| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,841,897 | G→A | *136* (TAG→TAA) T80I (ACT→ATT) |
nudG → ynjH ← |
CTP pyrophosphohydrolase, also hydrolyzes 2‑hydroxy‑dATP, 8‑hydroxy‑dGTP, 5‑hydroxy‑CTP, dCTP and 5‑methyl‑dCTP DUF1496 family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,841,897 | 0 | G | A | 100.0% | 148.7 / NA | 46 | *136* (TAG→TAA) T80I (ACT→ATT) | nudG ynjH | CTP pyrophosphohydrolase, also hydrolyzes 2‑hydroxy‑dATP, 8‑hydroxy‑dGTP, 5‑hydroxy‑CTP, dCTP and 5‑methyl‑dCTP DUF1496 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (23/23); total (23/23) | |||||||||||
ACGTTACAGGCACATGAACATCAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGA > NC_000913/1841763‑1842027 | aCGTTACAGGCACATGAACATCAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCt > 1:1241901/1‑139 (MQ=255) caTGAACATCAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTCATGCTAAGGGTTTTGtc < 1:942359/139‑1 (MQ=255) aTGAACATCAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGtca > 2:783733/1‑139 (MQ=255) aaCATCAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGtcatca > 2:1136207/1‑139 (MQ=255) aTCAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGc < 2:1091726/139‑1 (MQ=255) ctggtctggtGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCAt > 2:765285/1‑137 (MQ=255) ctggtctggtGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCAt < 1:765285/137‑1 (MQ=255) ctggtctggtGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTg < 2:1241901/139‑1 (MQ=255) gtctggtGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTgcag < 1:1136207/139‑1 (MQ=255) cACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGtt > 2:768067/1‑106 (MQ=255) cACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGtt < 1:768067/106‑1 (MQ=255) aCCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCtt > 2:1060946/1‑139 (MQ=255) aaGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCt > 2:1199881/1‑139 (MQ=255) gcTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCgg < 2:1240693/130‑1 (MQ=255) gcTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCgg > 1:1240693/1‑130 (MQ=255) cAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGc < 1:1060946/139‑1 (MQ=255) cAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGc < 1:783733/139‑1 (MQ=255) gCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGtt > 2:127398/1‑77 (MQ=255) gCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGtt < 1:127398/77‑1 (MQ=255) ccccTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCtt < 2:570775/110‑1 (MQ=255) ccccTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCtt > 1:570775/1‑110 (MQ=255) tgctgACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAAtttt > 1:1488762/1‑139 (MQ=255) gACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATc < 1:1199881/139‑1 (MQ=255) aCATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCg > 2:1129212/1‑103 (MQ=255) aCATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCg < 1:1129212/103‑1 (MQ=255) attattAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTgg > 1:422737/1‑75 (MQ=255) attattAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTgg < 2:422737/75‑1 (MQ=255) ttaGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACgca < 2:1488762/139‑1 (MQ=255) ggCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTgg < 1:228853/66‑1 (MQ=255) ggCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTgg > 2:228853/1‑66 (MQ=255) gTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCtt > 1:549852/1‑82 (MQ=255) gTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCtt < 2:549852/82‑1 (MQ=255) tttATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGt > 2:696576/1‑139 (MQ=255) tATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGc > 2:1056986/1‑37 (MQ=255) tATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGc < 1:1056986/37‑1 (MQ=38) tttACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCt > 2:757801/1‑139 (MQ=255) tACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACgca < 1:1344105/120‑1 (MQ=255) tACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACgca > 2:1344105/1‑120 (MQ=255) ccgccAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTAcc > 2:1357879/1‑79 (MQ=255) ccgccAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTAcc < 1:1357879/79‑1 (MQ=255) cgccAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTAc < 1:1165255/77‑1 (MQ=255) cgccAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTAc > 2:1165255/1‑77 (MQ=255) cAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGcc < 1:757801/139‑1 (MQ=255) gCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCctga > 2:1073381/1‑139 (MQ=255) ggATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTgc < 1:716169/39‑1 (MQ=255) ggATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTgc > 2:716169/1‑39 (MQ=255) | ACGTTACAGGCACATGAACATCAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGA > NC_000913/1841763‑1842027 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |