| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 323,355 | C→T | P340S (CCA→TCA) | ykgF → | ferridoxin‑like LutB family protein, putative electron transport chain YkgEFG component |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 323,355 | 0 | C | T | 100.0% | 113.9 / NA | 37 | P340S (CCA→TCA) | ykgF | ferridoxin‑like LutB family protein, putative electron transport chain YkgEFG component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (21/16); total (21/16) | |||||||||||
GGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGCTCTTTATGCACAGCTTGTGACAACGTGTGTCCGGTGCGTATTCCGCTGTCAAAACTGATTTTG > NC_000913/323227‑323486 | ggCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTATATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGt > 1:1215478/1‑137 (MQ=255)ggCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTATATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGt < 2:1215478/137‑1 (MQ=255) ttCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTg > 1:598856/1‑139 (MQ=255) ctGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCAGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTgg < 2:892188/139‑1 (MQ=255) ctgcGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTAtaaagatttta < 2:598856/139‑1 (MQ=255) tATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGAt < 2:355855/99‑1 (MQ=255) tATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGAt > 1:355855/1‑99 (MQ=255) tATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCAGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTa > 2:467134/1‑139 (MQ=255) gCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAGAGATTTTAAAGATTTACCCTACGc > 2:190902/1‑139 (MQ=255) tACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGCTCTTTATGcaca > 1:936075/1‑139 (MQ=255) cTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGCTCTTTATGCACAGc < 2:936075/139‑1 (MQ=255) tGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGCTCTTTATGCACAGCtt > 1:81693/1‑139 (MQ=255) tCCAGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGCTCTTTATGCACAGCTtgt < 1:467134/139‑1 (MQ=255) cGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGCTCTTTATGCACAGCTTGTGa > 2:1479063/1‑139 (MQ=255) tatCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTgg > 2:137271/1‑77 (MQ=255) tatCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTgg < 1:137271/77‑1 (MQ=255) atatTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGCTCTTTATGCACAGCTTGTGACAACGTGTGTcc < 1:931087/139‑1 (MQ=255) gCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTAtaaagattttaaagat < 1:226890/86‑1 (MQ=255) gCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTAtaaagattttaaagat > 2:226890/1‑86 (MQ=255) gTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTAccc > 2:1151375/1‑89 (MQ=255) gTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTAccc < 1:1151375/89‑1 (MQ=255) gTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGCTCTTTATGCACAGCTTGTGACAACGTGTGTCCGGTGCGTAt > 1:1317102/1‑139 (MQ=255) aTGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGCTCTTTATGCACAGCTTGTGACAACGTGTGTCCGGTGCGTATTcc < 1:1479063/139‑1 (MQ=255) ggCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTAtaaagattttaaagatt > 2:1043172/1‑73 (MQ=255) ggCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTAtaaagattttaaagatt < 1:1043172/73‑1 (MQ=255) ggCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGCTCTTTATGCACAGCTTGTGACAACGTGTGTCCGGTGCGTATTCCGCTGTCaa > 1:1490008/1‑139 (MQ=255) ggCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGCTCTTTACGCACAGCTTGTGACAACGTGTGTCCGGTGCGTATTCCGCTGTCaa > 2:1434109/1‑139 (MQ=255) ctctATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTAtaaaggttttaaagatt > 2:1263760/1‑71 (MQ=255) ctctATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTAtaaaggttttaaagatt < 1:1263760/71‑1 (MQ=255) tATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTgg < 2:1100832/45‑1 (MQ=255) tATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTgg > 1:1100832/1‑45 (MQ=255) tATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGCTCTTTATGCACAGCTTGTGACAACGTGTGTCCGGTGCGTATTCCGCTGTc > 1:161982/1‑132 (MQ=255) tATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGCTCTTTATGCACAGCTTGTGACAACGTGTGTCCGGTGCGTATTCCGCTGTc < 2:161982/132‑1 (MQ=255) tCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCt > 2:949949/1‑68 (MQ=255) tCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCt < 1:949949/68‑1 (MQ=255) tCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGCTCTTTATGCACAGCTTGTGACAACGTGTGTCCGGTGCGTATTCCGCTGTCAAAACTGATTTTg > 1:995278/1‑139 (MQ=255) gggTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGCTCTTTATGca > 1:1499717/1‑82 (MQ=255) | GGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGCTCTTTATGCACAGCTTGTGACAACGTGTGTCCGGTGCGTATTCCGCTGTCAAAACTGATTTTG > NC_000913/323227‑323486 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |