQ=255) cACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCaa > 2:1605953/1‑139 (MQ=255) cACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCaa < 2:1645904/139‑1 (MQ=255) cACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCaa < 2:891449/139‑1 (MQ=255) cACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTAGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCaa > 1:1497926/1‑139 (MQ=255) tacgttaTCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTc < 2:1612854/139‑1 (MQ=255) tacgttaTCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTc < 2:425707/139‑1 (MQ=255) ttaTCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAatat > 2:1465942/1‑96 (MQ=255) ttaTCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAatat < 1:1465942/96‑1 (MQ=255) aTCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCATTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGa > 1:431145/1‑139 (MQ=255) aTCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACgg < 1:1039252/104‑1 (MQ=255) aTCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACgg > 2:1039252/1‑104 (MQ=255) tCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGAt < 1:1211581/139‑1 (MQ=255) ccTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGAc < 1:1731057/139‑1 (MQ=255) tGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTCTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTCTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCa > 1:222913/1‑139 (MQ=255) gATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCaa > 2:1360843/1‑139 (MQ=255) tGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTAGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATg < 2:1497926/139‑1 (MQ=255) ccTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCTAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGcc < 1:1284278/139‑1 (MQ=255) actagacTATATTTGGAACCTGTGTCAAGTATAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTAGCAGGTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGcc < 1:877934/133‑1 (MQ=255) tAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCa > 2:1334731/1‑139 (MQ=255) aGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGt > 1:1577200/1‑139 (MQ=255) tatCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAatat > 1:1706302/1‑74 (MQ=255) tatCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAatat < 2:1706302/74‑1 (MQ=255) tatCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGt < 1:574664/112‑1 (MQ=255) tatCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGt > 2:574664/1‑112 (MQ=255) tatCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTg > 1:303423/1‑139 (MQ=255) atCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGtt > 2:724806/1‑51 (MQ=255) atCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGtt < 1:724806/51‑1 (MQ=255) atCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCca > 2:1164989/1‑95 (MQ=255) atCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCca < 1:1164989/95‑1 (MQ=255) gAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTaac > 2:895004/1‑55 (MQ=255) gAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTaac < 1:895004/57‑3 (MQ=255) gAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTaa < 2:1564901/56‑2 (MQ=255) gAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTaa > 1:1564901/1‑55 (MQ=255) gAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCa > 1:1008130/1‑108 (MQ=255) gAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCa < 2:1008130/108‑1 (MQ=255) gAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGAt > 1:173427/1‑139 (MQ=255) gAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGAt > 2:47067/1‑139 (MQ=255) aaGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGtt > 1:776691/1‑45 (MQ=255) aaGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGtt < 2:776691/45‑1 (MQ=255) aaGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGAtt > 1:1592769/1‑139 (MQ=255) aGCCGTGTCTGGCGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTc < 1:313772/105‑1 (MQ=255) aGCCGTGTCTGGCGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTc > 2:313772/1‑105 (MQ=255) ccGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCa > 2:1447844/1‑139 (MQ=255) tgtCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTa > 1:134465/1‑139 (MQ=255) gtCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTAt < 1:575341/139‑1 (MQ=255) gtCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTAt > 1:24216/1‑139 (MQ=255) tGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGa < 2:569093/139‑1 (MQ=255) tAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACt < 2:134465/139‑1 (MQ=255) gACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCAATTTCAGTATCGATAACTAc < 2:1341471/139‑1 (MQ=255) aCCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTT‑CGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCa < 1:13764/139‑1 (MQ=255) cAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAg < 2:897519/77‑1 (MQ=255) cAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAg < 2:1577200/139‑1 (MQ=255) cAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGCTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAg > 1:897519/1‑77 (MQ=255) ggCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAGtt > 1:968815/1‑139 (MQ=255) gCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCAc > 1:362809/1‑85 (MQ=255) gCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCAc < 2:362809/85‑1 (MQ=255) gCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAGTTg > 2:1424657/1‑139 (MQ=255) | CAGCGGCTATGTATTGCCAGGTCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAGTTG > NC_000913/4447729‑4447998 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |