| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,893,271 | 0 | C | T | 31.6% | 111.1 / 56.7 | 79 | A169A (GCC→GCT) | yidZ | putative DNA‑binding transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (23/31); new base T (9/16); total (32/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.29e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.17e-01 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGCAAAGATCATCCGGCACTGCATCAAACGTGGAATCTGGACACCTTCTTACGTTATCCGCATATCAGCATTTGCTGGGAACA > NC_000913/3893133‑3893399 | cccGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGcc < 1:1025855/139‑1 (MQ=255)cccGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGcc < 1:1105120/139‑1 (MQ=255) cGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCAt < 2:91022/139‑1 (MQ=255) aGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCTATTGa < 2:774580/139‑1 (MQ=255) aGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGa > 1:1157690/1‑139 (MQ=255) aCCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCTATTGATTATg > 1:1247299/1‑139 (MQ=255) cATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCTATTGATTATGaa < 1:1013198/139‑1 (MQ=255) aTCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAg < 2:1170217/139‑1 (MQ=255) tCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGt < 2:1157690/139‑1 (MQ=255) cAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCTATTGATTATGAAGTg < 2:962198/139‑1 (MQ=255) cAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCTATTGATTATGAAGTg < 1:544703/139‑1 (MQ=255) cAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTg < 2:1031858/139‑1 (MQ=255) cAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTg < 2:1073915/139‑1 (MQ=255) cAAAGTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCTATTGATTATGAAGTg < 2:951269/139‑1 (MQ=255) gATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGc > 1:786506/1‑139 (MQ=255) aTTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCTATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGcc < 2:1247299/139‑1 (MQ=255) tACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCTATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCt > 2:324317/1‑139 (MQ=255) ttCCTTAGATGCCATTACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCTATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTc < 1:324317/139‑1 (MQ=255) tCCTTAGATGCCATTACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCt > 2:291323/1‑139 (MQ=255) ccTTAGATGCCATTACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTg < 2:712316/113‑1 (MQ=255) ccTTAGATGCCATTACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTg > 1:712316/1‑113 (MQ=255) ccTTAGATGCCATTACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCt > 2:66346/1‑132 (MQ=255) ccTTAGATGCCATTACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCt < 1:66346/132‑1 (MQ=255) cTTAGATGCCATTACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCTATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTgg < 2:727263/139‑1 (MQ=255) cTTAGATGCCATTACTCGTGGTGAAGCGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCTATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTgg > 1:138363/1‑139 (MQ=255) ttAGATGCCATTACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCTATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGt < 1:929781/139‑1 (MQ=255) gATGCCATTACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTAc < 1:931200/139‑1 (MQ=255) aTGCCATTACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCTATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACg < 1:417210/139‑1 (MQ=255) tGCCATTACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGc < 1:838790/139‑1 (MQ=255) cATTACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGaa < 2:329187/100‑1 (MQ=255) cATTACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGaa > 1:329187/1‑100 (MQ=255) aTTACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCTATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGCAAAg > 1:874142/1‑139 (MQ=255) aTTACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCTATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGCAAAg > 2:1106219/1‑139 (MQ=255) aTTACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTa < 1:105219/109‑1 (MQ=255) aTTACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTa > 2:105219/1‑109 (MQ=255) aTTACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGt < 1:666897/130‑1 (MQ=255) aTTACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGt > 2:666897/1‑130 (MQ=255) ttACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCTATTGATTATGAAGTg < 2:1278003/101‑1 (MQ=255) ttACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCTATTGATTATGAAGTg > 1:1278003/1‑101 (MQ=255) ttACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGCAAAGa < 1:291323/139‑1 (MQ=255) tCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGCAAAGatcat > 1:899900/1‑139 (MQ=255) cGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGCAAAGatcatc < 2:801142/139‑1 (MQ=255) tggtgAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAg < 2:283119/92‑1 (MQ=255) tggtgAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAg > 1:283119/1‑92 (MQ=255) ggtgAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCAt < 2:622976/80‑1 (MQ=255) ggtgAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCAt > 1:622976/1‑80 (MQ=255) ggtgAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGt > 1:1292970/1‑121 (MQ=255) ggtgAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGt < 2:1292970/121‑1 (MQ=255) tgAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCTATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGCAAAGATCATCCGGCa < 1:1106219/139‑1 (MQ=255) tgAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCTATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGCAAAGATCATCCGGCa < 2:138363/139‑1 (MQ=255) tgAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGCAAAGATCATCCGGCa < 1:238329/139‑1 (MQ=255) aaGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTg > 1:572303/1‑89 (MQ=255) aaGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTg < 2:572303/89‑1 (MQ=255) gTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGCAAAGATCATCCGGCACTGc > 1:97709/1‑139 (MQ=255) cGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCTATTGATTATg > 1:509737/1‑74 (MQ=255) cGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCTATTGATTATg < 2:509737/74‑1 (MQ=255) cGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGCAAAGATCATCCGGCACTGCATCAAACg > 1:607040/1‑139 (MQ=255) gTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATg > 2:1107252/1‑72 (MQ=255) gTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATg < 1:1107252/72‑1 (MQ=255) tttttCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGCAAAGATCATCCGGCAc < 1:1208986/125‑1 (MQ=255) tttttCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGCAAAGATCATCCGGCAc > 2:1208986/1‑125 (MQ=255) gTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCAt < 2:151834/55‑1 (MQ=255) gTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCAt > 1:151834/1‑55 (MQ=255) gTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGCAAAGATCATCCGGCACTGCATCAAACGTGGAATCTGGa > 1:976566/1‑139 (MQ=255) cgcgAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGCAAAGATCATCCGGCACTGCATCAAACGTGGAATCTGGaca < 1:505025/139‑1 (MQ=255) cgcgAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGCAAAGATCATCCGGCACTGCATCAAACGTGGAATCTGGaca < 2:906114/139‑1 (MQ=255) tcgcGGGAGCTGTTAAGCTCTCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGCAAAGATCATCCGGCACTGCATCAAACGTGGAATCTGGa > 2:772320/1‑119 (MQ=255) tcgcGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGCAAAGATCATCCGGCACTGCATCAAACGTGGAATCTGGa < 1:772320/119‑1 (MQ=255) gggAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGCAAAGATCATCCGGCACTGCATCAAACGTGGAATCTGGACACCTTCTTACGTTATCCGCatat > 2:71253/1‑139 (MQ=255) tGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGCAAAGATCATCCGGCACTGCATCAAACGTGGAATCTGGACACCTTCTTACGTTATCCGCATATCAGCAt < 2:976566/139‑1 (MQ=255) tGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGCAAAGATCATCCGGCACTGCATCAAACGTGGAATCTGGACACCTTCTTACGTTATCCGCATATCAGCAt < 2:1050051/139‑1 (MQ=255) tGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGCAAAGATCATCCGGCACTGCATCAAACGTGGAATCTGGACACCTTCTTACGTTATCCGCATATCAGCAt < 2:899900/139‑1 (MQ=255) ttAAGCTCGCTACCGTTAGCTATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGCAAAGATCATCCGGCACTGCATCAAACGTGGAATCTGGACACCTTCTTACGTTATCCGCATATCAGCAttt > 2:1253657/1‑139 (MQ=255) ttAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGt < 1:1113101/64‑1 (MQ=255) ttAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGt > 2:1113101/1‑64 (MQ=255) gCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGCAAAGATCATCCGGCACTGCATCAAACGTGGAATCTGGACACCTTCTTACGTTATCCGCATATCAGCATTTGCTGGGaa < 2:749689/139‑1 (MQ=255) tACCGTTAGCTATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGCAAAGATCATCCGGCACTGCATCAAACGTGGAATCTGGACACCTTCTTACGTTATCCGCATATCAGCATTTGCTGGGAACa < 2:483013/139‑1 (MQ=255) ttAGCTATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGCAAAGATCATCCGGCACTGCATCAAACGTGGAATCTGGaca < 2:772120/94‑1 (MQ=255) ttAGCTATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGCAAAGATCATCCGGCACTGCATCAAACGTGGAATCTGGaca > 1:772120/1‑94 (MQ=255) gCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGCAAAGATCATCCGGCACTGCATCAAACGTGGAATCTGGACACctt < 2:375623/95‑1 (MQ=255) gCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGCAAAGATCATCCGGCACTGCATCAAACGTGGAATCTGGACACctt > 1:375623/1‑95 (MQ=255) | CCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGTGAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGCAAAGATCATCCGGCACTGCATCAAACGTGGAATCTGGACACCTTCTTACGTTATCCGCATATCAGCATTTGCTGGGAACA > NC_000913/3893133‑3893399 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |