| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1287084 | 20 (0.350) | 24 (0.520) | 13/162 | 2.2 | 50.5% | noncoding (153/171 nt) | rttR | rtT sRNA, processed from tyrT transcript |
| ? | NC_000913 | 1287557 = | 31 (0.670) | noncoding (66/85 nt) | tyrT | tRNA‑Tyr | |||||
GGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACGCGCCG > NC_000913/1287422‑1287693 | ggCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGaa < 2:853450/139‑1 (MQ=255) ctggcgctcgagccgaaccttaatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCg > 1:1094600‑M2/124‑139 (MQ=255) gcgctcgagccgaaccttaatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATg > 1:367320‑M2/121‑139 (MQ=255) aaccttaatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGAc > 2:93606‑M2/109‑129 (MQ=255) aaccttaatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGAc < 1:93606‑M2/21‑1 (MQ=255) accttaatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTAc < 2:367320‑M2/32‑1 (MQ=255) aaCCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAg > 2:361201/1‑139 (MQ=255) ttaatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGt < 2:116677‑M2/35‑1 (MQ=255) aatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTa < 1:1251747‑M2/31‑1 (MQ=255) aatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTa > 2:1251747‑M2/103‑133 (MQ=255) aatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCt > 2:1480240‑M2/103‑139 (MQ=255) aaGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCtt < 2:844015/102‑1 (MQ=255) aaGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCtt > 1:844015/1‑102 (MQ=255) aGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGt > 2:818673/1‑128 (MQ=255) aGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGt < 1:818673/128‑1 (MQ=255) ggTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTAc > 1:707050/1‑124 (MQ=255) ggTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTAc < 2:707050/124‑1 (MQ=255) ttCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGc < 2:122094/139‑1 (MQ=255) ccttccccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCt < 2:1094600‑M2/53‑1 (MQ=255) cTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCggg < 2:503413/139‑1 (MQ=255) cccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCa > 1:965942‑M2/82‑106 (MQ=255) cccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCa < 2:965942‑M2/25‑1 (MQ=255) tCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGaa < 2:597951/139‑1 (MQ=255) gcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACgg > 1:250117‑M2/73‑95 (MQ=255) gcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACgg < 2:250117‑M2/23‑1 (MQ=255) gAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCccacca < 1:361201/139‑1 (MQ=255) tGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGc > 2:1141151/1‑118 (MQ=255) tGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGc < 1:1141151/118‑1 (MQ=255) tGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCggg < 2:1152838/126‑1 (MQ=255) tGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCggg > 1:1152838/1‑126 (MQ=255) ttCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGc > 1:1127782/1‑139 (MQ=255) ttCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGc > 1:237402/1‑139 (MQ=255) cacaATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCt > 2:39369/1‑138 (MQ=255) cacaATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCt < 1:39369/138‑1 (MQ=255) tgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCa > 2:610456‑M2/59‑83 (MQ=255) tgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCa < 1:610456‑M2/25‑1 (MQ=255) cggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTAc < 1:1141385‑M2/32‑1 (MQ=255) cggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTAc > 2:1141385‑M2/57‑88 (MQ=255) ccGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACTTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACGGTCTGCTCCC‑TTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCt < 2:1282260/139‑1 (MQ=255) gTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGAc > 2:1004819/1‑65 (MQ=255) gTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGAc < 1:1004819/65‑1 (MQ=255) tcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTg > 2:894639‑M2/40‑86 (MQ=255) tcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTg < 1:894639‑M2/47‑1 (MQ=255) tgtgGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAg > 1:11877/1‑139 (MQ=255) tgtgGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAg < 2:11877/139‑1 (MQ=255) tttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTc < 2:1129893‑M2/54‑1 (MQ=255) tttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTc > 1:1129893‑M2/31‑84 (MQ=255) ttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCggg < 2:1419202‑M2/57‑1 (MQ=255) ttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCggg > 1:1419202‑M2/30‑86 (MQ=255) aaTTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTa < 2:1036401/98‑1 (MQ=255) aaTTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTa > 1:1036401/1‑98 (MQ=255) aaTTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCg > 1:460070/1‑134 (MQ=255) aaTTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCg < 2:460070/134‑1 (MQ=255) ttATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTg > 1:955334/1‑114 (MQ=255) ttATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTg < 2:955334/114‑1 (MQ=255) tggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCa < 2:750542‑M2/25‑1 (MQ=255) tggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCa > 1:750542‑M2/20‑44 (MQ=255) tggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTg < 2:908713‑M2/38‑1 (MQ=255) tggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTg > 1:908713‑M2/20‑57 (MQ=255) tggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCggg > 2:170347‑M2/17‑73 (MQ=255) tggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCggg < 1:170347‑M2/57‑1 (MQ=255) ggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATc > 2:807755‑M2/16‑139 (MQ=255) gtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACg > 2:168748‑M2/15‑83 (MQ=255) gtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACg < 1:168748‑M2/69‑1 (MQ=255) gtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCa > 1:901007‑M2/15‑139 (MQ=255) gggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTg < 2:174052‑M2/38‑1 (MQ=255) gggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTg > 1:174052‑M2/13‑50 (MQ=255) gggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCt < 1:487886‑M2/94‑1 (MQ=255) gggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCt > 2:487886‑M2/13‑106 (MQ=255) ggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGcatc > 1:613437‑M2/12‑130 (MQ=255) ggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGcatc < 2:613437‑M2/119‑1 (MQ=255) ggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCt < 2:542033‑M2/91‑1 (MQ=255) ggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCt > 1:542033‑M2/10‑100 (MQ=255) ggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGa > 2:1251202‑M2/10‑139 (MQ=255) gaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCccac > 2:80277‑M2/9‑73 (MQ=255) gaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCccac < 1:80277‑M2/65‑1 (MQ=255) aaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGAcg < 2:1127782‑M2/132‑1 (MQ=255) aaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGAcg < 2:237402‑M2/132‑1 (MQ=255) gattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACgcgc > 2:93964‑M2/5‑139 (MQ=255) attCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTg > 2:1441074‑M2/4‑41 (MQ=255) attCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTg < 1:1441074‑M2/38‑1 (MQ=255) ttCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACGcgccg < 2:1210897‑M2/137‑1 (MQ=255) tCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGc < 2:1419914‑M2/49‑1 (MQ=255) tCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGc > 1:1419914‑M2/2‑50 (MQ=255) cGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTc < 1:285269/95‑1 (MQ=255) cGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTc > 2:285269/1‑95 (MQ=255) | GGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACGCGCCG > NC_000913/1287422‑1287693 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |