Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 329,839 | 0 | A | G | 66.3% | 103.0 / 65.2 | 83 | E126G (GAA→GGA) | betT | choline transporter of high affinity |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (14/14); new base G (27/28); total (41/42) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
CTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGC > NC_000913/329706‑329973 | cTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGGAGgcg < 1:65811/139‑1 (MQ=255) cGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGGAGGcgcg < 1:1481541/139‑1 (MQ=255) tCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGGAGGCGCGGGACa < 1:570653/131‑1 (MQ=255) tCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGGAGGCGCGGGACa > 2:570653/1‑131 (MQ=255) tCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGGAGGCGCGGGACAGACGATTg > 2:947226/1‑139 (MQ=255) tCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGAAGGCGCGGGACAGACGAt > 2:95509/1‑137 (MQ=255) tCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGAAGGCGCGGGACAGACGAt < 1:95509/137‑1 (MQ=255) tCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGAAGGCGCGGGACAGACGATTg > 1:791464/1‑139 (MQ=255) tCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTAGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGAAGGCGCGGGACAGACGATTg > 2:1169966/1‑139 (MQ=255) aCCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGcc > 1:1361011/1‑139 (MQ=255) aaTTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCcgcgcg < 1:524060/139‑1 (MQ=255) aTTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGt < 1:999338/139‑1 (MQ=255) gTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTg > 2:1524906/1‑139 (MQ=255) ggcggcGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACg < 1:221327/139‑1 (MQ=255) gcggcgATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGc < 1:1524906/139‑1 (MQ=255) gCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCAc < 1:649374/139‑1 (MQ=255) gATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGTCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGc < 1:24067/139‑1 (MQ=255) gATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGc < 1:1169966/139‑1 (MQ=255) gATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGc < 2:258808/139‑1 (MQ=255) cTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATg < 1:1257610/139‑1 (MQ=255) gATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATgcg < 1:947226/139‑1 (MQ=255) aTGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATgcgc > 1:468286/1‑139 (MQ=255) aTGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATg > 1:1490823/1‑136 (MQ=255) aTGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATg < 2:1490823/136‑1 (MQ=255) aTGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACt < 1:848708/109‑1 (MQ=255) aTGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACt > 2:848708/1‑109 (MQ=255) tctcCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATggg > 2:1154722/1‑139 (MQ=255) tgcGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGGAGGCGCGGGACAGACGCTTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCa < 2:980952/137‑1 (MQ=255) tcCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACg > 1:575458/1‑90 (MQ=255) tcCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACg < 2:575458/90‑1 (MQ=255) tcCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCa < 2:249969/139‑1 (MQ=255) ccGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCAt < 1:1144170/139‑1 (MQ=255) cGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATg > 2:695868/1‑139 (MQ=255) tAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGGAGGCGCGGGACAg > 2:1164747/1‑50 (MQ=255) tAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGGAGGCGCGGGACAg < 1:1164747/50‑1 (MQ=255) ccGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTg > 2:331921/1‑109 (MQ=255) ccGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTg < 1:331921/109‑1 (MQ=255) ccGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCt > 2:526036/1‑139 (MQ=255) ccGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCg > 2:813784/1‑71 (MQ=255) ccGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCg < 1:813784/71‑1 (MQ=255) aCCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGa < 2:1361011/139‑1 (MQ=255) gTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACt > 2:421479/1‑139 (MQ=255) aaCGCAGTATATGCAGCCGCCGGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACttt > 1:1478266/1‑139 (MQ=255) gCAGTATATGCAGCCGCCGGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGc < 2:506621/139‑1 (MQ=255) cAGTATATGCAGCCGCCGGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCt < 2:524073/139‑1 (MQ=255) gTATATGCAGCCGCCGGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTc < 1:491798/61‑1 (MQ=255) gTATATGCAGCCGCCGGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTc > 2:491798/1‑61 (MQ=255) gTATATGCAGCCGCCGGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTAt > 1:537162/1‑139 (MQ=255) atatGCAGCCGCCGGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCgg > 1:518455/1‑88 (MQ=255) atatGCAGCCGCCGGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCgg < 2:518455/88‑1 (MQ=255) atatGCAGCCGCCGGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCg < 1:526036/139‑1 (MQ=255) tGCAGCCGCCGGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGa > 2:1214191/1‑122 (MQ=255) tGCAGCCGCCGGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGa < 1:1214191/122‑1 (MQ=255) gCAGCCGCCGGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGc < 2:726714/62‑1 (MQ=255) gCAGCCGCCGGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGc > 1:726714/1‑62 (MQ=255) aGCCGCCGGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATaa > 1:1216430/1‑139 (MQ=255) gccgccGGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCgg > 2:27512/1‑81 (MQ=255) gccgccGGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCgg < 1:27512/81‑1 (MQ=255) gccgccGGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAAt > 1:526024/1‑139 (MQ=255) gccgccGGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTa < 2:136840/129‑1 (MQ=255) gccgccGGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTa > 1:136840/1‑129 (MQ=255) ccgccgGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCgg < 2:777854/116‑1 (MQ=255) ccgccgGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCgg > 1:777854/1‑116 (MQ=255) ccgccgGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCt > 1:1043924/1‑127 (MQ=255) ccgccgGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCt < 2:1043924/127‑1 (MQ=255) cgctggAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAAttt > 2:807029/5‑139 (MQ=255) cgccgGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGAt < 1:345761/46‑1 (MQ=255) cgccgGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGAt > 2:345761/1‑46 (MQ=255) cgccgGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTTACTACGGCTTAACCg < 1:1009318/78‑1 (MQ=255) cgccgGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTTACTACGGCTTAACCg > 2:1009318/1‑78 (MQ=255) cgccgGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGa < 2:35918/87‑1 (MQ=255) cgccgGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGa > 1:35918/1‑87 (MQ=255) cgccgGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGgcg < 2:73462/110‑1 (MQ=255) cgccgGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGgcg > 1:73462/1‑110 (MQ=255) cgccgGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGa > 2:17685/1‑116 (MQ=255) cgccgGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGa < 1:17685/116‑1 (MQ=255) cgccgGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAAttt > 2:507040/1‑139 (MQ=255) cgccgGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAAttt > 2:188361/1‑139 (MQ=255) cgccgGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCg > 2:232290/1‑44 (MQ=255) cgccgGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCg < 1:232290/44‑1 (MQ=255) ccgGGAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGc > 2:1357346/1‑139 (MQ=255) ccgGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTc < 2:652751/111‑1 (MQ=255) ccgGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTc > 1:652751/1‑111 (MQ=255) | CTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGAAGGCGCGGGACAGACGATTGAGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGC > NC_000913/329706‑329973 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |