Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,515,284 | C→T | G465D (GGC→GAC) | fecA ← | TonB‑dependent outer membrane ferric citrate transporter and signal transducer, ferric citrate extracelluar receptor, FecR‑interacting protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,515,284 | 0 | C | T | 100.0% | 190.8 / NA | 59 | G465D (GGC→GAC) | fecA | TonB‑dependent outer membrane ferric citrate transporter and signal transducer, ferric citrate extracelluar receptor, FecR‑interacting protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (29/30); total (29/30) |
GTTCTGGTATGACTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGAAGGGCCGATCATAAAGATCTGGCTGTAGCGTGGCTC > NC_000913/4515151‑4515417 | gttCTGGTATGACTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGAc > 1:269530/1‑139 (MQ=255) gTATGACTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAAc > 1:1001745/1‑139 (MQ=255) gACTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGcc < 1:111983/139‑1 (MQ=255) aCTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGccc > 1:1007468/1‑139 (MQ=255) aCTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGccc > 2:1310272/1‑139 (MQ=255) aCTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGccc < 2:1007468/139‑1 (MQ=255) aCTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGccc > 1:946059/1‑139 (MQ=255) aCTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGccc > 1:419943/1‑139 (MQ=255) aCTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGccc > 1:1156914/1‑139 (MQ=255) aCTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACAGccc > 1:867011/1‑139 (MQ=255) atatGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCgctgc > 1:665697/1‑139 (MQ=255) atatGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCgctgc > 1:106053/1‑139 (MQ=255) tGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCtgg < 1:777390/139‑1 (MQ=255) aaCGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGgt > 1:100981/1‑139 (MQ=255) atgCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGgtg > 2:266149/3‑139 (MQ=255) aCGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGgtg < 1:979700/139‑1 (MQ=255) aCCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTaa < 2:419943/139‑1 (MQ=255) gCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTg > 2:1261966/1‑109 (MQ=255) gCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTg < 1:1261966/109‑1 (MQ=255) cGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCaa < 2:465963/105‑1 (MQ=255) cGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCaa > 1:465963/1‑105 (MQ=255) gATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGTCGGAACCCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCa < 2:946059/139‑1 (MQ=255) tGGTCCAGTTGCTGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGAAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATg < 1:1310272/139‑1 (MQ=255) gTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCg < 2:106053/139‑1 (MQ=255) aGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGa < 2:665697/139‑1 (MQ=255) gTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCaa < 2:959492/93‑1 (MQ=255) gTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCaa > 1:959492/1‑93 (MQ=255) gCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGattca < 2:744104/139‑1 (MQ=255) cGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGattcatt < 1:317288/139‑1 (MQ=255) tCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAAt < 2:104729/139‑1 (MQ=255) gTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCTGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAg > 2:1127231/1‑139 (MQ=255) cATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAgcc < 2:100981/139‑1 (MQ=255) ccAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACt < 2:1156914/139‑1 (MQ=255) cAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCgg < 2:39313/82‑1 (MQ=255) cAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCgg > 1:39313/1‑82 (MQ=255) aGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCg < 1:654255/68‑1 (MQ=255) aGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCg > 2:654255/1‑68 (MQ=255) ggCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCg > 1:193683/1‑139 (MQ=255) cgcCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCtggtgg < 2:270136/71‑1 (MQ=255) cgcCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCtggtgg > 1:270136/1‑71 (MQ=255) cgcCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAgcccacgcc > 1:607313/1‑126 (MQ=255) cgcCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAgcccacgcc < 2:607313/126‑1 (MQ=255) cGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGAAgg > 2:1091021/1‑139 (MQ=255) gAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAgcc > 2:1047024/1‑107 (MQ=255) gAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAgcc < 1:1047024/107‑1 (MQ=255) aCGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGAAGGGCCGATCATa < 2:1001745/139‑1 (MQ=255) cgTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCtggtgg > 1:293026/1‑53 (MQ=255) cgTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCtggtgg < 2:293026/53‑1 (MQ=255) cgTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCg > 1:385427/1‑77 (MQ=255) cgTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCg < 2:385427/77‑1 (MQ=255) cgTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGatt < 1:304851/83‑1 (MQ=255) cgTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGatt > 2:304851/1‑83 (MQ=255) cgTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAAt > 2:932869/1‑92 (MQ=255) cgTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAAt < 1:932869/92‑1 (MQ=255) gTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGAAGGGCCGATCATAAAGa < 1:657713/139‑1 (MQ=255) tCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCgg > 2:406719/1‑46 (MQ=255) tCGTAAGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCgg < 1:406719/46‑1 (MQ=255) aaGGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGAAGGGCCGATCATAAAGATCTGGCTGTAGCg < 1:1127231/139‑1 (MQ=255) ttGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGAAGGGCCGATCATAAAGATCTGGCTGTAGCGTGGCTc > 1:784488/1‑139 (MQ=255) | GTTCTGGTATGACTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGAAGGGCCGATCATAAAGATCTGGCTGTAGCGTGGCTC > NC_000913/4515151‑4515417 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |