Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 966,584 | G→A | *755* (TAG→TAA) | ycaI → | ComEC family inner membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 966,584 | 0 | G | A | 100.0% | 224.3 / NA | 69 | *755* (TAG→TAA) | ycaI | ComEC family inner membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (36/33); total (36/33) |
GGATTGATACTCCACATCAAGGTCAAACAACGGTCAATTTTTCAGCGCAAGGCTGGCGGATTAGCAGCCTCAGGGAGCAAATTTTACCTCGTTGGTATCATCAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAGAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACAAAGATCTCTCTACGTGGCAGACATTCCGCCGACTGTGGCCAACCATTGCGCCTTTCAAAGCGGGTCTGATCGTGGCGGGCGT > NC_000913/966451‑966715 | ggATTGATACTCCACATCAAGGTCAAACAACGGTCAATTTTTCAGCGCAAGGCTGGCGGATTAGCAGCCTCAGGGAGCAAATTTTACCTCGTTGGTATCATCAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAatat > 1:491050/1‑139 (MQ=255) gATTGATACTCCACATCAAGGTCAAACAACGGTCAATTTTTCAGCGCAAGGCTGGCGGATTAGCAGCCTCAGGGAGCAAATTTTACCTCGTTGGTATCATCAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATg > 2:981223/1‑139 (MQ=255) aTTGATACTCCACATCAAGGTCAAACAACGGTCAATTTTTCAGCGCAAGGCTGGCGGATTAGCAGCCTCAGGGAGCAAATTTTACCTCGTTGGTATCATCAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGc > 2:417999/1‑139 (MQ=255) aTTGATACTCCACATCAAGGTCAAACAACGGTCAATTTTTCAGCGCAAGGCTGGCGGATTAGCAGCCTCAGGGAGCAAATTTTACCTCGTTGGTATCATCAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGc > 2:1467383/1‑139 (MQ=255) aTTGATACTCCACATCAAGGTCAAACAACGGTCAATTTTTCAGCGCAAGGCTGGCGGATTAGCAGCCTCAGGGAGCAAATTTTACCTCGTTGGTATCATCAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGc > 1:277373/1‑139 (MQ=255) aCTCCACATCAAGGTCAAACAACGGTCAATTTTTCAGCGCAAGGCTGGCGGATTAGCAGCCTCAGGGAGCAAATTTTACCTCGTTGGTATCATCAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTAt > 2:1205420/1‑139 (MQ=255) cTCCACATCAAGGTCAAACAACGGTCAATTTTTCAGCGCAAGGCTGGCGGATTAGCAGCCTCAGGGAGCAAATTTTACCTCGTTGGTATCATCAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTAtt < 2:1221548/139‑1 (MQ=255) cacaTCAAGGTCAAACAACGGTCAATTTTTCAGCGCAAGGCTGGCGGATTAGCAGCCTCAGGGAGCAAATTTTACCTCGTTGGTATCATCAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTca > 1:1445305/1‑139 (MQ=255) aaaCAACGGTCAATTTTTCAGCGCAAGGCTGGCGGATTAGCAGCCTCAGGGAGCAAATTTTACCTCGTTGGTATCATCAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGt > 1:656382/1‑139 (MQ=255) acaacGGTCAATTTTTCAGCGCAAGGCTGGCGGATTAGCAGCCTCAGGGAGCAAATTTTACCTCGTTGGTATCATCAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGttt > 2:1401671/1‑139 (MQ=255) cGGTCAATTTTTCAGCGCAAGGCTGGCGGATTAGCAGCCTCAGGGAGCAAATTTTACCTCGTTGGTATCATCAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTg > 2:1106385/1‑139 (MQ=255) ggTCAATTTTTCAGCGCAAGGCTGGCGGATTAGCAGCCTCAGGGAGCAAATTTTACCTCGTTGGTATCATCAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGa > 2:878834/1‑139 (MQ=255) gTCAATTTTTCAGCGCAAGGCTGGCGGATTAGCAGCCTCAGGGAGCAAATTTTACCTCGTTGGTATCATCAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTgg > 1:145567/1‑130 (MQ=255) gTCAATTTTTCAGCGCAAGGCTGGCGGATTAGCAGCCTCAGGGAGCAAATTTTACCTCGTTGGTATCATCAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTgg < 2:145567/130‑1 (MQ=255) gTCAATTTTTCAGCGCAAGGCTGGCGGATTAGCAGCCTCAGGGAGCAAATTTTACCTCGTTGGTATCATCAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGaa > 1:1565124/1‑139 (MQ=255) gTCAATTTTTCAGCGCAAGGCTGGCGGATTAGCAGCCTCAGGGAGCAAATTTTACCTCGTTGGTATCATCAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGaa < 1:417999/139‑1 (MQ=255) aTTTTTCAGCGCAAGGCTGGCGGATTAGCAGCCTCAGGGAGCAAATTTTACCTCGTTGGTATCATCAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCa < 2:491050/139‑1 (MQ=255) tttttCAGCGCAAGGCTGGCGGATTAGCAGCCTCAGGGAGCAAATTTTACCTCGTTGGTATCATCAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCAt < 2:255948/139‑1 (MQ=255) gcAAGGCTGGCGGATTAGCAGCCTCAGGGAGCAAATTTTACCTCGTTGGTATCATCAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACaaa < 1:981223/139‑1 (MQ=255) gcAAGGCTGGCGGATTAGCAGCCTCAGGGAGCAAATTTTACCTCGTTGGTATCATCAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACaaa < 1:1106385/139‑1 (MQ=255) cAAGGCTGGCGGATTAGCAGCCTCAGGGAGCAAATTTTACCTCGTTGGTATCATCAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACAAAg < 2:1445305/139‑1 (MQ=255) aaGGCTGGCGGATTAGCAGCCTCAGGGAGCAAATTTTACCTCGTTGGTATCATCAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACAAAGa < 1:1205420/139‑1 (MQ=255) gCGGATTAGCAGCCTCAGGGAGCAAATTTTACCTCGTTGGTATCATCAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACAAAGATctctct < 2:1565124/139‑1 (MQ=255) gATTAGCAGCCTCAGGGAGCAAATTTTACCTCGTTGGTATCATCAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACAAAGATCTCTCTACg < 1:1401671/139‑1 (MQ=255) cTCAGGGAGCAAATTTTACCTCGTTGGTATCATCAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACAAAg < 1:540175/118‑1 (MQ=255) cTCAGGGAGCAAATTTTACCTCGTTGGTATCATCAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACAAAg > 2:540175/1‑118 (MQ=255) tCAGGGAGCAAATTTTACCTCGTTGGTATCATCAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAatat > 1:1172926/1‑70 (MQ=255) tCAGGGAGCAAATTTTACCTCGTTGGTATCATCAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAatat < 2:1172926/70‑1 (MQ=255) tCAGGGAGCAAATTTTACCTCGTTGGTATCATCAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACAAAGATCTCTCTACGTGGCAGACAtt > 1:448201/1‑139 (MQ=255) cAAATTTTACCTCGTTGGTATCATCAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACAAAGATCTCTCTACGTGGCAGACATTCCGCCGAc > 1:794466/1‑139 (MQ=255) cAAATTTTACCTCGTTGGTATCATCAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACAAAGATCTCTCTACGTGGCAGACATTCCGCCGAc < 1:1467383/139‑1 (MQ=255) cAAATTTTACCTCGTTGGTATCATCAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACAAAGATCTCTCTACGTGGCAGACATTCCGCCGAc > 1:454424/1‑139 (MQ=255) aaaTTTTACCTCGTTGGTATCATCAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACAAAGATCTCTCTACGTGGCAGACATTCCGCCGACt < 2:277373/139‑1 (MQ=255) ttttACCTCGTTGGTATCATCAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCt > 1:1265920/1‑79 (MQ=255) ttttACCTCGTTGGTATCATCAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCt < 2:1265920/79‑1 (MQ=255) ttttACCTCGTTGGTATCATCAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACAAAGATCTCTCTACGTGGCAGACATTCCGCCGACtgtg < 2:454424/139‑1 (MQ=255) tACCTCGTTGGTATCATCAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACAAAGATCTCTCTACGTGGCAGACATTCCGCCGACTGTGGcc < 1:82507/139‑1 (MQ=255) atcatcAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACAAAGATCTCTCTACGTGGCAGACATTCCGCCGACTGTGGCCAACCATTgcg > 1:748568/1‑137 (MQ=255) atcatcAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACAAAGATCTCTCTACGTGGCAGACATTCCGCCGACTGTGGCCAACCATTgcg < 2:748568/137‑1 (MQ=255) atcatcAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACAAAGATCTCTCTACGTGGCAGACATTCCGCCGACTGTGGCCAACCATTGCGcc > 1:592801/1‑139 (MQ=255) tcaGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACAAAGATCTCTCTACGTGGCAGACATTCCGCCGACTGTGGCCAACCATTGCGCCTTTc > 1:17527/1‑139 (MQ=255) caGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACAAAGATCTCTCTACGTGGCAGACATTCCGCCGACTGTGGCCAACCATTGCGCCTTTCa < 2:794466/139‑1 (MQ=255) aGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACAAAGATCTCTCTACGTGGCAGACATTCCGCCGACTGTGGCCAACCATTGCGCCTTTCaa > 1:1135142/1‑139 (MQ=255) aGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACAAAGATCTCTCTACGTGGCAGACATTCCGCCGACTGTGGCCAACCATTGCGCCTTTCaa > 1:724707/1‑139 (MQ=255) gTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACAAAGATCTCTCTACGTGGCAGACATTCCGCCGACTGTGGCCAACCATTGCGCCTTTCaaa < 1:629455/139‑1 (MQ=255) tGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACaa < 2:703417/80‑1 (MQ=255) tGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACaa > 1:703417/1‑80 (MQ=255) tGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACAAAg < 2:698251/82‑1 (MQ=255) tGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACAAAg > 1:698251/1‑82 (MQ=255) tGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACAAAGATCTCTCTACGTGGCAGACATTCCGCCGACTGTGGCCAACCATTGCGCCTTTCAAAg > 2:1277433/1‑139 (MQ=255) tGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGa > 1:711840/1‑61 (MQ=255) tGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGa > 2:772305/1‑61 (MQ=255) tGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGa < 2:711840/61‑1 (MQ=255) tGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGa < 1:772305/61‑1 (MQ=255) tGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACAAAGAt > 2:275861/1‑79 (MQ=255) tGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACAAAGAt < 1:275861/79‑1 (MQ=255) tGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACAAAGATCTCTCTACGTGGCAGACATTCCGCCGACtgtg < 2:383924/111‑1 (MQ=255) tGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACAAAGATCTCTCTACGTGGCAGACATTCCGCCGACtgtg > 1:383924/1‑111 (MQ=255) tGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACAAAGATCTCTCTACGTGGCAGACATTCCGCCGACTGTGGCCAACCATTGCGCCTTTCAAAGCGGGt > 2:726682/1‑139 (MQ=255) tGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTACAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACAAAGATCTCTCTACGTGGCAGACATTCCGCCGACTGTGGCCAGCCATTGCGCCTTTCAAAGCGGGt > 1:1063012/1‑139 (MQ=255) ccAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACaa > 2:188411/1‑68 (MQ=255) ccAGTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACaa < 1:188411/68‑1 (MQ=255) ggggATAACCGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACAAAGATCTCTCTACGTGGCAGACATTCCGCCGACTGTGGCCAACCATTGCGCCTTTCAAAGCGGGTCTGATCGTgg < 1:949545/137‑1 (MQ=255) gTGGATAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACAAAGATCTCTCTACGTGGCAGACATTCCGCCGACTGTGGCCAACCATTGCGCCTTTCAAAGCGGGTCTGATCGTgg < 2:724707/139‑1 (MQ=255) aTAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACAAAGATCTCTCTACGTGGCAGACATTCCGCCGACTGTGGCCAACCATTGCGCCTTTCAAAGCGGGTCTGATCGTggcggg < 2:1063012/139‑1 (MQ=255) tAACGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACAAAGATCTCTCTACGTGGCAGACATTCCGCCGACTGTGGCCAACCATTGCGCCTTTCAAAGCGGGTCTGATCGTggcgggc < 2:656382/139‑1 (MQ=255) aaCGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACAAAGATCTCTCTACGTGGCAGACATTCCGCCGACTGTGGCCAACCATTGCGCCTTTCAAAGCGGGTCTGATCGTggcgggcg > 2:788322/1‑139 (MQ=255) aCGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACAAAGATCTCTCTACGTGGCAGACATTCCGCCGACTGTGGCCAACCATTGCGCCTTTCAAAGCGGGTCTGATCGTGGCGGGCGt > 2:184386/1‑139 (MQ=255) aCGGGTAAAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACAAAGATCTCTCTACGTGGCAGACATTCCGCCGACTGTGGCCAACCATTGCGCCTTTCAAAGCGGGTCTGATCGTGGCGGGCGt < 2:1583781/139‑1 (MQ=255) | GGATTGATACTCCACATCAAGGTCAAACAACGGTCAATTTTTCAGCGCAAGGCTGGCGGATTAGCAGCCTCAGGGAGCAAATTTTACCTCGTTGGTATCATCAGTGGTTTGGCGTGCCAGTGGATAACGGGTAGAATATGCGGCTATTTCAACAAATGCTGGTTTTTTGAATGCATAACGACAAAGATCTCTCTACGTGGCAGACATTCCGCCGACTGTGGCCAACCATTGCGCCTTTCAAAGCGGGTCTGATCGTGGCGGGCGT > NC_000913/966451‑966715 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |