| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,656,744 | G→A | *187* (TAG→TAA) | speG → | spermidine N(1)‑acetyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,656,744 | 0 | G | A | 100.0% | 250.7 / NA | 77 | *187* (TAG→TAA) | speG | spermidine N(1)‑acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (38/39); total (38/39) | |||||||||||
TTGAAGGTGAATTGATGCACGAGTTCTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAGCATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGCTCTGTTTTA > NC_000913/1656608‑1656874 | ttGAAGGTGAATTGATGCACGAGTTCTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACa < 2:197636/139‑1 (MQ=255)ttGAAGGTGAATTGATGCACGAGTTCTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGATCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACa < 2:1103683/139‑1 (MQ=255) gAAGGTGAATTGATGCACGAGTTCTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACAtt < 1:999698/139‑1 (MQ=255) gCACGAGTTCTTTATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAatcgatc > 1:1146149/1‑139 (MQ=255) tttATTAATGGTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGa < 2:789179/139‑1 (MQ=255) gTCAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAAc > 1:509190/1‑139 (MQ=255) cAATATCGTAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAAccc > 1:199049/1‑139 (MQ=255) tAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATtaa < 2:661449/97‑1 (MQ=255) tAATGCCATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATtaa > 1:661449/1‑97 (MQ=255) ccATTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCggg > 2:1017812/1‑139 (MQ=255) aTTCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGtt > 2:796873/1‑139 (MQ=255) ttCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACa < 1:559073/85‑1 (MQ=255) ttCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATtaataat < 2:464810/93‑1 (MQ=255) ttCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATtaataat > 1:464810/1‑93 (MQ=255) ttCGCATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCAGTTCGACGGCGGGttt > 1:260852/1‑139 (MQ=255) cATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACt < 2:538889/139‑1 (MQ=255) cATGTGTATATTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACt < 2:330058/139‑1 (MQ=255) tatTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGa > 2:381296/1‑99 (MQ=255) tatTCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGa < 1:381296/99‑1 (MQ=255) tCCAGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATcaac > 1:297119/1‑139 (MQ=255) aGCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAAt > 2:750110/1‑139 (MQ=255) gCATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATg > 1:1540582/1‑139 (MQ=255) cATCAGTATCTGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGa > 2:681521/1‑139 (MQ=255) 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tGGCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACa < 1:796873/139‑1 (MQ=255) gCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGa > 1:296618/1‑79 (MQ=255) gCAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGa < 2:296618/79‑1 (MQ=255) cAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGa < 2:894737/78‑1 (MQ=255) cAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGa > 1:894737/1‑78 (MQ=255) cAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTc < 2:670958/139‑1 (MQ=255) cAGAGCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTc > 1:670958/1‑139 (MQ=255) agagCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTtca < 1:485171/115‑1 (MQ=255) agagCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTtca > 2:485171/1‑115 (MQ=255) agCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACa < 1:777292/49‑1 (MQ=255) agCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACa > 2:777292/1‑49 (MQ=255) agCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGa > 2:1499277/1‑75 (MQ=255) agCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGa < 1:1499277/75‑1 (MQ=255) agCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGAt < 1:1554494/76‑1 (MQ=255) agCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGAt > 2:1554494/1‑76 (MQ=255) agCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGAcggcg < 1:1573091/98‑1 (MQ=255) agCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGAcggcg > 2:1573091/1‑98 (MQ=255) agCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGAc < 2:1141448/132‑1 (MQ=255) agCACAAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGAc > 1:1141448/1‑132 (MQ=255) cacaAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACt > 2:1582060/1‑105 (MQ=255) cacaAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACt < 1:1582060/105‑1 (MQ=255) cacaAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCg > 2:1528077/1‑139 (MQ=255) cacaAAACACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCg > 2:286110/1‑139 (MQ=255) aaaaCACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGa < 2:1228830/70‑1 (MQ=255) aaaaCACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGa > 1:1228830/1‑70 (MQ=255) aaaCACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGt < 2:1146730/61‑1 (MQ=255) aaaCACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGt > 1:1146730/1‑61 (MQ=255) aaaCACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGa > 1:1121454/1‑69 (MQ=255) aaaCACCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGa < 2:1121454/69‑1 (MQ=255) acacCGGGTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAg < 2:1146149/139‑1 (MQ=255) gggTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGa < 2:199049/139‑1 (MQ=255) gggTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGa < 1:1017812/139‑1 (MQ=255) gggTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGa < 1:265824/139‑1 (MQ=255) gTCAGACTCTCCTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACt < 2:509190/139‑1 (MQ=255) ccTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCa < 1:858468/113‑1 (MQ=255) ccTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCa > 2:858468/1‑113 (MQ=255) ccTGAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTca > 1:614400/1‑139 (MQ=255) gAAGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAg < 2:1540582/139‑1 (MQ=255) aGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGct < 2:614400/139‑1 (MQ=255) aGCCGACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTCATATTCACAGct < 1:1528077/139‑1 (MQ=255) gACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTc > 1:1392621/1‑123 (MQ=255) gACCGCACAATAACATTAATAATAATCGATCGTATTTTTGATGGTGTAAACCCGTTCGACGGCGGGTTTTACTCCTTCATCAACAATGATTAGCTGACAGTCCACCGGATTAGCGTGACTGTc < 2:1392621/123‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |