| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 2,070,583 | T→C | intergenic (+109/‑77) | yoeA → / → yeeP | CP4‑44 prophage, putative disrupted hemin or colicin receptor,Phage or Prophage Related, interrupted by IS2 and C‑terminal deletion/pseudogene, CP4‑44 prophage, 50S ribosome‑binding GTPase family,Phage or Prophage Related, putative histone |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,070,583 | 0 | T | C | 100.0% | 994.8 / NA | 268 | intergenic (+109/‑77) | yoeA/yeeP | CP4‑44 prophage, putative disrupted hemin or colicin receptor,Phage or Prophage Related, interrupted by IS2 and C‑terminal deletion/pseudogene, CP4‑44 prophage, 50S ribosome‑binding GTPase family,Phage or Prophage Related, putative histone |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (146/122); total (146/122) | |||||||||||
Only 100 of 268 total aligned reads displayed.
TGTTAACTTCATCACCAAAAAGGGTGAATCTCCGGACTCCCTATATCACTTAAATTGATACAACTTTTTAGAGTAGTCATTAGTGAACAGATAATTGATAACTCAGAACCAGTAAAATGCAAAAGACGCACCACGCTGGGAAAATCGCTGCTATTCAGCAGAGTTTTGTATCGAGAATGGTGGCCAGCCACTTATTGCTCTCGCGTAAGCGGGTACCGTGACATTCTGCCTGAACTTGACCTGGTACTGTGGCTGATTAAAGCCGATGACC > NC_000913/2070447‑2070717 | cTTCATCACCAAAAAGGGTGAATCTCCGGACTCCCTATATCACTTAAATTGATACAACTTTTTAGAGTAGTCATTAGTGAACAGATAATTGATAACTCAGAACCAGTAAAATGCAAAAGACGCACCACGCCGGGAAAAt < 1:405768/139‑1 (MQ=255) catcaCCAAAAAGGGTGAATCTCCGGACTCCCTATATCACTTAAATTGATACAACTTTTTAGAGTAGTCATTAGTGAACAGATAATTGATAACTCAGAACCAGTAAAATGCAAAAGACGCACCACGCCGGGAAAATCgc > 2:812752/1‑139 (MQ=255) aaaGGGTGAATCTCCGGACTCCCTATATCACTTAAATTGATACAACTTTTTAGAGTAGTCATTAGTGAACAGATAATTGATAACTCAGAACCAGTAAAATGCAAAAGACGCACCACGCCGGGAAAATCGCTGCTATTca < 1:1202314/139‑1 (MQ=255) aaGGGTGAATCTCCGGACTCCCTATATCACTTAAATTGATACAACTTTTTAGAGTAGTCATTAGTGAACAGATAATTGATAACTCAGAACCAGTAAAATGCAAAAGACGCACCACGCCGGGAAAATCGCTGCTATTcag < 2:173860/139‑1 (MQ=255) 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accacGCCGGGAAAATCGCTGCTATTCAGCAGAGTTTTGTATCGAGAATGGTGGCCAGCCACTTATTGCTCTCGCGTAAGCGGGTACCGTGACAtt > 2:18853/1‑96 (MQ=255) accacGCCGGGAAAATCGCTGCTATTCAGCAGAGTTTTGTATCGAGAATGGTGGCCAGCCACTTATTGCTCTCGCGTAAGCGGGTACCGTGACATTCTGCCTGAACTTGACCTGGTACTGTGGCTGATTAAAGCCGATg > 2:1538959/1‑139 (MQ=255) acGCCGGGAAAATCGCTGCTATTCAGCAGAGTTTTGTATCGAGAATGGTGGCCAGCCACTTATTGCTCTCGCGTAAGCGGGTACCGTGACATTCTGCCTGAAGTTGACCTGGTACTGTGGCTGATTAAAGCCGATGAcc > 2:1129132/1‑139 (MQ=255) acGCCGGGAAAATCGCTGCTATTCAGCAGAGTTTTGTATCGAGAATGGTGGCCAGCCACTTATTGCTCTCGCGTAAGCGGGTACCGTGACATTCTGCCTGAACTTGACCTGGTACTGTGGCTGATTAAAGCCGATGAcc < 1:48212/139‑1 (MQ=255) cGCCGGGAAAATCGCTGCTATTCAGCAGAGTTTTGTATCGAGAATGGTGGCCAGCCACTTATTGCTCTCGCGTAAGCGGGTACCGTGACATTCTGCCTGAACTTGa > 2:238759/1‑106 (MQ=255) cGCCGGGAAAATCGCTGCTATTCAGCAGAGTTTTGTATAGAGAATGGTGGCCAGCCACTTATTGCTCTCGCGTAAGCGGGTACCGTGACATTCTGCCTGAACTTGa < 1:238759/106‑1 (MQ=255) | TGTTAACTTCATCACCAAAAAGGGTGAATCTCCGGACTCCCTATATCACTTAAATTGATACAACTTTTTAGAGTAGTCATTAGTGAACAGATAATTGATAACTCAGAACCAGTAAAATGCAAAAGACGCACCACGCTGGGAAAATCGCTGCTATTCAGCAGAGTTTTGTATCGAGAATGGTGGCCAGCCACTTATTGCTCTCGCGTAAGCGGGTACCGTGACATTCTGCCTGAACTTGACCTGGTACTGTGGCTGATTAAAGCCGATGACC > NC_000913/2070447‑2070717 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |