| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,984,193 | G→A | *412* (TAG→TAA) | aslB → | putative AslA‑specific sulfatase‑maturating enzyme |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,984,193 | 0 | G | A | 100.0% | 293.3 / NA | 89 | *412* (TAG→TAA) | aslB | putative AslA‑specific sulfatase‑maturating enzyme |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (49/40); total (49/40) | |||||||||||
GTGCCGGGTATCAGCGTTATTTCCGCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATCGTGCAAATTCAATAAATTGCAGCGTTCTGTAGGCTGGATAAGATGCGTCAGCATCGCATCCGGCAAAGG > NC_000913/3984069‑3984328 | gtgCCGGGTATCAGCGTTATTTCCGCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAAAAATCGGCGgccgc > 1:829857/1‑139 (MQ=255) tgCCGGGTATCAGCGTTATTTCCGCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAAAAATCGGCGgccgcc < 2:525264/139‑1 (MQ=255) gCCGGGTATCAGCGTTATTTCCGCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAAAAATCGGCGGCCGCCt > 1:224208/1‑139 (MQ=255) gggTATCAGCGTTATTTCCGCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAAAAATCGGCGGCCGCCTGCg > 2:1481869/1‑139 (MQ=255) gTTATTTCCGCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAAAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGcc > 1:1179246/1‑139 (MQ=255) ttATTTCCGCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAAAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCg > 1:1473527/1‑139 (MQ=255) aTTTCCGCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGCGAGTAAGTAAAAATCGGCGGCCGCCTg < 2:988677/124‑1 (MQ=255) aTTTCCGCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTAGTGGTGAGTAAGTAAAAATCGGCGGCCGCCTg > 1:988677/1‑124 (MQ=255) tCCGCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAAAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATgc < 2:1473527/139‑1 (MQ=255) gCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAAAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATgcggc > 2:1465645/1‑139 (MQ=255) ccATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAAAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATgcggcg > 2:291795/1‑139 (MQ=255) tatCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAAAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATc > 1:1156233/1‑139 (MQ=255) tatCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAAAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATc < 2:224208/139‑1 (MQ=255) tatCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAAAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATc > 1:1055840/1‑139 (MQ=255) tatCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAAAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATc < 2:1055840/139‑1 (MQ=255) tCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAAAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCg < 1:291795/139‑1 (MQ=255) 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2:1242470/1‑83 (MQ=255) tGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAAAAATcggcg < 1:1242470/83‑1 (MQ=255) tGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAAAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCg > 1:957754/1‑128 (MQ=255) tGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAAAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCg < 2:957754/128‑1 (MQ=255) tGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAAAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGAt > 2:1103489/1‑139 (MQ=255) tGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAAAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGAt > 2:1011476/1‑139 (MQ=255) tGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAAAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGAt > 2:677291/1‑139 (MQ=255) 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agtaagtaAAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTACCGGATGCGGCGTa > 1:931300/1‑50 (MQ=38) agtaagtaAAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTACCGGATGCGGCGTa < 2:931300/50‑1 (MQ=38) agtaAAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATgcg > 2:31145/1‑41 (MQ=255) agtaAAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATgcg < 1:31145/41‑1 (MQ=255) agtaAAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCg < 2:592927/59‑1 (MQ=255) agtaAAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCg > 1:592927/1‑59 (MQ=255) gtaAAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATgcg > 1:19566/1‑40 (MQ=255) gtaAAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATgcg < 2:19566/40‑1 (MQ=255) gtaAAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTAt > 2:100980/1‑55 (MQ=255) gtaAAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTAt < 1:100980/55‑1 (MQ=255) gtaAAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATCGTGCAAATTCAATAAATTGCAGCGTTCTGTAGGCTGGATAAGATGCGTCAGCATCGCATCCGGCAAAgg > 1:521209/1‑139 (MQ=255) | GTGCCGGGTATCAGCGTTATTTCCGCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATCGTGCAAATTCAATAAATTGCAGCGTTCTGTAGGCTGGATAAGATGCGTCAGCATCGCATCCGGCAAAGG > NC_000913/3984069‑3984328 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |