| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 468,932 | C→T | A21V (GCT→GTT) | mdlA → | putative multidrug ABC transporter ATPase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 468,932 | 0 | C | T | 100.0% | 318.6 / NA | 99 | A21V (GCT→GTT) | mdlA | putative multidrug ABC transporter ATPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (52/47); total (52/47) | |||||||||||
GCGATGGAACAGATTAAATACACCACTTCTTTACCCATCGAATAAATATCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGCTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGTGGTTGGTATTGTTGTCGATGGCGTGACAGAACAACACTTTACTACCGGGCAGATCCTGATGTGGATCGCCACCATGGTGCTGAT > NC_000913/468797‑469067 | gcgATGGAACAGATTAAATACACCACTTCTTTACCCATCGAATAAATATCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGt > 2:454916/1‑139 (MQ=255) cAGATTAAATACACCACTTCTTTACCCATCGAATAAATATCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCcttgct < 2:1173056/139‑1 (MQ=255) aTTAAATACACCACTTCTTTACCCATCGAATAAATATCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGc < 1:764753/130‑1 (MQ=255) aTTAAATACACCACTTCTTTACCCATCGAATAAATATCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGc > 2:764753/1‑130 (MQ=255) aaTACACCACTTCTTTACCCATCGAATAAATATCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCcttgct > 2:67936/1‑132 (MQ=255) aaTACACCACTTCTTTACCCATCGAATAAATATCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCcttgct < 1:67936/132‑1 (MQ=255) caccacTTCTTTACCCATCGAATAAATATCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATcg < 1:1574325/139‑1 (MQ=255) accacTTCTTTACCCATCGAATAAATATCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATcgc > 1:641483/1‑139 (MQ=255) accacTTCTTTACCCATCGAATAAATATCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATcgc > 1:460593/1‑139 (MQ=255) ccacTTCTTTACCCATCGAATAAATATCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATcgcg > 1:321145/1‑139 (MQ=255) ccacTTCTTTACCCATCGAATAAATATCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATcgcg > 1:987135/1‑139 (MQ=255) ccacTTCTTTACCCATCGAATAAATATCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATcgcg < 2:1226515/139‑1 (MQ=255) ccacTTCTTTACCCATCGAATAAATATCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATcgcg > 2:1332499/1‑139 (MQ=255) ccacTTCTTTACCCATCGAATAAATATCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCACCTTGCTTGTCATTATcgcg > 1:449959/1‑139 (MQ=255) cacTTCTTTACCCATCGAATAAATATCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGa < 1:454916/139‑1 (MQ=255) ttcttTACCCATCGAATAAATATCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGAtgc > 1:1466882/1‑139 (MQ=255) 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caggtcaggACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGTGGTTGGTa < 2:641483/139‑1 (MQ=255) caggtcaggACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGTGGTTGGTa < 2:321145/139‑1 (MQ=255) aggtcaggACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTTGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCcttgct < 2:1201191/91‑1 (MQ=255) aggtcaggACACAACCCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCcttgct > 1:1201191/1‑91 (MQ=255) caggACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGTTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGTGGTTGGTTttgtt < 1:808768/139‑1 (MQ=255) ggACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCcttg < 2:52691/83‑1 (MQ=255) ggACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCcttg > 1:52691/1‑83 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |