Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 71,452 | G→A | L34L (TTG→TTA) | yabI → | DedA family inner membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 71,452 | 0 | G | A | 100.0% | 254.6 / NA | 78 | L34L (TTG→TTA) | yabI | DedA family inner membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (41/37); total (41/37) |
CCCTGCTTCGTCCATTTGACAGGCACATTATGCAAGCATTGCTGGAACACTTTATTACCCAATCCACCGTGTATTCATTGATGGCGGTGGTGTTGGTGGCCTTTCTGGAGTCGCTGGCGCTGGTCGGTTTGATTCTACCCGGTACGGTGCTGATGGCGGGGCTGGGAGCGCTGATTGGCAGCGGCGAGTTAAGTTTCTGGCACGCCTGGCTGGCAGGGATTATTGGCTGCTTGATGGGCGACTGGATTTCTTTCTGGCTGGGTTG > NC_000913/71322‑71586 | cccTGCTTCGTCCATTTGACAGGCACATTATGCAAGCATTGCTGGAACACTTTATTAACCAATCCACCGTGTATTCATTGATGGCGGTGGTGTTGGTGGCCTTTCTGGAGTCGCTGGCGCTGGTCGGTTTAATTCTAcc < 2:1388193/139‑1 (MQ=255) gCTTCGTCCATTTGACAGGCACATTATGCAAGCATTGCTGGAACACTTTATTACCCAATCCACCGTGTATTCATTGATGGCGGTGGTGTTGGTGGCCTTTCTGGAGTCGCTGGCGCTGGTCGGTTTAATTCTACCCGGt < 1:721604/139‑1 (MQ=255) tCGTCCATTTGACAGGCACATTATGCAAGCATTGCTGGAACACTTTATTACCCAATCCACCGTGTATTCATTGATGGCGGTGGTGTTGGTGGCCTTTCTGGAGTCGCTGGCGCTGGTCGGTTTAATTCTACCCGGTACg > 1:1453799/1‑139 (MQ=255) caTTATGCAAGCATTGCTGGAACACTTTATTACCCAATCCACCGTGTATTCATTGATGGCGGTGGTGTTGGTGGCCTTTCTGGAGTCGCTGGCGCTGGTCGGTTTAATTCTACCCGGTACGGTGCTGATGGCGGGGCTg > 2:495554/1‑139 (MQ=255) aTGCAAGCATTGCTGGAACACTTTATTACCCAATCCACCGTGTATTCATTGATGGCGGTGGTGTTGGTGGCCTTTCTGGAGTCGCTGGCGCTGGTCGGTTTAATTCTACCCGGTACGGTGCTGATGGCGGGGCTGGGAg < 2:1438081/139‑1 (MQ=255) aTGCAAGCATTGCTGGAACACTTTATTACCCAATCCACCGTGTATTCATTGATGGCGGTGGTGTTGGTGGCCTTTCTGGAGTCGCTGGCGCTGGTCGGTTTAATTCTACCCGGTACGGTGCTGATGGCGGGGCTGGGAg < 1:29281/139‑1 (MQ=255) gCAAGCATTGCTGGAACACTTTATTACCCAATCCACCGTGTATTCATTGATGGCGGTGGTGTTGGTGGCCTTTCTGGAGTCGCTGGCGCTGGTCGGTTTAATTCTACCCGGTACGGTGCTGATGGCGGGGCTGGGAgcg < 1:1237649/139‑1 (MQ=255) cAAGCATTGCTGGAACACTTTATTACCCAATCCACCGTGTATTCATTGATGGCGGTGGTGTTGGTGGCCTTTCTGGAGTCGCTGGTGCTGGTCGGTTTAAtt < 2:150930/102‑1 (MQ=255) cAAGCATTGCTGGAACACTTTATTACCCAATCCACCGTGTATTCATTGATGGCGGTGGTGTTGGTGGCCTTTCTGGAGTCGCTGGTGCTGGTCGGTTTAAtt > 1:150930/1‑102 (MQ=255) cAAGCATTGCTGGAACACTTTATTACCCAATCCACCGTGTATTCATTGATGGCGGTGGTGTTGGTGGCCTTTCTGGAGTCGCTGGCGCTGGTCGGTTTAATTCTACCCGGTACGGTGCTGATGGCGGGGCTgg < 2:332779/133‑1 (MQ=255) 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gCATTGCTGGAACACTTTATTACCCAAACCACCGTTTATTCATTGATGGCGGTGGTGTTGGTGGCCTTTCTGGAGTCGCTGGCGCTGGTCGAATTAATTCTACCCGGTACGGTGCTGATGGCGGGGCTGGGAGCGATGa > 2:11151/1‑139 (MQ=255) cATTGCTGGAACACTTTATTACCCAATCCACCGTGTATTCATTGATGGCGGTGGTGTTGGTGGCCTTTCTGGAGTCGCTGGCGCTGGTCGGTTTAATTCTACCCGGTACGGTGCTGATGGCGGGGCTGGGAGCGCTGAt > 2:1184267/1‑139 (MQ=255) cATTGCTGGAACACTTTATTACCCAATCCACCGTGTATTCATTGATGGCGGTGGTGTTGGTGGCCTTTCTGGAGTCGCTGGCGCTGGTCGGTTTAATTCTACCCGGTACGGTGCTGATGGCGGGGCTGGGAGCGCTGAt > 1:976767/1‑139 (MQ=255) ttGCTGGAACACTTTATTACCCAATCCACCGTGTATTCATTGATGGCGGTGGTGTTGGTGGCCTTTCTGGAGTCGCTGGCGCTGGTCGGTTTAATTCTACCCGGTACGGTGCTGATGGCGGGGCTGGGAGCGCTGATTg < 2:976767/139‑1 (MQ=255) cTGGAACACTTTATTACCCAATCCACCGTGTATTCATTGATGGCGGTGGTGTTGGTGGCCTTTCTGGAGTCGCTGGCGCTGGTCGGTTTAATTCTACCCGGTACGGTGCTGATGGCGGGGCTGGGAGCGCTGATTGGCa < 1:72544/139‑1 (MQ=255) gAACACTTTATTACCCAATCCACCGTGTATTCATTGATGGCGGTGGTGTTGGTGGCCTTTCTGGAGTCGCTGGCGCTGGTCGGTTTAATTCTACCCGGTACGGTGCTGATGGCGGGGCTGGGAGCGCTGATTGGCAgcg < 1:495554/139‑1 (MQ=255) 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tGGCGGTGGTGTTGGTGGCCTTTCTGGAGTCGCTGGCGCTGGTCGGTTTAATTCTACCCGGTACGGTGCTGATGGCGGGGCTGGGAGCGCTGATTGGCAGCGGCGAGTTAAGTTTCTGGCACGCCTGGCTGGCAGGGat > 2:461499/1‑139 (MQ=255) tGGCGGTGATGTTGGTGGCCTTTCTGGAGTCGCTGGCGCTGGTCGGTTTAATTCTACCCGGTACGGTGCTGATGGCGGGGCTGGGAGCGCTGATTGGCAGCGGCGAGTTAAGTTTCTGGCACGCCTGACTGGCAGGGat > 2:1167383/1‑139 (MQ=255) gtggtgTTGGTGGCCTTTCTGGAGTCGCTGGCGCTGGTCGGTTTAATTCTACCCGGTACGGTGCTGATGGCGGGGCTGGGAGCGCTGATTGGCAGCGGCGAGTTAAGTTTCTGGCACGCCTGGCTGGCAGGGATTATTg < 2:544566/139‑1 (MQ=255) ggtgTTGGTGGCCTTTCTGGAGTCGCTGGCGCTGGTCGGTTTAATTCTACCCGGTACGGTGCTGATGGCGGGGCTGGGAGCGCTGATTGGCAGCGGCGAGTTAAGTTTCTGGCACGCCTGGCTGGCAGGGATTATTGgc < 1:1280439/139‑1 (MQ=255) ggtgTTGGTGGCCTTTCTGGAGTCGCTGGCGCTGGTCGGTTTAATTCTACCCGGTACGGTGCTGATGGCGGGGCTGGGAGCGCTGATTGGCAGCGGCGAGTTAAGTTTCTGGCACGCCTGGCTGGCAGGGATTATTGgc < 2:600098/139‑1 (MQ=255) ggCCTTTCTGGAGTCGCTGGCGCTGGTCGGTTTAATTCTACCCGGTACGGTGCTGATGGCGGGGCTGGGAGCGCTGATTGGCAGCGGCGAGTTAAGTTTCTGGCACGCCTGGCTGGCAGGGATTATTGGCTGCTTGATg > 2:1671918/1‑139 (MQ=255) ggCCTTTCTGGAGTCGCTGGCGCTGGTCGGTTTAATTCTACCCGGTACGGTGCTGATGGCGGGGCTGGGAGCGCTGATTGGCAGCGGCGAGTTAAGTTTCTGGCACGCCTGGCTGGCAGGGATTATTGGCTGCTTGATg < 1:337404/139‑1 (MQ=255) ccTTTCTGGAGTCGCTGGCGCTGGTCGGTTTAATTCTACCCGGTACGGTGCTGATGGCGGGGCt < 1:1716028/64‑1 (MQ=255) ccTTTCTGGAGTCGCTGGCGCTGGTCGGTTTAATTCTACCCGGTACGGTGCTGATGGCGGGGCt > 2:1716028/1‑64 (MQ=255) ccTTTCTGGAGTCGCTGGCGCTGGTCGGTTTAATTCTACCCGGTACGGTGCTGATGGCGGGGCTGGGAGCGCTGATTGGCAgcg > 2:1028831/1‑84 (MQ=255) ccTTTCTGGAGTCGCTGGCGCTGGTCGGTTTAATTCTACCCGGTACGGTGCTGATGGCGGGGCTGGGAGCGCTGATTGGCAGCGGCGAGTTAAGTTTCTGGCACGCCTGGCTGGCAGGGATTATTGGCTGCTTGATggg < 1:484234/139‑1 (MQ=255) ccTTTCTGGAGTCGCTGGCGCTGGTCGGTTTAATTCTACCCGGTACGGTGCTGATGGCGGGGCTGGGAGCGCTGATTGGCAGCGGCGAGTTAAGTTTCTGGCACGCCTGGCTGGCAGGGATTATTGGCTGCTTGATggg > 2:175112/1‑139 (MQ=255) ccTTTCTGGAGTCGCTGGCGCTGGTCGGTTTAATTCTACCCGGTACGGTGCTGATGGCGGGGCTGGGAGCGCTGATTGGCAGCGGCGAGTTAAGTTTCTGGCACGCCTGGCTGGCAGGGATTATTGGCTGCTTGATggg > 1:737021/1‑139 (MQ=255) 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ctggcgctggTCGGTTTAATTCTACCCGGTACGGTGCTGATGGCGGGGCTGGGAGCGCTGATTGGCAGCGGCGAGTTAAGTTTCTGGCACGCCTGGCTGGCAGGGATTATTGGCTGCTTGATGGGCGa > 2:607863/1‑128 (MQ=255) ctggcgctggTCGGTTTAATTCTACCCGGTACGGTGCTGATGGCGGGGCTGGGAGCGCTGATTGGCAGCGGCGAGTTAAGTTTCTGGCACGCCTGGCTGGCAGGGATTATTGGCTGCTTGATGGGCGACTGGAtttctt > 1:268893/1‑139 (MQ=255) ctggcgctggTCGGTTTAATTCTACCCGGTACGGTGCTGATGGCGGGGCTGGGAGCGCTGATTGGCAGCGGCGAGTTAAGTTTCTGGCACGCCTGGCTGGCAGGGATTATTGGCTGCTTGATGGGCGACTGGAtttctt > 1:114349/1‑139 (MQ=255) gTTTAATTCTACCCGGTACGGTGCTGATGGCGGGGCTGGGAGCGCTGATTGGCAGCGGCGAGTTAAGTTTCTGGCACGCCTGGCTGGCAGGGATTATTGGCTGCTTGATGGGCGACTGGATTTCTTTCTGGCTGGGTTg < 1:1768606/139‑1 (MQ=255) | CCCTGCTTCGTCCATTTGACAGGCACATTATGCAAGCATTGCTGGAACACTTTATTACCCAATCCACCGTGTATTCATTGATGGCGGTGGTGTTGGTGGCCTTTCTGGAGTCGCTGGCGCTGGTCGGTTTGATTCTACCCGGTACGGTGCTGATGGCGGGGCTGGGAGCGCTGATTGGCAGCGGCGAGTTAAGTTTCTGGCACGCCTGGCTGGCAGGGATTATTGGCTGCTTGATGGGCGACTGGATTTCTTTCTGGCTGGGTTG > NC_000913/71322‑71586 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |