| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,119,307 | C→T | *47* (TAG→TAA) | yceO ← | uncharacterized protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,119,307 | 0 | C | T | 100.0% | 235.2 / NA | 73 | *47* (TAG→TAA) | yceO | uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (37/36); total (37/36) | |||||||||||
CATAAGTTTAGTGGGTTCAGCATCAGAGATGTCTGGTGAGTGCTGTAGAAGCAGGAATAATCTCATTCAATTTTTCACGCTAAATGAAAGGGAGATTAAATATTTGTCAGTTTATGTCAGTGCGGAAAACTAAAAATAAAACACATAGATCAGATCCATAATTGCCAACAATCCCCAGAGAAAAAGATAAAGCATCAGATGCTCGCGAATATTATTGATGAGATAGTGCAACAGCCGACGCATTAAATACTCCTGTAAA > NC_000913/1119178‑1119436 | cATAAGTTTAGTGGGTTCAGCATCAGAGATGTCTGGTGAGTGCTGTAGAAGCAGGAATAATCTCATTCAATTTTTCACGCTAAATGAAAGGGAGATTAAATATTTGTCAGTTTATGTCAGTGCGGAAAATTAAAAATaa > 2:446426/1‑139 (MQ=255)cATAAGTTTAGTGGGTTCAGCATCAGAGATGTCTGGTGAGTGCTGTAGAAGCAGGAATAATCTCATTCAATTTTTCACGCTAAATGAAAGGGAGATTAAATATTTGTCAGTTTATGTCAGTGCGGAAAATTAAAAATaa > 2:458586/1‑139 (MQ=255) aTAAGTTTAGTGGGTTCAGCATCAGAGATGTCTGGTGAGTGCTGTAGAAGCAGGAATAATCTCATTCAATTTTTCACGCTAAATGAAAGGGAGATTAAATATTTGTCAGTTTATGTCAGTGCGGAAAATTAAAAATaaa < 2:1313733/139‑1 (MQ=255) tttAGTGGGTTCAGCATCAGAGATGTCTGGTGAGTGCTGTAGAAGCAGGAATAATCTCATTCAATTTTTCACGCTAAATGAAAGGGAGATTAAATATTTGTCAGTTTATGTCAGTGCGGAAAATTAAAAATAAAAcaca < 1:1547187/139‑1 (MQ=255) 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2:519859/1‑139 (MQ=255) aCGCTAAATGAAAGGGAGATTAAATATTTGTCAGTTTATGTCAGTGCGGAAAATTAAAAATAAAACACATAGATCAGATCCATAATTGCCAACAATCCCCAGAGAAAAAGATAAAGAATAAGAAGATCGCGAAtattat > 2:379463/1‑139 (MQ=255) tAAATGAAAGGGAGATTAAATATTTGTCAGTTTATGTCAGTGCGGAAAATTAAAAATAAAACACATAGATCAGATCCATAATTGCCAACAATCCCCAGAGAAAAAGATAAAGCATCAGATGCTCGCGaa < 1:1440871/129‑1 (MQ=255) tAAATGAAAGGGAGATTAAATATTTGTCAGTTTATGTCAGTGCGGAAAATTAAAAATAAAACACATAGATCAGATCCATAATTGCCAACAATCCCCAGAGAAAAAGATAAAGCATCAGATGCTCGCGaa > 2:1440871/1‑129 (MQ=255) agaTTAAATATTTGTCAGTTTATGTCAGTGCGGAAAATTAAAAATAAAACACATAGATCAGATCCATAAtt > 2:5091/1‑71 (MQ=255) agaTTAAATATTTGTCAGTTTATGTCAGTGCGGAAAATTAAAAATAAAACACATAGATCAGATCCATAAtt < 1:5091/71‑1 (MQ=255) agaTTAAATATTTGTCAGTTTATGTCAGTGCGGAAAATTAAAAATAAAACACATAGATCAGATCCATAATTGCCAACAATCCCCAGAGAAAAAGATAAAGCATCAGa > 2:1020889/1‑107 (MQ=255) agaTTAAATATTTGTCAGTTTATGTCAGTGCGGAAAATTAAAAATAAAACACATAGATCAGATCCATAATTGCCAACAATCCCCAGAGAAAAAGATAAAGCATCAGa < 1:1020889/107‑1 (MQ=255) 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ttGTCAGTTTATGTCAGTGCGGAAAATTAAAAATAAAACACATAGATCAGATCCATAATTGCCAACAATCCCCAGAGAAAAAGATAAAGCATCAGATGCTCGCGAATATTATTGATGAGATAGTGCAACAGCCGACGCa < 2:665900/139‑1 (MQ=255) tGTCAGTTTATGTCAGTGCGGAAAATTAAAAATAAAAcaca > 2:968631/1‑41 (MQ=255) tGTCAGTTTATGTCAGTGCGGAAAATTAAAAATAAAAcaca < 1:968631/41‑1 (MQ=255) aGTTTATGTCAGTGCGGAAAATTAAAAATAAAACACATAGATCAGATCCATAAATGCCAACAATCCCCAGAGAAAAAGATAAAGCATCAGATGCTCGCGAATATTATTGATGAGATAGTGCAACAGCCGACGCATTaaa < 2:1111900/139‑1 (MQ=255) tttATGTCAGTGCGGAAAATTAAAAATAAAAcaca > 2:231746/1‑35 (MQ=37) tttATGTCAGTGCGGAAAATTAAAAATAAAAcaca < 1:231746/35‑1 (MQ=37) tGCGGAAAATTAAAAATAAAACACATAGATCAGATCCATAATTGCCAACAATCCCCAGAGAAAAAGATAAAg > 2:1111639/1‑72 (MQ=255) tGCGGAAAATTAAAAATAAAACACATAGATCAGATCCATAATTGCCAACAATCCCCAGAGAAAAAGATAAAg < 1:1111639/72‑1 (MQ=255) tGCGGAAAATTAAAAATAAAACACATAGATCAGATCCATAATTGCCAACAATCCCCAGAGAAAAAGATAAAGCATCAGATGCTCGCGAata > 2:1057422/1‑91 (MQ=255) tGCGGAAAATTAAAAATAAAACACATAGATCAGATCCATAATTGCCAACAATCCCCAGAGAAAAAGATAAAGCATCAGATGCTCGCGAata < 1:1057422/91‑1 (MQ=255) tGCGGAAAATTAAAAATAAAACACATAGATCAGATCCATAATTGCCAACAATCCCCAGAGAAAAAGATAAAGCATCAGATGCTCGCGAata > 1:1185202/1‑91 (MQ=255) tGCGGAAAATTAAAAATAAAACACATAGATCAGATCCATAATTGCCAACAATCCCCAGAGAAAAAGATAAAGCATCAGATGCTCGCGAata < 2:1185202/91‑1 (MQ=255) tGCGGAAAATTAAAAATAAAACACATAGATCAGATCCATAATTGCCAACAATCCCCAGAGAAAAAGATAAAGCATCAGATGCTCGCGAATATTATTGATGAGATAGTGCAACAGCCg < 2:1242499/117‑1 (MQ=255) tGCGGAAAATTAAAAATAAAACACATAGATCAGATCCATAATTGCCAACAATCCCCAGAGAAAAAGATAAAGCATCAGATGCTCGCGAATATTATTGATGAGATAGTGCAACAGCCg > 1:1242499/1‑117 (MQ=255) tGCGGAAAATTAAAAATAAAACACATAGATCAGATCCATAATTGCCAACAATCCCCAGAGAAAAAGATAAAGCATCAGATGCTCGCGAATATTATTGATGAGATAGTGCAACAGCCGACGCATTAAATACTCCTGTaaa > 2:42663/1‑139 (MQ=255) tGCGGAAAATTAAAAATAAAACACATAGATCAGATCCATAATTGCCAACAATCCCCAGAGAAAAAGATAAAGCATCAGATGCTCGCGAATATTATTGATGAGATAGTGCAACAGCCGACGCATTAAATACTCCTGTaaa > 2:19537/1‑139 (MQ=255) tGCGGAAAATTAAAAATAAAACACATAGATCAGATCCATAATTGCCAACAATCCCCAGAGAAAAAGATAAAGCATCAGATGCTCGCGAATATTATTGATGAGATAGTGCAACAGCCAACGCATTAAATACTCCAGTaaa > 1:206283/1‑139 (MQ=255) | CATAAGTTTAGTGGGTTCAGCATCAGAGATGTCTGGTGAGTGCTGTAGAAGCAGGAATAATCTCATTCAATTTTTCACGCTAAATGAAAGGGAGATTAAATATTTGTCAGTTTATGTCAGTGCGGAAAACTAAAAATAAAACACATAGATCAGATCCATAATTGCCAACAATCCCCAGAGAAAAAGATAAAGCATCAGATGCTCGCGAATATTATTGATGAGATAGTGCAACAGCCGACGCATTAAATACTCCTGTAAA > NC_000913/1119178‑1119436 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |