| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 3,766,316 | G→A | *1378* (TAG→TAA) | rhsA → | Rhs protein with putative toxin 55 domain, putative polysaccharide synthesis/export protein, putative neighboring cell growth inhibitor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,766,316 | 0 | G | A | 100.0% | 377.9 / NA | 115 | *1378* (TAG→TAA) | rhsA | Rhs protein with putative toxin 55 domain, putative polysaccharide synthesis/export protein, putative neighboring cell growth inhibitor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (51/64); total (51/64) | |||||||||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
ATGGGAAAAAACCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAAAGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGATAAAAAAAGATAGCCCTTGTGGAGGTTCCTGCAATGTCAAATACATACCAGAAAAGAAAGGCAAGTAAAGAGTATGGTTTATATAATCAATGTAAGAAACTAAATGATGATGAATTATTTCGCTTACTTGATGATCACAATT > NC_000913/3766180‑3766445 | aTGGGAAAAAACCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAAAGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGATAAAAAAAGATAAcc > 1:661325/1‑139 (MQ=255)aTGGGAAAAAACCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAAAGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGATAAAAAAAGATAAcc > 1:1101631/1‑139 (MQ=255)aTGGGAAAAAACCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAAAGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGATAAAAAAAGATAAcc > 1:573561/1‑139 (MQ=255) tGGGAAAAAACCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAAAGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGATAAAAAAAGATAAccc < 2:904799/139‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |