| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 468,932 | C→T | A21V (GCT→GTT) | mdlA → | putative multidrug ABC transporter ATPase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 468,932 | 0 | C | T | 100.0% | 215.5 / NA | 67 | A21V (GCT→GTT) | mdlA | putative multidrug ABC transporter ATPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (35/32); total (35/32) | |||||||||||
GATGGAACAGATTAAATACACCACTTCTTTACCCATCGAATAAATATCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGCTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGTGGTTGGTATTGTTGTCGATGGCGTGACAGAACAACACTTTACTACCGGGCAGATCCTGATGTGGATCGCCACCATGGTGCTGAT > NC_000913/468799‑469067 | gATGGAACAGATTAAATACACCACTTCTTTACCCATCGAATAAATATCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCg < 1:549433/139‑1 (MQ=255) aTGGAACAGATTAAATACACCACTTCTTTACCCATCGAATAAATATCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGc < 2:340201/139‑1 (MQ=255) gAACATATTAAATACACCACTTCTTTACCCATCGAATAAATATCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCctt < 2:1153786/139‑1 (MQ=255) ccacTTCTTTACCCATCGAATAAATATCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATcgcg > 2:1105839/1‑139 (MQ=255) ccacTTCTTTACCCATCGAATAAATATCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATcgcg > 1:346792/1‑139 (MQ=255) ttcttTACCCATCGAATAAATATCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGAtgc > 1:782017/1‑139 (MQ=255) ttcttTACCCATCGAATAAATATCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGAtgc > 2:354423/1‑139 (MQ=255) ttcttTACCCATCGAATAAATATCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGAtgc > 2:63129/1‑139 (MQ=255) ttcttTACCCATCGAATAAATATCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGAtgc > 2:723919/1‑139 (MQ=255) cttTACCCATCGAATAAATATCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGAtgctg < 1:63129/139‑1 (MQ=255) cttTACCCATCGAATAAATATCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGAtgctg < 1:354423/139‑1 (MQ=255) cccATCGAATAAATATCCAGAATCAGGTCCGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTCTGTCGGGGTTGGCGCATTCCTTGTCCTTATCTCGATGATGCAACt > 2:1197040/1‑139 (MQ=255) aTCGAATAAATATCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGAtgct < 2:578272/130‑1 (MQ=255) aTCGAATAAATATCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGAtgct > 1:578272/1‑130 (MQ=255) aTCGAATAAATATCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGt > 2:146214/1‑139 (MQ=255) cGAATAAATATCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCct < 1:963868/106‑1 (MQ=255) cGAATAAATATCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTc > 1:187351/1‑139 (MQ=255) cGAATAAATATCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTc > 2:177057/1‑139 (MQ=255) cGAACAAATATCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCGGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCct > 2:963868/1‑106 (MQ=255) tatCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCaaaa < 1:973536/139‑1 (MQ=255) tatCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCaaaa < 1:614377/139‑1 (MQ=255) atCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGt > 2:784462/1‑128 (MQ=255) atCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGt < 1:784462/128‑1 (MQ=255) tCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAATTGGTTCCGCCAAAAGt > 2:44480/1‑139 (MQ=255) aaTCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGcc > 1:1574230/1‑90 (MQ=255) aaTCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGcc < 2:1574230/90‑1 (MQ=255) aaTCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGtggttg > 2:171402/1‑139 (MQ=255) tcaggtcaggACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGtggt > 1:1409612/1‑135 (MQ=255) tcaggtcaggACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGtggt < 2:1409612/135‑1 (MQ=255) caggtcaggACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGTGGTTGGTa < 1:171402/139‑1 (MQ=255) caggtcaggACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGTGGTTGGTa < 1:177057/139‑1 (MQ=255) gtcaggACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGTGGTTGGTAttg > 1:525127/1‑139 (MQ=255) gACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGTGGTTGGTATTGTTGTc > 2:608239/1‑139 (MQ=255) gACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGTGGTTGGTATTGTTGTc > 1:569810/1‑139 (MQ=255) gACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGTGGTTGGTATTGTTGTc > 1:384269/1‑139 (MQ=255) aaCGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGTGGTTGGTATTGTTGTCGATgg > 2:1612547/1‑139 (MQ=255) aaCGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGTGGTTGGTATTGTTGTCGATgg > 2:583139/1‑139 (MQ=255) aCGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGcc < 2:1243422/73‑1 (MQ=255) aCGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGcc > 1:1243422/1‑73 (MQ=255) aCGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGt < 1:946320/105‑1 (MQ=255) aCGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGt > 2:946320/1‑105 (MQ=255) gcgTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGTGGTTGGTATTGTTGTCGATGGCGt < 2:1413935/139‑1 (MQ=255) gTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCaaaa > 1:162512/1‑111 (MQ=255) gTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCAGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCaaaa < 2:162512/111‑1 (MQ=255) tGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTcc < 1:615643/103‑1 (MQ=255) tGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTcc > 2:615643/1‑103 (MQ=255) attTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGTGGTTGGTATTGTTGTCGATGGCGTGACAGaacaa < 1:1105839/139‑1 (MQ=255) attTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGTGGTTGGTATTGTTGTCGATGGCGTGACAGaacaa < 1:1612547/139‑1 (MQ=255) cTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGTGGTTGGTATTGTTGTCGATGGCGTGACAGAACAACACtt > 2:843938/1‑139 (MQ=255) aaTTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTg < 1:635470/48‑1 (MQ=255) aaTTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTg > 2:635470/1‑48 (MQ=255) tAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGTGGTTGGTATTGTTGTCGATGGCGTGACAGAACAACACTTtactac < 1:146214/139‑1 (MQ=255) tGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGTGGTTGGTATTGTTGTCGATGGCGTGACAGAACAACACTTTACTACCGGGc < 1:723919/139‑1 (MQ=255) tGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGTGGTTGGTATTGTTGTCGATGGCGTGACAGAACAACACTTTACTACCGGGc < 2:633228/139‑1 (MQ=255) gTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTc < 2:601117/52‑1 (MQ=255) gTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTc > 1:601117/1‑52 (MQ=255) gTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGTGGTTGGTATTGTTGTCGATGGCGTGACAGAACAACACTTTACTACCGGGCAg > 2:1099538/1‑139 (MQ=255) gTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGTGGTTGGTATTGTTGTCGATGGCGTGACAGAACAACACTTTACTACCGGGCAg > 2:945382/1‑139 (MQ=255) tttCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGTGGTTGGTATTGTTGTCGATGGCGTGACAGAACAACACTTTACTACCGGGCAGATc < 1:843938/139‑1 (MQ=255) tttCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGTGGTTGGTATTGTTGTCGATGGCGTGACAGAACAACACTTTACTACCGGGCAGATc < 1:608239/139‑1 (MQ=255) cGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGt > 2:304853/1‑77 (MQ=255) cGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGt < 1:304853/77‑1 (MQ=255) gggAATGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGGCAGGTTGATTAAAATTAAAGCGATGCTGAAAATGGTTCGGCCGAAAGTGGTAGGAATTGTAGTCGATAGCGTAAGAAAACAAGAGTTTACTACCGGGAGAATCATGAtgtg > 2:758471/1‑139 (MQ=255) aaTGGCGTCGCTATCTCGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGTGGTTGGTATTGTTGTCGATGGCGTGACAGAACAACACTTTACTACCGGGCAGATCCTGATGTGGAt < 2:384269/139‑1 (MQ=255) ctcGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGc < 1:552388/52‑1 (MQ=255) ctcGGGGTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGc > 2:552388/1‑52 (MQ=255) gggTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGTGGTTGGTATTGTTGTCGATGGCGTGACAGAACAACACTTTACTACCGGGc > 2:1228939/1‑105 (MQ=255) gggTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGTGGTTGGTATTGTTGTCGATGGCGTGACAGAACAACACTTTACTACCGGGCAGATCCTGATGTGGATCGCCACCATGGTGCTGAt < 1:945382/139‑1 (MQ=255) gggTTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGTGGTTGGTATTGTTGTCGATGGCGTGACAGAACAACACTTTACTACCGGGCAGATCCTGATGTGGATCGCCACCATGGTGCTGAt > 1:1001346/1‑139 (MQ=255) | GATGGAACAGATTAAATACACCACTTCTTTACCCATCGAATAAATATCCAGAATCAGGTCAGGACACAACGCGTGCGATTATTTGCTCAATTAAGCTGGTATTTCCGTCGGGAATGGCGTCGCTATCTCGGGGCTGTCGCCTTGCTTGTCATTATCGCGATGCTGCAACTGGTTCCGCCAAAAGTGGTTGGTATTGTTGTCGATGGCGTGACAGAACAACACTTTACTACCGGGCAGATCCTGATGTGGATCGCCACCATGGTGCTGAT > NC_000913/468799‑469067 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |