| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,719,768 | G→A | *97* (TAG→TAA) | yiaG → | HTH_CROC1 family putative transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,719,768 | 0 | G | A | 99.0% | 303.5 / ‑4.5 | 96 | *97* (TAG→TAA) | yiaG | HTH_CROC1 family putative transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base A (42/53); total (43/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.48e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.62e-01 | |||||||||||
TTTTGGGCGTATCAGTCGCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTG > NC_000913/3719641‑3719897 | ttttGGGCGTATCAGTCGCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCa < 2:1288786/139‑1 (MQ=255) tGGGCGTATCAGTCGCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACtt > 2:1685219/1‑139 (MQ=255) aTCAGTCGCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCt > 1:762712/1‑139 (MQ=255) aTCAGTCGCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCt < 2:1635022/139‑1 (MQ=255) tCGCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTa < 2:882983/139‑1 (MQ=255) tCGCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTa > 2:709635/1‑139 (MQ=255) tCGCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTa < 2:215310/139‑1 (MQ=255) tCGCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTa < 1:147359/139‑1 (MQ=255) gCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACg < 2:1298948/139‑1 (MQ=255) gCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACg < 2:1067232/139‑1 (MQ=255) gCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACg < 2:1146706/139‑1 (MQ=255) aTGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTc > 1:1599045/1‑139 (MQ=255) aaaGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACg > 2:622701/1‑131 (MQ=255) aaaGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACg < 1:622701/131‑1 (MQ=255) aaaGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCtgat > 2:1480933/1‑139 (MQ=255) aGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCtgatga > 2:89450/1‑139 (MQ=255) aGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCtgatga < 1:1733952/139‑1 (MQ=255) gAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACa < 1:10130/139‑1 (MQ=255) aTGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCAGTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAgg < 1:1685219/139‑1 (MQ=255) tGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGc < 1:1212203/116‑1 (MQ=255) tGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGc > 2:1212203/1‑116 (MQ=255) tGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACg > 2:1160942/1‑124 (MQ=255) tGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACg < 1:1160942/124‑1 (MQ=255) tGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGa > 2:1225738/1‑139 (MQ=255) gggAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGAc > 1:1119177/1‑139 (MQ=255) aTCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACtttt < 2:1104632/97‑1 (MQ=255) aTCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACtttt > 1:1104632/1‑97 (MQ=255) ccAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGtttt > 2:507160/1‑139 (MQ=255) cAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTc > 1:1097067/1‑139 (MQ=255) aGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTcc < 2:201675/139‑1 (MQ=255) cgTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTc < 2:66881/113‑1 (MQ=255) cgTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTc > 1:66881/1‑113 (MQ=255) gTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGa < 1:709635/139‑1 (MQ=255) tGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCaa < 2:1711332/134‑1 (MQ=255) tGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCaa > 1:1711332/1‑134 (MQ=255) tGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGAt > 2:1481404/1‑139 (MQ=255) gAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGAtt < 2:1792080/139‑1 (MQ=255) cAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTg > 2:1255783/1‑90 (MQ=255) cAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTg < 1:1255783/90‑1 (MQ=255) cAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCt > 2:147158/1‑104 (MQ=255) cAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCt < 1:147158/104‑1 (MQ=255) gTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAata < 1:507160/139‑1 (MQ=255) ccGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATc < 2:436083/74‑1 (MQ=255) ccGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATc > 1:436083/1‑74 (MQ=255) ccGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGAc < 2:496669/109‑1 (MQ=255) ccGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGAc > 1:496669/1‑109 (MQ=255) ccGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGa < 1:89450/139‑1 (MQ=255) gAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAATCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGaaa < 2:1097067/139‑1 (MQ=255) aaCTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTAGTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGaaaa > 1:1778173/1‑139 (MQ=255) aCTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATg < 1:1480279/134‑1 (MQ=255) aCTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATg > 2:1480279/1‑134 (MQ=255) cTAAAATTGATGCTTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAaat < 2:1513723/139‑1 (MQ=255) tGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAAttgtt < 1:1531368/139‑1 (MQ=255) gATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAAttgttg < 2:1361214/139‑1 (MQ=255) aTGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACg > 1:629135/1‑79 (MQ=255) aTGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACg < 2:629135/79‑1 (MQ=255) aTGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGa < 1:275112/109‑1 (MQ=255) aTGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTCTTCCAACCGa > 2:275112/1‑109 (MQ=255) tGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTAt < 1:209898/67‑1 (MQ=255) tGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTAt > 2:209898/1‑67 (MQ=255) tGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACg < 2:1652343/78‑1 (MQ=255) tGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACg > 1:1652343/1‑78 (MQ=255) gCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCtga > 2:28522/1‑84 (MQ=255) gCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCtga < 1:28522/84‑1 (MQ=255) cGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATc < 1:672684/139‑1 (MQ=255) tttGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCAc > 2:227410/1‑139 (MQ=255) ttGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATaa > 2:1315414/1‑113 (MQ=255) ttGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATaa < 1:1315414/113‑1 (MQ=255) ttGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCAcc < 1:1480933/139‑1 (MQ=255) ccAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCg < 2:1599045/139‑1 (MQ=255) ccAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCg < 2:1778173/139‑1 (MQ=255) aaCCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTg < 2:857288/139‑1 (MQ=255) aCCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCAcc > 1:1681148/1‑126 (MQ=255) aCCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCAcc < 2:1681148/126‑1 (MQ=255) cccGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATc < 2:1761274/40‑1 (MQ=255) cccGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATc > 1:1761274/1‑40 (MQ=255) cccGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGc > 1:1522738/1‑139 (MQ=255) cccGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGc > 2:229134/1‑139 (MQ=255) ccGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCt < 2:1522738/139‑1 (MQ=255) aTTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATg < 2:762712/139‑1 (MQ=255) gtaagCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATg < 2:1688689/93‑1 (MQ=255) gtaagCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATg > 1:1688689/1‑93 (MQ=255) gCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAAc > 2:1162256/1‑139 (MQ=255) gCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTa > 2:195800/1‑42 (MQ=255) gCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTa < 1:195800/42‑1 (MQ=255) gCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCa > 1:1330648/1‑108 (MQ=255) gCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCa < 2:1330648/108‑1 (MQ=255) gTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAAc < 2:1049431/68‑1 (MQ=255) gTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAAc > 1:1049431/1‑68 (MQ=255) ttGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGAt > 2:829768/1‑71 (MQ=255) ttGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGAt < 1:829768/71‑1 (MQ=255) ttGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCa > 2:1254280/1‑101 (MQ=255) ttGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCa < 1:1254280/101‑1 (MQ=255) ttGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGtt > 2:1070411/1‑139 (MQ=255) ttGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGtt > 1:481702/1‑139 (MQ=255) gATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTg < 2:1119177/139‑1 (MQ=255) | TTTTGGGCGTATCAGTCGCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTG > NC_000913/3719641‑3719897 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |