| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 3,736,157 | G→A | *393* (TAG→TAA) | xylR → | xylose divergent operon transcriptional activator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,736,157 | 0 | G | A | 100.0% | 363.5 / NA | 110 | *393* (TAG→TAA) | xylR | xylose divergent operon transcriptional activator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (58/52); total (58/52) | |||||||||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
AACCACCTTGTCGATCAATGAGATATCGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑ATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTAT‑CCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCACCAACAACGCTTCAGGCTCGTAGCTCAA > NC_000913/3736022‑3736287 | aaCCACCTTGTCGATCAATGAGATATCGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACg‑a < 1:543689/139‑1 (MQ=255) ccTTGTCGATCAATGAGATATCGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACg‑aatgat > 1:368021/1‑134 (MQ=255) tGTCGATCAATGAGATATCGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAATGATgag < 2:972438/139‑1 (MQ=255) tCGATCAATGAGATATCGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAATGATGAGaa < 2:1257797/139‑1 (MQ=255) 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ctGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAatgatg < 1:912269/80‑1 (MQ=255) ctGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCg > 2:838133/1‑113 (MQ=255) ctGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCg < 1:838133/113‑1 (MQ=255) tGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCt > 2:240893/1‑139 (MQ=255) tGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAATGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCt > 1:267406/1‑139 (MQ=255) aaaaaaGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAatgatg < 2:1417256/72‑1 (MQ=255) aaaaaaGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAatgatg > 1:1417256/1‑72 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |